- Разное

Катушки салмо отзывы: Катушки Salmo отзывы

Содержание

Катушки Salmo отзывы

Хочу рассказать о своём опыте использования катушек «Salmo», а он у меня довольно большой. Так уж сложилось, что с детства был неравнодушен к продукции этой фирмы, ещё со времён знаменитого латвийского кооператива. В те годы, он, правда, катушки ещё не выпускал; они появились позднее. Потом была путаница с латвийским и польским производителем, разными заводами-изготовителями и, как результат — покупка нескольких катушек в течение 10 лет.

Описывать их стоимостью 10 долларов не вижу смысла — принципиально они ни чем не отличаются от подобных изделий марок «Кобра», «Квин Хин», «Юдай» и пр. Для новичков, туристов и трофеев весом до 1 кг вполне годятся. Рассказать хочу о двух более серьёзных вариантах, которые есть у меня.

Одна из них — Salmo Grand Confidence. Очень и очень приличная катушка из ценовой категории «стодолларовых», хотя, претендует, как будто бы на принадлежность к классу «элитных». Меня эти условности мало волнуют, а вот катушка вполне устраивает.

Корпус — карбон, прочный и лёгкий, алюминиевая шпуля, (запасная — тоже), ротор из лёгкого сплава. Для своего 3000-го класса кажется непривычно лёгкой. Весит менее 250 граммов. Дужка лесоукладывателя просто неубиваемая. Вообще, на материалах производитель не сэкономил: как выяснилось, даже подшипники — из нержавейки. Диаметр шпули всего — 55 мм! В самый раз, у меня 150 метров шнура 1,2 lb входит как раз.

Катушка тестировалась мною буквально в экстремальных условиях — при морозе 10-15 градусов. И никаких проблем не было. Ловил с удилищем Шимано, приманки использовал весом до 25 граммов. В общем, нормально. Укладка — ровная. Люфт если и есть, то малозаметный. Стопор срабатывает мгновенно, в работе катушка сильно не шумит. В общем, придраться, если уж так, по-серьезному не к чему. Надёжная качественная вещь.

Вторая — Salmo Diamond CARP RUNNER 40BR, ее я использую для фидерной ловли. Она достаточно мощная, вмещает 100 метров лески диаметром 0,4, весит под 400 граммов. Хорошо балансируется с удилищем. Шпуля и рукоятка — алюминиевые. Запасная шпуля — пластик. Система «CARP RUNNER», как ни странно, реально работает — при вращении рукоятки сразу включается передний фрикицион и система стравливания лески в зависимости от веса рыбы. Антиреверс имеет флажковый выключатель. Таскал ей приличных карпов и лещей. Особых нареканий не возникало. В работе проста и надёжна. Правда, качество материалов не такое, как у предыдущей.

Из недостатков отмечу также слабоватую шпулю. Думаю, если использовать не монофил, как я, а плетёнку, надолго шпули не хватит. Так же есть субъективное подозрение, что шнур будет перетираться роликом. Но ведь и стоит она втрое дешевле – в районе 35 долларов. Для серьёзной ловли карпа подобрать хорошую катушку по такой цене не так просто.

В заключении хочу сказать, что у данного самая широкая линейка, которая, к тому же, регулярно обновляется новыми, «флагманскими» моделями. Так что и новичок, и искушенный рыболов смогут подобрать себе подходящую.

Катушки Salmo — отзывы.

Негативные, нейтральные и положительные отзывы

Sergey Naychuk

https://rozetka.com.ua/salmo_diamond_baitfeeder_7450br/p216496/comments/

Честно говоря, разочарован. Покупал не здесь, а в Киеве 2 года назад. Использовал не так уж часто. Со временем ролик лесоукладывателя начал паразитно шуметь, плавность хода пропала, укладка стала неровной. В связи с этим пользоваться стало невозможно — на каждом забросе бороды, испортил кучу метров шнура. Одно радует — шнур старый и бюджетный.

Безенчук

http://rybolov.ee/forum/index.php?topic=2897.0

А у меня был только отрицательный опыт, первая катуха развалилась прямо в руках при вываживании щупака на пару кил на Курема. Второй случай был когда после заброса я начал было крутить, а фиг там, отвалилась дужка и ручка. Может сейчас конечно и получше их стали делать, но я лучше возьму дешевую шиману, типа Catana или Nexave.

shargon

http://rybolov. ee/forum/index.php?topic=2897.0

Не помню модель, стоила 48 евро, 4000 с экстренным спуском. И тоже мотает конусом. гуано катушки. Купил батьку на леща, вот теперь тоже не знаю, что делать, гарантия вроде как есть ещё.

ioan87petrov

http://otzovik.com/review_1978858.html

Меня заинтересовала из каталога Salmo Катушка безынерционная Salmo Elite FUTURE 5+1 20FD Найти данную катушку не составило проблем для меня, правда купил ее чуть дороже чем ценник на официальном сайте Salmo.

В прошлое лето я с ней отрыбачил довольно много, проверил работу этой катушки как с нейлоновой леской так и с плетеным шнуром.

Со шнуром катушка показала себя хуже, чем с леской, время от времени образовывались петли на шпуле катушки, которые при забросе превращались в большую бороду. С леской таких проблем не возникало не разу. Никаких лишних шумов в катушке не было, ничего не ломалось, работает как новая.

hanas-den

http://otzovik. com/review_1991650.html

Я относительно недавно начал заниматься ловлей хищника на джиг. Тем не менее, за это время сменил более пяти комплектов палка+катушка. Поэтому у меня есть практический опыт. И пишу то, что испытал на собственной шкуре)))

Данная катушка досталась мне в паре с лайтовым удилищем норстрим крокодайл. Брал с рук за две с половиной. И считаю, что комплект полностью оправдал затраченные средства.

Для начинающих джиговую ловлю рыболовов эта катушка отлично подойдёт. Она отлично составляет баланс с лайтовым удилищем. Аллюминиевая шпуля сбалансирована. При проводке вибрация практически отсутствует. За время использования у меня было всего несколько захлестов шнура. Есть люди, которые говорят о ней отрицательно. Возможно потому, что слишком много требуют от средней по стоимости, и по качеству модели! И, кстати, при использовании шнура 0, 18 мм санлайн и имитации рачка от лаки Джон с грузом 8 грамм у меня были максимальные забросе более шестидесяти метров!

Минус данной катушки для меня это, в первую очередь, фрикцион.

В начале рыбалки настроил на один вес, в конце настройки сбились… Второй минус — несмотря на среднюю стоимость, материалы катушки не слишком прочны: при рыбалке на каменистой гряде упустил палку… А пострадала катушка — откололся кусочек от пластмассовой шпули. Но это мелочи.

В целом хороший вариант для человека, не желающего тратить большие деньги, но при этом научиться ловить хищника на джиг!

Black Angel

http://spinning.kharkov.ua/phpbb/viewtopic.php?t=12228

По большому счету покупка катушек и спиннингов от Salmo — лоторея!

Кому как повезет. Сам являюсь счастливым владельцем катушки Salmo Elite Mini 7225 FD c 2006 года, товарищ себе взял комплект спиннинг SALMO ELITE ATTACK XM и катушку под него SALMO Grand Synchro 7525 FD но это было в 2008 году, тоже ловит им по сей день, и ни на что менять не собираеться, а вот другим моим товарищам не повезло катушки сыпались даже не доживая до конца сезона, у некоторых спиннигов разлазилась на бланке рукоятка, ломались и на забросе, и на рыбе. Много я «не злых, тихих» слов услышал в свой адресс, так что еще раз скажу продукция от Salmo — лоторея!

zander

http://blesna.net/forum/threads/%D0%9A%D0%B0%D1%82%D1%83%D1%88%D0%BA%D0%B8-salmo-%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%B8%D0%BD%D0%BA%D0%B8-%D1%8D%D0%BA%D1%81%D0%BF%D0%BB%D1%83%D0%B0%D1%82%D0%B0%D1%86%D0%B8%D1%8F-%D0%B8-%D0%BE%D1%82%D0%B7%D1%8B%D0%B2%D1%8B. 270/page-2#post-4618

У меня долгое время стояла салмовская катушка на фидере. Претензий к ней у меня не было. На спиннинг поставить не рискую. Рывковая техника предполагает качественную катушку. Я не хочу сказать, что салмо плохие, я в них не верю.

KsuSkurtu

http://otzovik.com/review_2361790.html

Начнём с минусов:

  • с плетёной леской полный кошмар.

А теперь плюсы:

  • катушка идёт плавно
  • наматывается немало лески
  • удобная
  • практичная
  • стоимость невысока в пределах нормы.

Ну всё таки как катушка попала ко мне — Я пришёл в магазин за снастями такими как поплавки и т. д ну так вот и бросается мне в глаза эта катушка я с горяча купил её, но при этом она меня не разочаровала, а даже наоборот превзашла мои ожидания поймал 3 щуки по 12 кг всем рекомендую это незаменимый помощник в выуживании трофейных рыб.

СергейР

http://blesna.net/forum/threads/%D0%9A%D0%B0%D1%82%D1%83%D1%88%D0%BA%D0%B8-salmo-%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%B8%D0%BD%D0%BA%D0%B8-%D1%8D%D0%BA%D1%81%D0%BF%D0%BB%D1%83%D0%B0%D1%82%D0%B0%D1%86%D0%B8%D1%8F-%D0%B8-%D0%BE%D1%82%D0%B7%D1%8B%D0%B2%D1%8B. 270/page-2#post-6949

Лично я пользуюсь катушкой Salmo DIAMOND TROLL M5300/4300. Мощная качественная мультипликаторная катушка предназначена для троллинга, ловли взаброс и в отвес крупными приманками, а также на донные снасти. Для заброса шпуля отключается переключением рычага. Силовой механизм автоматически включается

поворотом рукоятки катушки.

Вадим Викторович

http://blesna.net/forum/threads/%D0%9A%D0%B0%D1%82%D1%83%D1%88%D0%BA%D0%B8-salmo-%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%B8%D0%BD%D0%BA%D0%B8-%D1%8D%D0%BA%D1%81%D0%BF%D0%BB%D1%83%D0%B0%D1%82%D0%B0%D1%86%D0%B8%D1%8F-%D0%B8-%D0%BE%D1%82%D0%B7%D1%8B%D0%B2%D1%8B. 270/page-2#post-12471

Китай конечно же разочаровывает во многом, но эти узкоглазые молодцы пересадили нас на мотоблоки, тракторы и мопеды. А теперь к теме. У меня на спиннинге стоит Salmo Elite Exelence 10430 FD. Подшипников 9+1 и две шпули про запас. Купил в мае 2006 года за 210 грн. (42 доллара по тем временам), на коробке (сохранилась) штрих-код Латвии. Прошла «Крым и Рим», но… Мокла только под дождём, ни разу не купалась и с песком не знакома, не бита, не крашена, хранение гаражное. Ни разу не разбирал и не смазывал. Работает КАК ЧАСИКИ!!! Нигде никакого люфта, ни скрипа, ни стона или визга. КАК НОВАЯ!!! Безмерно благодарен создателям сего шедевра!

Дмитрий Н

http://feeder. webtalk.ru/viewtopic.php?id=9166

Являюсь счастливым обладателем двух катушек от салмо.

Первая SALMO Diamond feeder 5150 fd -Опытным путём была определенна мной на самую тяжелую работу с довольно толстыми лесками от 0. 25 и выше. С чем успешно справляется уже пол сезона)))

Вторая SALMO Elite feeder 8 — Предназначил её для деликатной рыбалки с леской от 0, 22 и ниже и тонкими шнурами. Тоже не подводит, тьфу, тьфу, тьфу)))

При покупке смущала сверх доступная цена))) Нас же так настойчиво учат что качество не может быть дешевым))) Оказалось может…)))

edgard

http://feeder.webtalk.ru/viewtopic.php?id=9166

Являюсь владельцем Salmo diamond BaitFEEDER в 6000 размере. Год работает, и ни каких признаков издыхания не наблюдается. В общем надежность за свои деньги весьма удовлитворителна… коничность шпули вылечил бекингом, а вот все время откручующийся винт фиксации … ээээээ… «ручки вращения» (деталь 41 на схеме) ну достает. и еще: не нравится мне как катушка укладывает шнур, очень коряво укладывает. НО !!!! за те деньги можно сильно и не пристебыватся к этой особенности. КАТУШКА РАБОТАЕТ!!!

AlexMUA

http://feeder.webtalk.ru/viewtopic.php?id=9166

Не знаю как сейчас качество, но лет пять назад подарил дружбану катуху Salmo ELITE QUICKRUNNER 50. Так он с ней оказывается все 5 лет на рыбалки и прокатался. У нас на Донце и Печенегах веса до 50 грамм, так же был 5 раз на Днепре по неделе (веса 100+). Вобщем недавно я узнал, что он ее ни разу не вскрывал и ТО не делал. Забрал, вскрыл…. Все сухое после пяти лет, но вот меня поразила ГП. Материал как у Дайвы Брадии и за все это время выработки не видно вообще, хотя непонятно сколько эта катуха насухую крутилась. Правда корпус у нее уже явно не презентабельный, зато нутрянка отличная.

Poloten4ik

Pin Posts

У меня была катушка Salmo Elite Diamond (или как-то так). Выиграл когда-то на соревнованиях. В течении 3 лет служила отличным мотовилом, т. к. в комплекте было аж  3 (! ) шпули. Очень быстро удавалось перематывать шнуры для своих катушек. Можно даже было сматывать в несколько слоев, т. к. к счастью шпуля оказалась очень вместительной. Грохот от люфтов стоял на всю квартиру, когда я перематывал шнуры. Но в принципе, сбоев в перематывании лесок не наблюдалось. Всем рекомендую — очень удобный артефакт.

regina

http://rybolov.ee/forum/index.php?topic=2897.0

В этом году купила себе две катушки фирмы SALMO. Одну из них-Diamond carp runner  c системой байтраннер поставила на фидер. Решила, что с моими постоянными ночными рыбалками  мне такая пригодится. Впечатление от катушки хорошее, хотя байтраннером еще не пользовалась. Леску, шнур укладывает нормально. Отловив с этой катушкой несколько довольно длительных рыбалок я осталась ей довольна. О другой пока ничего сказать не могу , еще не испытала.

Обзор катушки для фидера Salmo Diamond Feeder 5 4000FD. Первые впечатления — bdn на Scorum

Предлагаю вам небольшой обзор с реальными фото новинки 2020 года — безынерционной фидерной катушки Salmo Diamond Feeder 5 4000FD.

Недавно компания Salmo презентовала свой новый летний каталог рыболовных снастей на 2020 год. В обширном ассортименте нашлось место и для нескольких новых моделей безынерционных катушек, ориентированных на фидерную ловлю.

Месяц назад я приобрел себе второе фидерное удилище и одновременно с этим событием резонно встал вопрос о покупке новой катушки к нему. После продолжительных поисков и мониторинга рынка мой выбор пал на бюджетную модель Salmo Diamond Feeder 5 из нового каталога компании — привлекли ее заявленные возможности, внешний вид и планируемая стоимость. Проблема заключалась лишь в том, что на момент принятия мною решения этой катушки еще не было в розничной продаже.

И вот буквально несколько недель назад модель появилась таки в Минске. Я сразу же поехал в свой любимый рыболовный магазин и купил две (решив заодно обновить катушку и на старом фидере).

Сегодня я предлагаю вашему вниманию небольшой обзор новой фидерной катушки Salmo Diamond Feeder 5. Так как на момент написания этой статьи в интернете до сих пор крайне мало информации, реальных фото и отзывов про эту новинку, то я надеюсь, что моя публикация сможет немного удовлетворить возможную заинтересованность читателей в этой модели.

Основная информация

Производитель позиционирует свою новинку, как фидерную катушку, то есть для ловли на фидерные удилища и оснастки, что собственно и отражено в ее названии — Diamond Feeder 5. Какие же именно характеристики этой модели мы можем отметить, которые бы подтвердили заявленную производителем позицию?

В первую очередь это крупный размерный ряд (4000, 5000 и 6000), низкопрофильная шпуля, круглая подпружиненая клипса, а также соответствующая для фидерных катушек тяговитость.

Что же обещает нам производитель? Вот основная информация о катушке Diamond Feeder 5 взятая из каталога Salmo:

Мощная катушка для ловли рыбы на донные оснастки. Характеризуется хорошей намоткой плетеного шнура на шпулю, клипса не режет шнур, хорошим качеством сборки и балансировки, небольшим весом и конкурентной ценой.

  • Тормоз фрикционный передний FD 
  • 4 подшипника шариковых
  • 1 подшипник роликовый
  • Мгновенный стопор обратного хода (антиреверс)
  • Выключатель антиреверса флажковый нижний
  • Качественный механизм привода: латунь — бронза
  • Корпус и ротор карбопластовые
  • Шпуля алюминиевая облегченная
  • Дужка лесоукладывателя полая прочная (облегченная)
  • Ролик лесоукладывателя конусный увеличенный (противозакручиватель)
  • Рукоятка алюминиевая механически обработанная с винтовым типом фиксации (право/левосторонняя установка)
  • Ручка (кноб) эргономическая из материала EVA
  • Высококачественная балансировка

Остановимся и ниже рассмотрим большинство элементов подробнее. Так как я приобрел себе две 4000-е катушки, то логично, что и обзор в этой статье будет преимущественно про них.

Основные характеристики

Заявленный производителем вес катушки в размере 4000 — 290 грамм, 5000 — 350 грамм и 6000 — 380 грамм. Реальный вес моей 4000-й катушки оказался 279 грамм.

Заявленная вместимость шпули: 150 метров ∅0,25 мм для размера 4000, 110 метров ∅0,30 мм для размера 5000 и 110 метров ∅0,35 мм для размера 6000.

Передаточное число для всего модельного ряда — 5,1:1.

Реальный диаметр шпули в размере 4000 — 48,7 мм (по наружному краю бортика) и 40,0 мм (под плетенку). Вес шпули — 63 грамма. В угоду удешевления конечной стоимости, запасной шпули к этим катушкам производителем не предусмотрено.

Внешний вид и детали

В начале не могу не сказать пару слов об (внезапно) упаковке, а точнее об одном нюансе информации на ней. На коробке изображено, что в комплекте идет запасная графитовая шпуля, но, как мы уже знаем, это не так. Почему производитель пропустил такой недочет дизайна коробки, лично для меня осталось загадкой.

В Salmo Diamond Feeder 5 запасной шпули не предусмотрено

А теперь непосредственно к катушке. Ее экстерьер лаконичный, но в тоже время стильный и, я бы даже сказал, элегантный. Корпус имеет приятный синий цвет со вставками под темный глянцевый геманит (схожий цвет имеет и шпуля).

Если сравнивать сделанное мною реальное фото катушки и картинку из каталога (которая на данный момент и фигурирует во всех интернет-магазинах), то в первую очередь бросается в глаза, что кноб у демонстрационного экземпляра из округлого превратился в скошенный под пальцы. Ну и появились необходимые информационные надписи на шпуле.

Образец из каталога (слева) и серийная модель (справа)

Шпуля алюминиевая низкопрофильная. Это сразу отменяет необходимость применения дополнительного бэккинга под тонкие плетеные шнуры, что зачастую приходится делать на шпулях обычного не низкого профиля.

Ролик лесоукладывателя. Комплектуется подшипником. По заявлениям производителя умеет корректно работать с тонкими плетенками, что обеспечивает их ровную укладку на шпулю.

Всего же катушка имеет 5 подшипников. Четыре шариковых подшипника легко находятся по сборочной схеме (21, 32, 41 и 43). Пятый роликовый подшипник — это обгонная муфта (34).

Сборочная схема катушки Salmo Diamond Feeder 5 (скан вкладыша из коробки)

Кноб эргономичный из плотного EVA. На ощупь приятный. Насколько практичный — покажет время.

Ручка алюминиевая с классическим винтовым механизмом фиксации и возможностью установить ее под вращение как правой, так и левой рукой.

Производитель заявляет, что главная пара катушки (ведомая и ведущая шестерни) имеет увеличенный размер, что и позволяет ей создавать необходимую для ловли на фидер тягу (особенно в размерах 5000 и 6000).

Детали (8) и (9) не зафиксированы жестко на штоке (31), что может вызвать неудобство при снятии шпули, так как они норовят слететь со штока вниз (что и случилось со мной по незнанию) и потеряться (чего к счастью не случилось). Это минус.

Механизм дужки лесоукладывателя работает четко, хорошо фиксируясь в своих крайних положениях.

Клипса. Имеет круглую форму и подпружинена, что должно обеспечить более удобное клипсование и бережное обращение с плетенкой.

Фрикцион. Лично я всегда очень тщательно подхожу к выбору катушки именно в плане работы фрикциона. Считаю, что это тот механизм, на котором не стоит экономить и если перед покупкой мне не нравится, как работает фрикцион, то я предпочту поискать себе другую модель катушки. В первую очередь я смотрю, чтобы фрикцион не работал рывками. Если для того, чтобы сорвать шпулю с тормоза требуется приложить усилие (условно) в 2 кг, а для того, чтобы продолжить ее прокручивание уже будет достаточно усилия всего в 1 кг, то такую катушку лучше оставить на полке магазина. Такими фрикционными тормозами очень часто грешат катушки бюджетного класса и ниже.

Учитывая стоимость рассматриваемой катушки, то установленный в Salmo Diamond Feeder 5 фрикционный тормоз мне понравился. Работать начинает плавно и без рывков. Также отмечу, что в этой катушке он достаточно «длинный», что должно понравится тем, кто любит настраивать фрикционный тормоз поточнее.

Бюджетный бестселлер?

На данный момент цена на модельный ряд Salmo Diamond Feeder 5 в рыболовных магазинах Минска по текущему курсу составляет приблизительно $32 за катушку размера 4000 (артикул 5040FD), $34 за катушку размера 5000 (5050FD) и $36 за катушку размера 6000 (5060FD). Стоит признать, что производителю удалось гармонично совместить в продукте приемлемое качество и его конечную стоимость.

Понятно, что окончательные выводы можно будет делать только после испытания в реальных условиях ловли на водоеме, но даже такого первичного знакомства с новой фидерной катушкой Salmo Diamond Feeder 5 было вполне достаточно, чтобы иметь все основания утверждать — модель будет востребована. Катушка имеет все шансы занять свою обширную нишу на, пока что еще мало развитом, рынке бюджетных безынерционных катушек именно для фидерной ловли.

Эту и другие модели катушек, а также огромное множество других рыболовных снастей, принадлежностей и приманок вы можете купить в рыболовном интернет-магазине Megafishing. by.

Читайте также: Стритфишинг: тестируем новый спиннинг Banax Mega и осваиваем отводной поводок в черте Минска

Отзыв о фидерной катушке Salmo Diamond Feeder 5+1 40 FD | Амурский Берег

Катушка Salmo Diamond Feeder 5+1 40 FD.
— 5 шариковых подшипников плюс 1 роликовый;
— Передаточное число 5,2:1;
— Лескоемкость 155 метров 0,3 мм монолески;
— Цены от 1790 до 2700.
Описание производителя » Мощная катушка предназначенная для ловли на донные снасти. Имеет прочный корпус и ротор из карбопласта. Основная шпуля аллюминиевая с покрытием нитрида титана. Главная передача : латунь — бронза. Тормоз фрикционный передний. Мгновенный стопор обратного хода . Включатель антиреверса флажковый нижний. Корпус карбопластовый. Дополнительная шпуля- пластиковая. Ролик лескоукладователя конусный увеличенный.»
И так, теперь мои пять копеек.
Рукоятка — аллюминиевая, с винтовым типом фиксации, с возможностью право/левосторонней установки.
Шпуля. Конусного типа. На аллюминиевую был намотан шнур диаметром 0,12 мм. Как я намучался с намоткой писать не буду,скажу лишь одно, добиться нормального уклада шнура так и не получилось, сколько и не пытался подкладывать прокладки. Данная шпуля так и пролежала без дела весь сезон. На графитовую шпулю в процессе подборки оптимального количества прокладок, была намотана монолеска в диаметре 0,2мм. Owner Broad. Вот с ней и отловил весь сезон. Хребты устранить полностью не вышло,но ловить можно,хотя жутко напрягало. Это первый минус.
Механизм. 5 шариковых поджипников справляются со своей работой прекрасно. Тяговые качества весьма хороши. Веса до 100 грамм с дальности до 35 метров выматываются на ура! Ход мягкий, без каких либо шумов.
Фрикцион. Если честно до конца в нем не разобрался. При средней затяжке срабатывал далеко не всегда. Это второй минус. Сама шпуля имеет весьма значительный люфт. Под шпулю постоянно попадает леска, что приводит просто в бешенство.
Клипса. Пластикового типа. Пришлось дорабатывать мелким напильником, имелись очень острые края. Больше одной дистанции выставить не прлучитчся,слетает. Связываю это с мелким размером самой клипсы.
Ещё что не понравилось, то что под катушку постоянно набивается корм и грязь, приходится после каждого использования все это вычищать.
Использовал данную катушку на фидерах класса медиум, в основном на соревнованиях.
Считаю своих денег она стоит, не смотря на некоторые огрехи. Сейчас на неё ловит мой друг и его все устраивает. Каких либо выдающихся трофев с ней не ловил,сказать как она ведёт себя при вываживании не могу.
Рад был если кому помог с выбором.

Катушка безынерционная Salmo Elite HEAVY JIG 8 2500FD

Salmo Elite HEAVY JIG 8 2500FD — это среднескоростная спиннинговая катушка с передним фрикционом. Идеально подходит для джиговой ловли и твичинга на крупные и тяжелые приманки. 8 подшипников этой рыболовной катушки Салмо гарантируют плавность хода. Небольшая джиговая катушка Salmo Elite HEAVY JIG 8 2500FD отлично сбалансирована. Это катушка для джига до 40 грамм. Прочный и долговечный механизм привода из латуни и бронзы допускает большие нагрузки при вываживании.

Присмотрите себе хорошую плетенку для новой катушки.

Купить катушку для спиннинга 2500 в Москве можно в магазине Смарт Фишинг.

Особенности

  • Вместимость шпули: 0,20мм-200м.
  • Передаточное число: 5.1:1
  • Фрикцион: передний
  • Подшипники: 7 шариковых и 1 роликовый подшипник
  • Корпус и ротор: карбопласт
  • Основная шпуля: алюминий (облегчённая)
  • Дополнительная шпуля: графит
  • Мгновенный стопор обратного хода (антиреверс)
  • Включатель антиреверса: флажковый нижний
  • Механизм привода: латунь-бронза (высокоточный)
  • Дужка лесоукладывателя полая прочная (облегчённая)
  • Ролик лесоукладывателя конусный увеличенный (противозакручиватель)
  • Ролик лесоукладывателя покрыт нитридом титана для износостойкости
  • Рукоятка: алюминий (механически обработанная), с винтовым типом фиксации и возможностью право/левосторонней установки
  • Кноб (ручка): резина (эргономическая)
  • Вес: 250 гр.

Это идеальная катушка для хеви джига.

Купить со скидкой безынерционную катушку Salmo Elite HEAVY JIG 8 2500FD можно в рыболовном интернет магазине Smart Fishing с доставкой в любой город.

Вместимость шпули
0,20мм — 200м
Выгружать на Яндекс маркет
Выгружать на Яндекс маркетнет
Передаточное число
5. 1:1

Новая бюджетная катушка для фидера Feeder Concept Pilot. Обзор и отзывы.

10.07.2020 Автор:Буераков В.С.

Это первая серийная катушка от компании Feeder Concept (Фидер Концепт). Говоря Фидер Концепт подразумеваем Нормунд Грабовскис, называя фамилию Грабовскис – имеем ввиду рыбную ловлю, а еще точнее фидерную ловлю. Как известно, Нормунд неоднократный чемпион мира по рыбной ловле в разных дисциплинах, а также эксперт компании Sensas (является одним из мировых лидеров по производству рыболовной прикормки), и вот в 2018 году произошло то, что должно было произойти, Нормунд Грабовскис совместно с компанией Salmo запустил линейку фидерных удилищ под своим именем, назвав бренд Feeder Concept. Нормунд подходит к своему ремеслу очень кропотливо и со знанием дела, вместе с фидерами в производство в 2018 году должна была поступить и серия новых катушек, однако судьба распорядилась так, что он забраковал всю пилотную партию своей катушки из-за неудачных клипс (они вредили леску), что весьма важно в фидерной ловле. И вот, в самом начале 2019 года изготовлена первая партия катушек имени Нормунда Грабовскиса – абсолютно новая, доработанная для фидерной ловли, практичная катушка: Feeder Concept – PILOT. Говорят – первый блин комом, и как вы поняли, ком уже был 🙂

Сразу стоит сказать, что у компании Фидер Концепт вышло сразу две фидерных катушки, однако, в данной статье речь пойдёт именно о первой, более бюджетной катушке Feeder Concept – ПИЛОТ. Вторая катушка имеет название Tournament (соревнование, турнир), её пока нет на территории России и первые отзывы о ней появятся после ближайшей рыболовной выставки.

Итак, Feeder Concept – Pilot 7 катушка выпускается в трёх размерах: 3000, 4000 и 5000. Сравнительная характеристика размеров катушки пилот от «фидер концепт» приведена в таблице:

 

Как видно, основное отличие катушек разного размера – это вместимость лески и вес. Внутри расположены 6 шариковых подшипников и 1 роликовый. Привод исполнен из алюминия и бронзы. Внутренняя конструкция катушки минимизирует всевозможные люфты. Она полностью соответствует требованиям «фидеристов» — у неё стандартное для сегодняшних требований к фидерным катушкам передаточное число, равняющееся 5.1 обороту лесоукладчика к одному обороту рукояти, плавный ход, ровная намотка как лески так и плетенки.

Как говорилось выше, тестовая версия катушки была забракована из-за неудачных клипс, в финальной же версии она отвечает требованиям современного фидера. Одно из главных свойств фидерной катушки – это беспрепятственная доставка кормушки в определённое место лова, именно для этого клипса в модели Pilot сделана из металла, она не травмирует леску или плетёнку, и позволяет «заклипсоваться» даже при использовании тяжелых грузов и кормушек.

Держа в руках эту катушку создаётся полное впечатление надежности, сначала держаться за кноб (рукоять) несколько не привычно – она выполнена из резины (прорезиненного пластика), который справляется сразу с несколькими задачами – он не скользит даже с мокрыми руками, и не пачкается, если держать кноб только что испачканными прикормкой руками, что становится особенно актуальным при закармливании точки. В отличии от неопренового, ЭВА или пробкового кноба, такая рукоять не будет впитывать грязь и прикормочную краску.

На катушках 3000 и 4000 размера основание рукоятки катушки складывается и крепится к катушке винтовым способом, непосредственно к ведомой шестерне, что исключает люфт и повышает надежность. В бюджетных катушках такие рукоятки практически не встречаются. Рукоятка на катушке 5000 размера имеет стандартный шестигранник и также легко переставляется под правую руку.

В интернете есть несколько упоминаний, что на 3000 и 4000 размере катушки нельзя переставить рукоять под правую руку – это ложная информация. Рукоять выкручивается слева, откручивается защитная крышка справа и лёгким движением руки на это место закручивается рукоять.

 

При всех преимуществах катушки, она относится к бюджетному ценовому сегменту, что достигается объёмами производства и наработками компании Salmo. Стоит заметить, что новая катушка Feeder Concept не похожа ни на одну катушку компании салмо, несмотря на то, что бренд входит в их группу компаний. Это значит, что были использованы совершенно новые производственные мощности.

 

Отдельно стоит обратить внимание на комплектацию катушки двумя алюминиевыми шпулями, что является неоспоримым плюсом, и позволяет без потери качества ловить, как на разные диаметры лески, так и комбинировать ловлю на плетеные или монофильные лески. Вместимость лески у основной и запасной шпули одинаковая.

Рекомендации по использованию размеров катушек:

Это не является руководством к действию, но примерное соотношение по использованию данных катушек с длиной фидера выглядит так: 3000 катушка – фидеры и пикеры длиной 2,4-3,3метра, 4000 катушка – фидеры длиной 3,0-3,6 (иногда 3,9) метра, и 5000 катушка – идеально подойдёт для дальнобойных фидеров 3,9-4,5 метра. Касаемо нагрузок, 3000 катушка способна бросать без каких-либо последствий до 60-80 грамм, 4000 – до 100-120 грамм, 5000 – до 150-180 грамм.  

 В качестве резюме можно сказать, что катушка Feeder Concept Pilot 7 имеет очень хорошее соотношение цена-качества и обладает свойствами, которые встречаются только в более дорогих сериях катушек. В 2019 году она определённо займёт своё место в данном сегменте и подвинет конкурентов за место в борье за народное звание «лучшая фидерная катушка», ведь у истоков катушки стоят не просто маркетологи, а такой человек как Нормунд Грабовскис. Количество серии ограничено.

 Посмотреть цену и купить катушки Feeder Concept на нашем сайте.

Отзывы о катушках зажигания СОАТЭ: Оценки, Рейтинги, Сайт, Страна

Что мы знаем о катушках зажигания СОАТЭ

Бренд производителя зарегистрирован в стране — Россия. Официальный сайт находится по адресу: http://www.soate.ru/.

В июне 2021 на PartReview сложилось неоднозначное мнение о катушках зажигания СОАТЭ.

Оценка PR — 76 из 100, базируется на основе 57 отзывов и 177 голосов. 41 отзыв имеют положительную оценку, 6 — нейтральную, и 10 — отрицательную. Средняя оценка отзывов — 3.8 (из 5). Голоса распределились так: 135 — за, 42 — против.

В рейтинге лучших производителей катушек зажигания запчасть занимает 5 позицию, уступая таким производителям как Bosch и MOBILETRON , но опережая катушки зажигания Patron и DELPHI.

Пользователи также составили мнение о качествах катушек зажигания СОАТЭ:

  1. Долговечность — сохранение работоспособности на протяжении заявленного срока — оценивается неоднозначно. 3.4 балла из 5.
  2. Температура — эффективность при экстремальных температурах — оценивается позитивно. 5 баллов из 5.
  3. Ошибки в работе — склонность датчиков выдавать ложные срабатывания и ошибочные показатели — оценивается позитивно. 4.3 балла из 5.

Катушка зажигания СОАТЭ в авторейтингах

Здесь можно узнать владельцы каких марок и моделей ставили катушки зажигания СОАТЭ на свои авто. Далее список авторейтингов, в которых данная запчасть входит в ТОП-3 лучших:

  1. СОАТЭ на первом месте в авторейтинге катушек зажигания для: Renault Logan, ВАЗ (Lada) Kalina, ВАЗ (Lada) Granta, ВАЗ (Lada) Priora .
  2. СОАТЭ на втором месте в авторейтинге катушек зажигания для: УАЗ Patriot .
  3. СОАТЭ на третьем месте в авторейтинге катушек зажигания для: ВАЗ (Lada) 2110/2111/2112 .

Катушка зажигания СОАТЭ в сравнении

На PartReview доступны 14 сравнений катушек зажигания СОАТЭ c другими производителями.

В частности можно выяснить, чьи катушки зажигания лучше: СОАТЭ или FENOX, HUСO или СОАТЭ, СОАТЭ или YEC, СОАТЭ или Стартвольт, СОАТЭ или MOBILETRON .

Катушки

«Salmo»: описание, отзывы, фото

.

Катушки «Salmo» — это рыболовные снасти, которые представлены в профессиональной и любительской сериях. Модельный ряд катушек разделен на группы. Это помогает выбрать подходящий вариант с учетом особенностей рыбалки. Продукция марки Salmo уже почти тридцать лет пользуется большой популярностью у рыболовов. Это крупнейший европейский производитель.

О бренде

Катушки «Салмо» — одни из лучших.Все модели шестеренок разрабатываются компанией и создаются с помощью профессиональных дизайнеров и дизайнеров. Ежегодно ассортимент марки Salmo пополняется новыми моделями. Их отличает высокое качество, эксклюзивный дизайн, широкий ценовой диапазон. Рыбак может подобрать именно ту катушку, которая подходит к конкретной ситуации рыбалки, исходя из личного опыта и технических характеристик снастей.

Описание

Катушки «Салмо» — это часть спиннингового стержня, без которой он работать не будет.Инерционная катушка состоит из корпуса, ножек катушкодержателя, привода, ротора, переключателя, тормоза, стержня, лесного сталкера. Выбирать аксессуар следует исходя из способа рыбалки и удочки. Тяжелые устройства, имеющие большой запас мощности, не подходят для ловли рыбы на сверхлегкую приманку. Легкие катушки не справляются с задачами для тяжелого кондуктора.

Принцип действия

Змеевик «Salmo Elite» универсальный. Подходит для ловли рыбы на удочку и кормушку.Серия «Элит» подходит для профессионалов, и цены на эти модели не самые маленькие. Скребок в них широкий, что позволяет рыбаку использовать толстую леску. Катушка немного весит, но она прочная и надежная.

Катушка в катушке совершает возвратно-поступательные движения без вращения во время заброса и выгрузки рыбы. При бросании наживки леска проходит через катушку сбоку. Леска свободного кроя не мешает леске. Литой корпус катушки имеет основание для крепления к снастям.Корпус выполнен из металла, углепластика или полимера. Леска на шпуле укладывается прямым, коническим или обратным конусом.

Характеристики

Катушки «Salmo» популярны среди рыболовов не только из-за доступной цены и большого модельного ряда, но и простоты использования. Например, серия Feeder предназначена для ловли рыбы на донную снасть. Эти модели имеют шесть подшипников, снимающих нагрузку с узлов. Корпус легкий, выполнен из карбопласта, можно менять расположение ручки.

Катушка Salmo Diamond Leader — это универсальная катушка со средней скоростью вращения. Легкий, имеет шесть подшипников и один запасной комплект. Ротор, корпус и дополнительная шпуля выполнены из графита, основная шпуля — из алюминия. Главная передача — из бронзы, эргономичная ручка — из резины. Освободите катушку с задним сцеплением.

Для замены катушки необходимо нажать кнопку в центре. Деталь покрыта прочным материалом — нитритом титана, который защищает ее от быстрого износа.Скребок конический, леска по нему проходит быстро и плавно. Ручка алюминиевая, ручка резиновая. Инерционная катушка «Salmo Blaster Micro 1 1000FD» имеет следующие технические характеристики:

  • тормоз фрикционный передний FD;
  • один шариковый подшипник;
  • графитовая шпулька в комплекте;
  • нижний флип-переключатель антиреверс;
  • корпус и ротор из карбопласта;
  • Рукоятка винтового типа с запиранием;
  • есть возможность правосторонней и левосторонней установки ручки.

Катушка будет работать правильно, если вы соблюдаете меры предосторожности. Обратите внимание: линия не должна попадать во вращающиеся части устройства. После рыбалки просушите катушку, не оставляйте ее мокрой. Не реже одного раза в год нужно покрывать корпус и смазывать механизм. После использования рекомендуется протирать прибор спиртом, а валик — специальной смазкой. Используйте и установите змеевик в соответствии с инструкциями.

Преимущества

Основные преимущества безынерционных катушек — это наличие подшипников.Эти детали выполняют важную задачу: они влияют на работу узлов. Последние справляются с огромной нагрузкой, работают плавно и мягко. Столяр в катушке надежен, при намотке леска не перепуталась. Прочные материалы, используемые при изготовлении шестерен, гарантируют долгий срок службы катушек Salmo. К безынерционным моделям относится и катушка «Salmo Diamond». Его используют рыболовы, ловящие спиннинг.

Модель комплектуется подшипниками от трех до шести штук. Фрикционный тормоз, удобная регулировка, алюминиевая шпуля — все это снижает вес и увеличивает ее прочность.Устройство весит всего 285 грамм. Преимущества катушек Salmo в том, что они широко распространены в специализированных магазинах, их легко купить. К тому же есть из чего выбрать, так как модельный ряд огромен и регулярно обновляется. Если катушка сломается, не проблема купить запчасти для ее восстановления. Бренд «Salmo» производит снасти для ловли мирной и хищной рыбы.

Модели

Катушки бывают трех типов: инерционные, инерционные и множительные.

  1. Инерционные. При забросе они не останавливаются, даже если приманка достигла цели. Рыбаки должны вовремя останавливать катушку, чтобы леска не была слишком плоской и не запутывалась. Такие модели не очень распространены из-за сложности в обращении и специфики конструкции.
  2. Неинерциальный. Спины для спиннинга, в отличие от первых, самые удобные и функциональные. Компания «Салмо» производит легкие и тяжелые модели. Перед забросом необходимо сложить шпульку и зажать леску пальцем, чтобы она не скручивалась.После того, как приманка достигнет своей цели, лесорез спускается, и с помощью рукоятки леска разматывается.
  3. Мультипликативный. Мощные катушки, которые используются для ловли рыбы на спиннинг. Подходит для тяжелых приманок и сверхдлинных забросов. Рекомендуется для профессионалов.

Например, катушка «Salmo Confidence» инерционная и универсальная. Создан для опытных рыболовов. Корпус модели — карбопласт, очень прочный, ротор — из магниевого сплава, ручка — из графита и алюминия.

Цена

Стоимость товара является одним из основных критериев выбора. Ценовой диапазон продукции Salmo велик и зависит от моделей. Цена на зимние катушки «Салмо» начинается от 500 рублей. Ассортимент постоянно обновляется, поэтому рыбаку доступны бюджетные и элитные катушки. Например, мультипликаторы стоят от 2500 до 5500 тысяч рублей, инерционные — от 300 до 8300 тысяч рублей, нахлыстовая рыбалка — от 500 рублей.

Обзоры

Судя по отзывам, рассматриваемые нами катушки — хороший выбор как для начинающих, так и для опытных рыболовов.Например, катушка Salmo Ice Mult — прекрасный многофункциональный вариант. Пользователи отмечают, что у модели сбалансированная шпуля, удобна в использовании, дорого смотрится. Благодаря большому выбору рыболовы находят подходящие товары для донной ловли.

Катушки «Салмо» функциональны, выдерживают большие нагрузки, трение работает плавно, имеют удобную регулировку и рукоятку. В комплект входит сменная шпуля, многие модели отлично подходят для молниеносных спиннингов. Красивый дизайн, отличное соотношение цены и качества — огромные плюсы бренда Salmo.Из недостатков рыбаки отмечают не слишком прочный материал, дешевое трение, кроме того, некоторые катушки плохо работают с плетеной леской.

Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен вновь открытыми вирусами

, 1 , 2 , 2, 3 , 2 , 2 , 2 , 2 , 2 , 4 , 5 , 6 и 1, 7, 8, 9

Гидеон Дж.

Мордехай

1 Департамент наук о Земле, океане и атмосфере, Университет Британской Колумбии , Ванкувер, Канада

Кристина М. Миллер

2 Тихоокеанская биологическая станция, Отдел рыболовства и океанов Канада, Нанаймо, Канада

Эмилиано Ди Чикко

2 Тихоокеанская биологическая станция, рыболовство и океаны Канада, Нанаймо, Канада

3 Фонд тихоокеанского лосося, Ванкувер, Канада

Анджела Д. Шульце

2 Тихоокеанская биологическая станция and Oceans Canada, Nanaimo, Canada

Karia H Kaukinen

2 Тихоокеанская биологическая станция, рыболовство и океаны Канада, Нанаймо, Канада

Tobi J Ming

2 Тихоокеанская биологическая станция, Fisheries and Oceans Канада

Шаоронг Ли

2 Тихоокеанская биологическая станция, рыболовство и океаны Канада, Нанаймо, Канада

Эми Табата

2 Тихоокеанская биологическая станция, рыбный промысел и океаны Канада, Нанаймо, Канада

Эми 9 Теффер 2 4

Департамент лесных наук, Университет Британской Колумбии, Ванкувер, Канада

Да vid A Patterson

5 Fisheries and Oceans Canada, Science Branch, Cooperative Resource Management Institute, School of Resource and Environmental Management, Simon Fraser University, Burnaby, Canada

Hugh W Ferguson

6 Школа ветеринарной медицины, Санкт-ПетербургGeorge’s University, True Blue, Grenada

Curtis A Suttle

1 Департамент наук о Земле, океане и атмосфере, Университет Британской Колумбии, Ванкувер, Канада

7 Департамент микробиологии и иммунологии, Университет Британской Колумбии, Ванкувер, Канада

8 Департамент ботаники, Университет Британской Колумбии, Ванкувер, Канада

9 Институт океанов и рыболовства, Университет Британской Колумбии, Ванкувер, Канада

Ричард А Неер, редактор-рецензент и Ян Т. Болдуин, старший редактор

Ричард А Неер, Базельский университет, Швейцария;

1 Департамент наук о Земле, океане и атмосфере, Университет Британской Колумбии, Ванкувер, Канада

2 Тихоокеанская биологическая станция, рыболовство и океаны Канада, Нанаймо, Канада

3 Фонд тихоокеанского лосося, Ванкувер, Канада

4 Департамент лесных наук, Университет Британской Колумбии, Ванкувер, Канада

5 Рыболовство и океаны Канады, Отдел науки, Институт совместного управления ресурсами, Школа управления ресурсами и окружающей средой, Университет Саймона Фрейзера, Бернаби, Канада

6 Школа ветеринарной медицины, Св.George’s University, True Blue, Гренада

7 Департамент микробиологии и иммунологии, Университет Британской Колумбии, Ванкувер, Канада

8 Департамент ботаники, Университет Британской Колумбии, Ванкувер, Канада

9 Институт океаны и рыболовство, Университет Британской Колумбии, Ванкувер, Канада

Поступило 11 апреля 2019 г . ; Принято 16 июля 2019 г.

Эта статья распространяется в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License, которая разрешает неограниченное использование и распространение при условии указания автора и источника.Эта статья цитировалась в других статьях в PMC.
Цитирование данных
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. Архив чтения последовательности NCBI. PRJNA547678
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611979
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611980
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611981
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611982
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611983
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611984
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611985
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611986
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611987
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611988
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611989
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611990
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611991
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611992
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611993
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611994
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611995
  • Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид А. Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611996
Дополнительные материалы

Рисунок 1 — исходные данные 1: Выравнивание аминокислот аренавируса.

DOI: 10.7554 / eLife.47615.006

Рисунок 1 — исходные данные 2: Выравнивание аминокислот нидовируса.

DOI: 10.7554 / eLife.47615.007

Рисунок 1 — исходные данные 3: Выравнивание аминокислот реовируса.

DOI: 10.7554 / eLife.47615.008

Рисунок 1 — исходные данные 4: Филогенетическое дерево аренавируса.

DOI: 10.7554 / eLife.47615.009

Рисунок 1 — исходные данные 5: Филогенетическое дерево реовируса.

DOI: 10.7554 / eLife.47615.010

Рисунок 1 — исходные данные 6: Филогенетическое дерево нидовирусов.

DOI: 10.7554 / eLife.47615.011

Рисунок 1 — дополнение к рисунку 1 — исходные данные 1: Нуклеотидные последовательности вирусного генома.

DOI: 10.7554 / eLife.47615.005

Рисунок 2 — исходные данные 1: Исходные данные (количество копий ОТ-ПЦР и места отбора проб) для эпидемиологических карт.

DOI: 10.7554 / eLife.47615.015

Дополнительный файл 1: Таблица праймеров и тестов Taqman, использованных в этом исследовании.

DOI: 10.7554 / eLife.47615.019

Дополнительный файл 2: Команды, используемые в биоинформатическом конвейере.

DOI: 10.7554 / eLife.47615.020

Прозрачная форма отчетности.

DOI: 10.7554 / eLife.47615.021

Заявление о доступности данных

Собранные вирусные геномы были депонированы в Genbank под номерами доступа {«type»: «entrez-nucleotide-range», «attrs»: { «text»: «MK611979-MK611996», «start_term»: «MK611979», «end_term»: «MK611996», «start_term_id»: «1726259596», «end_term_id»: «1726259636»}} MK611979-MK611996 имеют последовательность чтения и последовательности был отправлен в архив чтения последовательностей под регистрационным номером PRJNA547678.

Были созданы следующие наборы данных:

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон , Кертис Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. Архив чтения последовательности NCBI. PRJNA547678

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611979

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611980

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611981

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611982

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611983

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611984

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611985

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611986

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611987

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611988

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611989

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611990

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611991

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611992

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611993

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611994

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611995

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611996

Abstract

Коллапс знаковых ключевых популяций лосося нерки ( Oncorhynchus nerka ) и чавычи ( Oncorhynchus tshawytscha ) в северо-восточной части Тихого океана вызывает серьезную озабоченность. Считается, что инфекционные заболевания могут способствовать снижению, но мало что известно о вирусах, эндемичных для тихоокеанских лососей. Метатранскриптомное секвенирование и наблюдение за мертвым и умирающим культивированным лососем чавычей выявили новый аренавирус, реовирус и нидовирус. Секвенирование выявило два разных варианта аренавируса, каждый из которых инфицирует дикую чавычу и нерку. Гибридизация in situ локализовала аренавирус в основном в клетках крови. Популяционные обследования более 6000 диких молодых особей чаварии и нерки показали различное распределение вирусов, что указывает на разные эпидемиологические процессы.Обнаружение ранее нераспознанных вирусов у мертвого и умирающего выращиваемого лосося, которые также широко распространены среди дикого лосося, подчеркивает потенциальную роль, которую вирусные заболевания могут играть в динамике популяций диких рыбных запасов, и угрозу, которую эти вирусы могут представлять для аквакультуры.

Исследовательский организм: Другой

eLife digest

Ключевые виды — это животные и растения, которые играют ключевую роль в поддержке экосистем, в которых они живут, что делает их сохранение одним из главных приоритетов. Чавычи и нерки — два таких вида. Эти рыбы играют центральную роль в прибрежных экосистемах северо-восточной части Тихого океана, где они тысячелетиями поддерживали коренное население.

За последние три десятилетия произошло значительное сокращение популяций чавычи и нерки. Одним из факторов, который может быть причиной этого снижения, является вирусная инфекция. За последние десять лет успехи в технологиях секвенирования ДНК привели к открытию многих новых вирусов, и Mordecai et al.использовали эти технологии для поиска новых вирусов в тихоокеанских лососях.

Во-первых, Mordecai et al. искал вирусы в мертвых и умирающих лососях с ферм и обнаружил три ранее неизвестных вируса. Затем они провели скрининг этих вирусов у выращиваемого лосося, заводского лосося и дикого лосося, чтобы определить их распространение. Два вируса присутствовали в рыбе из трех источников, в то время как один из вирусов был обнаружен только в выращиваемой рыбе. Тот факт, что три вируса распределены по-разному, поднимает вопросы о том, как вирусы передаются внутри и между выращиваемыми, инкубаторными и дикими популяциями лосося.

Эти результаты помогут усилиям по сохранению лосося, поскольку они проинформируют о том, в какой степени эти вирусы присутствуют в популяциях дикого лосося. Дальнейшая работа будет сосредоточена на определении рисков, которые эти вирусы представляют для здоровья лосося, и изучении возможности обмена между заводскими, выращиваемыми и дикими популяциями лосося. Хотя выращиваемый на фермах тихоокеанский лосось может представлять определенный риск передачи для своих диких собратьев, он также дает возможность изучить процессы заболевания, которые не всегда наблюдаются у дикого лосося.В свою очередь, такие данные могут быть использованы для разработки политики, направленной на минимизацию воздействия этих инфекционных агентов и повышение выживаемости популяций дикого лосося.

Введение

Тихоокеанский лосось ( Oncorhynchus spp.) Поддерживает прибрежные экосистемы и коренное население, окружающее северную часть Тихого океана, на протяжении десятков тысячелетий. Сегодня, на протяжении всей своей анадромной жизни, лосось продолжает переносить питательные вещества между водной и наземной средами (Cederholm et al., 1999), являются основными источниками пищи для косаток и морских львов (Wasser et al., 2017; Willson and Halupka, 1995; Chasco et al., 2017; Thomas et al., 2017) и обеспечивают экономические средства к существованию для местных сообществ. (Ноакс и др., 2002). В северо-восточной части Тихого океана за последние 30 лет произошло повсеместное сокращение численности чавычи ( O. tshawytscha ) и нерки ( O. nerka ), в результате чего некоторые популяции оказались на грани истребления (Peterman and Dorner, 2012; Heard и другие., 2007; Миллер и др., 2011; Jeffries et al., 2014) и вызывает серьезную озабоченность у коренных народов, коммерческих и любительских рыболовов, а также широкой общественности. Хотя точное количество нереста лосося в реках неизвестно, наблюдается значительное сокращение численности нерки на большой территории (Peterman and Dorner, 2012). Точно так же запасы чавычи составляют лишь небольшой процент от их исторического уровня, и более 50 запасов вымерли (Heard et al., 2007).

Считается, что инфекционные заболевания могут способствовать сокращению численности лосося (Miller et al., 2011), но мало что известно об инфекционных агентах, особенно о вирусах, эндемичных для тихоокеанских лососей. Инфекционное заболевание было определено как потенциальный фактор плохой выживаемости мигрирующих лососей в море на раннем этапе; иммунный ответ на вирусы был связан со смертностью диких мигрирующих смолтов и взрослых особей (Miller et al., 2011; Jeffries et al., 2014), а также с неуточненной смертностью лосося в загонах морских сетей в Британской Колумбии (Британская Колумбия) (Miller et al., 2017; Di Cicco et al., 2018). Например, иммунные ответы на вирусы, такие как вирус инфекционного гематопоэтического некроза (IHNV) и потенциально неоткрытые вирусы, были связаны со смертностью дикой молоди лосося (Jeffries et al., 2014). Это важное наблюдение, поскольку смертность молоди лосося может достигать ~ 90% при переходе из пресной воды в морскую среду (Clark et al. , 2016). Вместе они предполагают, что существуют неоткрытые вирусы, которые могут способствовать снижению выживаемости тихоокеанских лососей, но согласованные усилия по поиску вирусов, которые могут способствовать смертности, отсутствовали.

Здесь было реализовано обнаружение вирусов для выявления вирусов, связанных со смертностью. Вместе, секвенирование мертвого или умирающего лосося аквакультуры и отобранного живого дикого лосося, гибридизация на месте и эпидемиологические исследования показали, что ранее неизвестные вирусы, некоторые из которых связаны с болезнями, заражают дикого лосося из разных популяций.

Результаты и обсуждение

Рыбы были проверены по панели биомаркеров для выявления вирусных заболеваний (VDD), которая выявляет консервативный паттерн транскрипции, указывающий на иммунный ответ на активную вирусную инфекцию РНК (Miller et al., 2017). Например, в предыдущем исследовании мы показали, что 31% умирающих атлантических лососей находились в состоянии вирусного заболевания, и половина из них не была известна как положительная на какие-либо известные РНК-вирусы (Di Cicco et al. , 2018). Лица, которые были строго VDD-положительными, но отрицательными в отношении каких-либо известных вирусов лосося (например,грамм. Метатранскриптомическому секвенированию были подвергнуты ортореовирус рыб, вирус эритроцитарного некроза, вирус инфекционного некроза поджелудочной железы, вирус инфекционного гематопоэтического некроза, вирус инфекционной анемии лосося и парамиксовирус тихоокеанского лосося. Секвенирование выявило вирусные транскрипты, принадлежащие членам Arenaviridae , Nidovirales и Reoviridae , трем эволюционно расходящимся группам РНК-вирусов (), которые могут быть высокопатогенными (Yun and Walker, 2012; Liang et al., 2014; Weiss, Leibowitz, 2011).

Филогенетическое дерево максимального правдоподобия, основанное на сопоставлениях MAFFT предсказанного белка репликазы ( A ) пескаренавируса лосося и родственных аренавирусов, ( B ) Chinook Aquareovirus и родственных Aqua и ортореовирусов и ( C ) тихоокеанского лосося Nidovirales.

Последовательности из этого исследования отмечены звездочкой, масштабная полоса представляет количество аминокислотных замен на сайт, метки узлов показывают поддержку начальной загрузки, а группы хостов показаны цветом.Деревья имеют средние корни, поэтому не обязательно отражают родственные связи вирусов. Выравнивания аминокислот были предоставлены в исходных данных для.

Рисунок 1 — исходные данные 1.
Выравнивание аминокислот аренавируса.
Рисунок 1 — исходные данные 2.
Выравнивание аминокислот нидовируса.
Рисунок 1 — исходные данные 3.
Выравнивание аминокислот реовируса.
Рисунок 1 — исходные данные 4.
Филогенетическое дерево аренавируса.
Рисунок 1 — исходные данные 5.
Филогенетическое дерево реовируса.
Рисунок 1 — исходные данные 6.
Филогенетическое дерево нидовирусов.

Рисунок 1 — дополнение к рисунку 1.

Организация и охват генома.

( A ) Организация генома, прогнозирование ORF и ( B ) покрытие генома для пескаренавируса лосося 1 и 2 (SPAV), сегментов 1-го акварельного вируса чавычи (CAV) и нидовируса тихоокеанского лосося (PsNV). Черные линии представляют геном, а прямоугольники показывают предполагаемые открытые рамки считывания.Нуклеотидные последовательности представлены в формате fasta в исходных данных для.

Рисунок 1 — дополнение к рисунку 1 — исходные данные 1.
Вирусные геномные нуклеотидные последовательности.

Одна из проблем обнаружения вирусов у рыб заключается в том, что доля вирусных транскриптов в метатранскриптомных библиотеках позвоночных мала по сравнению с количеством транскриптов от хозяина и других загрязняющих последовательностей (Geoghegan et al., 2018; Zhang et al., 2019). Тем не менее, нам удалось получить полные геномы, близкие к кодированию для трех новых вирусов (). Геномная организация недавно открытых вирусов соответствовала родственным вирусам рыб. Например, SPAV имеет три геномных сегмента, как показано для других аренавирусов у рыб (Shi et al., 2018). Высокопроизводительный ОТ-ПЦР-скрининг> 6000 молоди дикого молодняка чаварии и нерки выявил несходное географическое распределение инфицированной рыбы, что отражает различия в эпидемиологических моделях передачи и динамике инфекции для каждого из вирусов ().

Эпидемиологические карты пескаренавируса лосося 1 и 2 (SPAV-1 и SPAV-2), акваровируса чавычи (CAV) и нидовируса тихоокеанского лосося (PsNV) у побережья острова Ванкувер.

Отдельные образцы показаны в месте сбора, отрицательные образцы отображаются черным цветом, а положительные образцы окрашены и имеют размер в соответствии с количеством копий вируса. Небольшая степень случайного шума была добавлена ​​к долготе и широте, чтобы предотвратить перекрытие графика.

Рисунок 2 — исходные данные 1.
Исходные данные (количество копий ОТ-ПЦР и места отбора проб) для эпидемиологических карт.

Рисунок 2 — дополнение к рисунку 1.

Сводка RT-PCR для SPAV-1 и -2, PsNV и CAV с использованием платформы Biomark Fluidigm.

Представленные данные представляют собой распространенность (процент) положительных амплификаций выше расчетного предела обнаружения (95%). Числа показывают размер выборки, а полосы ошибок показывают биномиальные доверительные интервалы Вильсона. Чавычи инкубатория — это рыба с обрезанными плавниками, тогда как дикие представляют собой все остальные пойманные в дикой природе рыбы.

Рисунок 2 — дополнение к рисунку 2.

Эпидемиологические карты пескаренавируса лосося 1 и 2 (SPAV-1 и SPAV-2) от Вашингтона до Аляски.

Отдельные образцы показаны в месте сбора, образцы, отрицательные для SPAV, отмечены черным цветом, а положительные образцы окрашены и размером в соответствии с количеством копий вируса.Небольшая степень случайного шума была добавлена ​​к широте и долготе, чтобы предотвратить перекрытие графика.

Распространение и численность различных вирусов заметно различались. Аренавирусы были относительно обычными () и географически широко распространенными среди мигрирующей молоди чавеники и нерки в морской среде (,). Принимая во внимание, что нидовирус был пространственно локализован и преимущественно наблюдался с высокой распространенностью в течение нескольких лет у чавычи, покидающей пресноводные питомники (). Наконец, реовирус был обнаружен только у выращиваемой на ферме чавычи (и).

Считалось, что аренавирусы, за исключением относительно недавнего открытия у змей (Stenglein et al., 2012) и рыб-лягушек (Shi et al., 2018), заражают исключительно млекопитающих. Сообщаемые здесь аренавирусы имеют менее 15% сходства аминокислотных последовательностей (в RdRp) с таковыми у млекопитающих и змей и определяют новую монофилетическую эволюционную группу — пескаренавирусы (). Отсутствие четкой гомологии последовательностей гликопротеина, различие в сегментации генома (Shi et al. , 2018), а также филогенетический анализ репликазы показывают, что пескаренавирусы имеют общего, но древнего предка с аренавирусами, заражающими змей и млекопитающих. Мы рекомендуем отнести эти инфицирующие рыбу аренавирусы к новому роду Pescarenavirus , а те, что инфицируют чавычу и нерки, отнести к виду Salmon pescarenavirus (SPAV), штаммы 1 и 2, соответственно.

У выращенного на ферме чавычи с положительным результатом на SPAV-1 наблюдались патология и симптомы, соответствующие заболеванию, включая воспаление селезенки и печени, а также некроз канальцев и гиперплазию почек.Клинически у лосося наблюдается желтая жидкость на пилорической слепой кишке и плавательном пузыре, бледные жабры с кровоизлиянием на поверхности и анемия. Дикий чавыч и нерка, которые дали положительный результат на аренавирусную инфекцию, но были клинически здоровыми при взятии проб, показали несколько гистологических повреждений. Гибридизация in-situ показала, что аренавирусы сконцентрированы в основном в макрофагоподобных клетках, меланомакрофагах, красных кровяных тельцах (эритроцитах) и эндотелиоцитах (). Эти данные согласуются с локализацией аренавирусов у млекопитающих и змей, хотя, в отличие от змей и рыб, эритроциты млекопитающих не имеют ядер, поэтому сходство, вероятно, распространяется только на ядросодержащие клетки.SPAV-1 и -2 обладали сходным клеточным тропизмом у чавычи и нерки соответственно (). В одном из восьми исследованных образцов чавычи был зарегистрирован умеренный хронический активный гепатит, и окрашивание на SPAV-1 было идентифицировано в области, пораженной воспалением (), в то время как в других образцах SPAV-1 был ограничен ретикулоэндотелиальными клетками в в ткани печени или в синусоидах. Больше поражений наблюдалось у мертвых выращиваемых чавычей, у которых болезнь прогрессировала быстрее. Наши наблюдения показывают, что аренавирусы реплицируются в красных кровяных тельцах и встречаются в макрофагах и лейкоцитах, которые потребляют инфицированные клетки.Более того, наблюдаемые патологические изменения у рыб, инфицированных аренавирусом, включая анемию и поражения жабр, почек и печени, можно ожидать от вирусов, которые инфицируют эритроциты. Эти результаты являются первым эмпирическим доказательством наличия аренавирусной инфекции у рыб и позволяют предположить, что SPAV, как и многие другие аренавирусы, потенциально может быть возбудителем заболевания.

Окрашивание гибридизацией in situ SPAV-1 у чавычи.

Красная окраска указывает на локализацию вирусной РНК, а также вирусных транскриптов.( A ) Селезенка: окрашивание в основном локализовано в макрофагах (стрелки), расположенных вокруг синусоидов, хотя также присутствуют рассеянные положительные эритроциты (стрелки) (шкала 50 мкм). ( B ) Задняя почка: вирус, по-видимому, главным образом локализован в перитубулярных капиллярах (портальные сосуды почек) и макрофагах (стрелки) (масштабная линейка 100 мкм). ( C ) Печень: узелки воспаления в основном сконцентрированы в ярко выраженной области. (масштабная линейка 100 мкм), пунктирный прямоугольник увеличен на ( D ), показывая лимфоциты и макрофаги в воспалительном узелке (некоторые из которых являются положительными на вирус). (шкала 20 мкм). ( E ) Сердце: положительные макрофаги (стрелки) присутствуют между волокнами губчатого миокарда, наряду с несколькими положительными эритроцитами (наконечник стрелки) и эндотелиальными клетками (открытые наконечники стрелок). (шкала 100 мкм). ( F ) Кишечник: окрашивание на SPAV-1 в основном локализовано в лимфоидной ткани, ассоциированной с кишечником (стрелки). (шкала 100 мкм).

Рисунок 3 — дополнение к рисунку 1.

Окрашивание гибридизацией in situ SPAV-2 у нерки.

Красное пятно указывает на локализацию вирусной РНК, а также вирусных транскриптов ( A ). Селезенка: окрашивание в основном локализовано на макрофагах (стрелки), разбросанных по ткани. (шкала 100 мкм). ( B ) SPAV-2, по-видимому, в первую очередь локализован в перитубулярных капиллярах (портальные сосуды почек) и макрофагах (стрелки) (масштабная линейка 100 мкм). ( C ) Печень: макрофаги (стрелки) и красные кровяные тельца (стрелка), положительные по SPAV-2, присутствуют в крови, циркулирующей в синусоидах. (шкала 100 мкм). ( D ) Печень: SPAV-2 локализуется в крови, внутри макрофагов (стрелки) и эритроцитов (стрелки). (шкала 20 мкм). ( E ) Жабры: несколько красных кровяных телец (стрелка) были положительными на SPAV-2. (шкала 100 мкм). ( F ) Сердце: вирус был локализован в макрофагах (стрелки) в крови, циркулирующей в миокарде. (шкала 100 мкм).

Секвенирование выращиваемой чавычи лосося также выявило ранее не описанные нидовирус и реовирус.Филогенетический анализ реовируса, получившего название Chinook aquareovirus (CAV), предсказывает, что он является частью рода Aquareovirus (). Вместо того, чтобы быть наиболее тесно связанными с известными реовирусами лосося (Winton et al., 1981), группы CAV с растущим числом акваровирусов, некоторые из которых, как известно, вызывают геморрагические заболевания и привели к серьезным потерям для аквакультуры в Китае (Nibert и Дункан, 2013; Ван и др., 2012). Наблюдаемые клинические признаки (анемия, темная селезенка и заполненные кровью почки) у мертвого выращенного на ферме чавычи с высоким содержанием КАВ соответствуют геморрагическим проявлениям.

Новый нидовирус, названный нидовирус тихоокеанского лосося (PsNV), наиболее тесно связан с недавно описанным Microhyla alphaletovirus 1, который образует сестринскую группу по отношению к коронавирусам (Bukhari et al., 2018). Эта последовательность, наряду с PsNV, базальна для всех других семейств нидовирусов, и их большая длина ветви предполагает, что каждая из них принадлежит к разному роду (). Хотя не все коронавирусы вызывают серьезные заболевания, многие из них, например SARS и MERS, вызывают тяжелые респираторные инфекции (de Wit et al., 2016).

И SPAV-1, и SPAV-2 были относительно широко распространены вдоль побережья юго-западной Британской Колумбии, в океане вылавливались чавычи и нерки. В настоящее время неясно, что является причиной различий в распространенности SPAV-1 и SPAV-2 между регионами, но вирус, по-видимому, передается молодым лососям на юге Британской Колумбии вскоре после того, как они попадают в океан, что, как известно, имеет решающее значение для их выживания. (Бимиш и др., 2012а). SPAV-1 также был относительно обычным явлением в выращиваемых популяциях чавычи.Распространение SPAV-1 в диких популяциях чавычи было более локализовано на западном побережье острова Ванкувер, чем SPAV-2, которое было наиболее распространено на восточном побережье острова Ванкувер, недалеко от островов Дискавери и пролива Джонстона и редко обнаруживалось. в нерки в северной Британской Колумбии и на Аляске ().

На восточном побережье острова Ванкувер пролив Джонстон и острова Дискавери были определены как потенциальные узкие места для роста и выживания молоди лососевых (Healy et al., 2017). Доступность добычи для молоди нерки в северной части пролива Джонстон крайне низкая, что приводит к ограничению в пище и усилению конкуренции за добычу (Beamish et al., 2012a; McKinnell et al., 2014; Godwin et al., 2015; Godwin et al. ., 2018). Эти регионы с высоким уровнем инфицирования SPAV-2 могут представлять собой стрессовую часть миграции молоди нерки, что может привести к более высокой восприимчивости к инфекции. Более того, SPAV-2 был обнаружен при высоких нагрузках в рыбе, отобранной из регионов, где имеется много объектов рыбоводства и, соответственно, высока зараженность морскими вшами (Price et al., 2011]. Остается открытым вопрос, может ли альтернативный хозяин играть роль в передаче вируса между рыбами и / или приводить к повышенной восприимчивости к инфекции (Valdes-Donoso et al., 2013).

Распределение CAV заметно отличалось от SPAV. CAV не был обнаружен ни у одной молоди дикого или заводского чавычи, несмотря на то, что он был обнаружен у разводимой рыбы как на западном, так и на восточном побережье острова Ванкувер. Более 20% отмирающих рыб из аквакультуры чавычи дали положительный результат на CAV, при этом большинство обнаружений было обнаружено у рыб, по крайней мере, 1.Спустя 5 лет после входа в океан, значительно больше того времени, когда отбирались пробы мигрирующего лосося. Следовательно, для развития инфекции CAV может потребоваться значительное время или она может быть инфицирована только взрослыми рыбами. КАВ также был обнаружен у небольшого количества выращиваемых на фермах атлантического лосося (семь положительных результатов обнаружения 2816 протестированных рыб). Монофилетическая группировка КАВ с другими заболеваниями, вызывающими акваровирусы, и согласованность с геморрагической болезнью предполагают, что вирус важен для мониторинга у разводимых рыб и потенциально диких взрослых особей, возвращающихся после нескольких лет в море.

Распространение PsNV было тесно связано с несколькими инкубаториями по выращиванию лосося, но также было обнаружено у 18% аквакультуры чавычи и 3% диких чавычей (). У заводских рыб инфекция PsNV была в основном локализована в жаберной ткани (), что напоминает респираторное заболевание, вызываемое родственными коронавирусами млекопитающих, такими как MERS и SARS (). PsNV вызывает особую озабоченность, поскольку он размножается, когда рыба подвергается смолтификации — процессу, во время которого ткань жабр претерпевает клеточную реконфигурацию, чтобы подготовиться к соленой воде. Примечательно, что у некоторых выращиваемых лососей, инфицированных PsNV, было отмечено разрастание жабр неизвестной причины. В одном из рыбоводных заводов, где производился отбор проб до и после выпуска, распространенность вируса увеличивалась во время развития смолта в пресной воде, он был обнаружен вскоре после выпуска и практически не обнаруживался в течение месяца после входа в океан (). Это говорит о том, что инфицированная рыба либо избавилась от инфекции, либо не выжила после попадания в морскую среду. Вторая интерпретация согласуется с более низкими показателями выживаемости в океане рыбы, выращенной в инкубаториях, по сравнению с диким лососем (Beamish et al., 2012б).

Локализация и обнаружение нидовируса тихоокеанского лосося в одном заводе по разведению лосося.

( A ) Среднее относительное количество нидовируса тихоокеанского лосося в вскрытых тканях восьми особей чавычи. Каждый образец анализировали и наносили на график в двух экземплярах. ( B ) Распространенность нидовируса тихоокеанского лосося среди рыб, собранных в пресной и соленой воде на одном заводе по разведению лосося в течение четырех лет. Приведенные данные показывают преобладание положительных амплификаций выше расчетного предела обнаружения (95%).Числа показывают размер выборки, а полосы ошибок показывают биномиальные доверительные интервалы Вильсона.

Вирусные заболевания представляют собой потенциальную угрозу для запасов диких рыб; тем не менее, мало что известно о вирусах, циркулирующих среди лосося, выращиваемого на фермах или в инкубатории. Здесь с помощью метатранскриптомических исследований мы обнаруживаем несколько ранее неизвестных вирусов, которые были обнаружены у мертвых и умирающих рыб, выращиваемых в аквакультуре, и показываем, что они также встречаются у дикой рыбы и рыб, выращиваемых в инкубаториях. В зависимости от вируса и вида-хозяина, вирусы варьируются от локализованных до широко распространенных, от заражения <1% до> 20% рыб и от пределов обнаружения до очень высоких нагрузок. Наши результаты согласуются с тем, что некоторые из этих вирусов являются возбудителями болезней, поэтому крайне важно понять их возможную роль в смертности лосося и сокращении популяций дикого лосося, а также их потенциальное взаимодействие с сетевым рыбоводством и инкубаторием. Обнаружение вирусов у умирающих людей с последующим тщательным наблюдением и гистопатологической локализацией являются мощными инструментами для достижения конечных целей по выявлению возбудителей болезни и пониманию воздействия инфекционных агентов на дикие популяции.Эти выводы имеют решающее значение, поскольку ожидается, что молодь лосося с неоптимальным здоровьем будет иметь более низкие показатели выживаемости в дикой природе. Постоянный надзор и знание эндемичных и новых вирусных инфекций у этих культовых видов лососей благоприятно сказываются на их сохранении.

Материалы и методы

Экстракции нуклеиновых кислот

Образцы были предоставлены Управлением рыболовства и океанов, Канадским управлением аквакультуры и Программой улучшения лосося. Дополнительные пробы были собраны в рамках программы по выращиванию молоди лосося Института Хакаи.Образцы инкубатория идентифицируются путем обрезки плавников, и в этом исследовании дикая рыба может также включать немаркированную рыбу заводского производства. ДНК извлекается для обнаружения ДНК-вирусов, бактерий и паразитов из тех же тканей, из которых мы извлекаем РНК, для нацеливания на РНК-вирусы. Экстракция нуклеиновых кислот в контрольных образцах (восемь тканей — жабры, предсердие, желудочек, печень, пилорическая слепая кишка, селезенка, головная почка и задняя почка) были такими, как описано ранее (Laurin et al., 2019). Для образцов дикого чавычи и нерки гомогенизацию с использованием Tri-reagent проводили в смесительной мельнице (Qiagen, Мэриленд) независимо от каждой ткани (пять тканей — жабры, печень, сердце, головная почка и мозг).Гомогенаты с тремя реагентами органически разделяли с использованием бромхлорпропана, при этом водный слой, содержащий РНК, удаляли для экстракции РНК, а нижний содержащий ДНК органический слой отделяли от органических веществ с использованием буфера TNES-Urea (Asahida et al. , 1996).

Для экстракции ДНК пул из 250 мкл (5 тканей, вносящих по 50 мкл каждая) из каждого водного слоя ткани TNES был обработан на ДНК с использованием набора BioSprint 96 DNA Blood (Qiagen, Мэриленд) и прибора BioSprint 96 ( Qiagen, Мэриленд), оба в соответствии с инструкциями производителя.ДНК количественно определяли с использованием показаний спектрофотометра, выполненных на спектрофотометре Infinite M200Pro (Tecan Group Ltd., Швейцария), и нормализовали до 62,5 нг / мкл с использованием устройства для обработки жидкостей Freedom Evo (Tecan Group Ltd., Швейцария) на основании инструкций производителя.

Аналогичным образом, пул из 100 мкл (5 тканей, вносящих по 20 мкл каждая) водного слоя был обработан на РНК с использованием набора Magmax-96 для микрочипов РНК (Ambion Inc, Остин, Техас, США) с Biomek NXP (Beckman -Coulter, Mississauga, ON, Canada) автоматизированный инструмент для работы с жидкостями, оба на основе инструкций производителя.Количество РНК анализировали с использованием показаний спектрофотометра и нормализовали до 62,5 нг / мкл с помощью автоматизированного прибора для обработки жидкостей Biomek NXP (Beckman-Coulter, Mississauga, ON, Canada) в соответствии с инструкциями производителя. Смешанную тканевую РНК (1 мкг) обратно транскрибировали в кДНК с использованием набора для мастер-микса VILO с надстрочным индексом (Invitrogen, Carlsbad, CA), следуя инструкциям производителя.

Метатранскриптомное секвенирование

Мы применили панель биомаркеров (генов) хозяина, которые при совместной экспрессии указывают на вирусное болезненное состояние (VDD) (Miller et al., 2017). Образцы, которые показали положительное вирусное заболевание, но не были положительными на вирусы на основе нашего 45 панельного скрининга микробов (как описано в Bass et al., 2019), были отобраны для высокопроизводительного секвенирования РНК (двойная последовательность РНК) для открывать новые вирусные агенты.

Суммарная РНК из смешанных образцов тканей оценивалась на качество с использованием чипа Total RNA Pico на биоанализаторе Agilent 2100 (Agilent, Санта-Клара, Калифорния) и количественно определялась с помощью набора Qubit RNA Br (Invitrogen, Карлсбад, Калифорния).Разведение 1/100 контрольной смеси 1 ERCC RNA Spike-In (Ambion, Carlsbad, CA) добавляли к каждому образцу общей РНК до истощения рибосом и подготовки библиотеки. Библиотеки секвенирования и удаление рибосом выполняли с использованием набора Epicenter ScriptSeq Complete Gold Kit (Epidemiology) (Illumina, San Diego, CA) в соответствии с инструкциями производителя и включали положительный контроль (универсальная эталонная РНК человека) (Agilent, Санта-Клара, Калифорния) и отрицательный контроль (без общей РНК). Общую РНК, лишенную рРНК, очищали с использованием набора Zymo RNA Clean and Concentrate-5 (Zymo Research, Irvine, CA) в соответствии с инструкциями производителя и количественно оценивали с помощью набора Qubit RNA HS (Invitrogen, Carlsbad, CA).Обратные праймеры ScriptSeq Index добавляли к кДНК на заключительном этапе амплификации, который включал 14 циклов. 3’-концевая меченная кДНК и конечная амплифицированная библиотека очищали с использованием системы Agencourt AMPure XP (Beckman Coulter, Brea, CA). Конечный размер библиотеки определяли с использованием ДНК-чипа HS на биоанализаторе Agilent 2100 (Agilent, Санта-Клара, Калифорния), а концентрацию определяли с использованием набора Qubit dsDNA HS (Invitrogen, Карлсбад, Калифорния). Библиотеки образцов были нормализованы до 4 нМ, соответствующим образом объединены, денатурированы и разбавлены для получения конечной библиотеки 17 пМ.Перед загрузкой в ​​набор v3 2 × 300 п.н. (Illumina, Сан-Диего, Калифорния) было добавлено 2% phiX. Наконец, парный цикл секвенирования 251 п.н. был выполнен на системе Illumina MiSeq System (Illumina, Сан-Диего, США). CA) с четырьмя штрих-кодами, объединенными для каждого цикла.

Для секвенирования SPAV-2, PsNV и CAV образцы были подготовлены с использованием того же метода, что и выше, но секвенированы BC Cancer Agency с использованием протокола HiSeq (2 × 125) (четыре разных образца проиндексированы по одной дорожке).

Филогенетический анализ

Филогения каждого вируса была определена на основе предсказанных аминокислотных последовательностей репликазы (CAV и SPAV) и ORF1ab (PsNV), поскольку нуклеотидные последовательности были слишком разнородны для надежного выравнивания.Выравнивания были произведены с помощью MAFTT (v7. 42) (Katoh and Standley, 2013) с использованием алгоритма E-INS-i. Этот алгоритм выравнивания подходит для эволюционно различных последовательностей с консервативными мотивами (такими как вирусная РНК-полимераза), которые встроены в длинные несовместимые остатки. Новые вирусы лосося были сопоставлены с другими вирусными геномами с общим аминокислотным сходством, как обнаружено DIAMOND (Buchfink et al., 2015). Кроме того, были включены вирусные геномы, которые, как известно, эволюционно связаны с ними.Затем множественные выравнивания белков использовались для построения филогении с использованием плагина PhyML 3.0 (Guindon et al., 2010) в Geneious со 100 загрузочными страницами для генерации значений поддержки ветвей. Деревья имеют средние корни только для ясности и не обязательно отражают родственные связи вирусов.

Разработка анализа и скрининг

Собранные контиги вирусных последовательностей из соответствующего образца были импортированы в программное обеспечение Primer Express v3. 0.1 (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA), где тесты qPCR Taqman были разработаны с использованием параметров по умолчанию (дополнительный файл 1).Затем эти анализы были протестированы с использованием системы qPCR на основе микрофлюидики Fluidigm BioMark, следуя тому же протоколу, который описан ниже, за исключением новых пар вирусных праймеров, включенных в этап STA и контролей. На основе этих начальных скринингов был выбран наиболее последовательный анализ и были созданы стандарты APC для включения в будущие микробные панели Fluidigm BioMark qPCR. Теоретический предел обнаружения для конкретного анализа был рассчитан, как описано ранее (Miller et al., 2016). Предел обнаружения был применен для классификации рыб с амплификациями выше 95% порога обнаружения, который представляет собой концентрацию аналита в матрице образца, которая может быть обнаружена с высокой статистической достоверностью (95% времени).На основе этих данных были составлены эпидемиологические карты с учетом предела обнаружения. Карты были созданы в R с использованием ggplot2 (Wickham, 2016) и ggmap (Kahle and Wickham, 2013).

RT-PCR

Для всех образцов после обратной транскрипции полученную кДНК объединяли с нормализованной ДНК в соотношении 1: 1 и использовали в качестве матрицы для стадии специфической целевой амплификации (STA). STA включает предварительную амплификацию всех праймеров для запуска на одном динамическом массиве при низких концентрациях (0.2 мкМ каждого из праймеров), и по завершении избыточные праймеры удаляли обработкой Exo-SAP-IT (Affymetrix, Санта-Клара, Калифорния) в соответствии с инструкциями производителя, а затем разбавляли 1: 5 в буфере для ресуспендирования ДНК ( Текнова, Холлистер, Калифорния).

Динамический массив экспрессии генов 96,96 (Fluidigm Corporation, Калифорния, США) запускали в соответствии с процедурой, описанной ранее (Miller et al., 2016). В частности, для каждого образца готовили 5 мкл матрицы, содержащей 1 × TaqMan Universal Master Mix (без UNG), 1 × реагент для загрузки образцов GE (Fluidigm PN 85000746) и каждую из разбавленных смесей образцов STA’d. Были приготовлены пять мкл смеси для анализа с 1 × каждым из подходящих анализов TaqMan qPCR (зонд агента в FAM-MGB и зонд искусственной положительной конструкции (APC) в NED-MGB, 10 мкМ праймеров и 3 мкМ зондов) и 1 × Загрузочный реагент для анализа (Fluidigm PN 85000736).

Элементы управления были добавлены до запуска динамического массива (Miller et al., 2016). Обратите внимание, что клоны APC для всех анализов содержались в одном пуле с серийным разведением, загруженном последним, что сводит к минимуму вероятность контаминации любого отдельного клона APC.После того, как загрузка и смешивание динамического массива были завершены в контроллере IFC HX, массив был перенесен в прибор BioMark HD и обработан с использованием стандартной программы TaqMan GE 96 × 96 для qPCR, которая включает горячий старт с последующими 40 циклами при 95 °. C в течение 15 с и 60 ° C в течение 1 мин (Fluidigm Corporation, Калифорния, США). Данные анализировали с помощью программного обеспечения для анализа ПЦР в реальном времени (Fluidigm Corporation, Калифорния, США).

Образцы смолта чавычи, положительные на PsNV с 2014 г., были использованы для определения тканевой локализации ().Жабры, печень, сердце, почки и мозг индивидуально гомогенизировали, обрабатывали для выделения РНК (как описано выше), и 1 мкг нормализованной РНК использовали для обратной транскрипции. Полученную кДНК для каждой отдельной ткани использовали в качестве матрицы для относительной количественной оценки PsNV с использованием ABI 7900HT (ABI) в 384-луночных оптических планшетах. Объем реакции qPCR составлял 12 мкл, что включало 6 мкл 2X TaqMan Gene Expression Master Mix (ABI PN 4369016), 4,3 мкл воды, 0,22 мкл смешанных прямого и обратного праймеров (конечная концентрация каждого по 900 нМ), 0.24 мкл каждого зонда (конечная концентрация 200 нМ; анализируемый зонд и контрольный зонд APC) и 1 мкл матрицы кДНК. Температурные циклы включали одну 2-минутную выдержку (50 ° C), 10-минутную денатурацию (95 ° C) и 40 циклов денатурации (95 ° C в течение 15 с), отжиг и удлинение (60 ° C в течение 60 с). Условия амплификации на ABI 7900 не были оптимизированы для этой платформы, но довольно точно отражали те, которые использовались на платформе BioMark. Образцы, запущенные на ABI, не подвергались обогащению STA. Стандартные кривые были построены с использованием тех же стандартов клонов APC с добавлением ДНК CHSE, что и на BioMark.Серийные разведения были сделаны для получения концентраций 24, 1,2 × 102, 6 × 102, 3 × 103, 1,5 × 104, 1,5 × 105 копий клона на реакцию. Стандарты клонов, неизвестные образцы, положительные и отрицательные контроли были проанализированы в двух экземплярах. Программное обеспечение ABI рассчитывает относительное количество копий на основе серийного разведения стандартной кривой.

Гистопатология

До обнаружения этих вирусов клинические признаки заболевания и гистопатологические поражения были оценены примерно у 230 выращиваемых на фермах чавычи, взятых в рамках программы аудита.Следовательно, жабры, скелетные мышцы, селезенка, печень, сердце, передняя и задняя почки, пилорическая слепая кишка и мозг из одиннадцати образцов чавычи (восемь дикой рыбы и три выращенных на фермах рыбы) и десяти нерки (все дикая рыба), положительных на SPAV, были проанализированы гистопатологически. для оценки наличия высыпаний. Все ткани фиксировали в 10% нейтральном забуференном формалине, обезвоживали с помощью восходящего градиента спиртовых растворов, заливали парафиновым воском, разрезали до толщины 3,5 мкм и окрашивали стандартным гематоксилином и эозином (H и E) для морфологической оценки с помощью светового микроскопа.

Гибридизация in situ (ISH)

РНК-ISH выполняли с использованием анализа RNAscope 2.5 HD Duplex (Advanced Cell Diagnostics, Newark, California, USA, каталог № 322500) в соответствии с инструкциями производителя. Вкратце, последовательные срезы образцов чавычи и нерки, использованные для гистопатологического анализа, депарафинизировали путем инкубации в течение 60 минут при 60 ° C, а эндогенные пероксидазы гасили перекисью водорода в течение 10 минут при комнатной температуре. Затем слайды кипятили в течение 30 минут в реагентах для извлечения мишеней RNAscope (Advanced Cell Diagnostics, Newark, California, USA) и инкубировали в течение 30 минут в реагенте RNAscope Protease Plus перед гибридизацией. Слайды подвергали гибридизации с зондами RNAscope против части генома SPAV-1 и SPAV-2 (Advanced Cell Diagnostics, Ньюарк, Калифорния, США, каталог № 513591-C2 и 538881-C2, соответственно). Зонд RNAscope против гена домашнего хозяйства Coil-p84 у чавычи (Advanced Cell Diagnostics, Newark, California, USA, каталог № 512391) использовали в качестве зонда положительного контроля для подтверждения эффективности зондов и жизнеспособности образцов. Два образца, которые были отрицательными для SPAV-1 и SPAV-2, использовали в качестве отрицательного контроля для подтверждения отсутствия фона и (или) неспецифической перекрестной реактивности анализа.Усиление сигнала выполняли в соответствии с инструкциями производителя с последующим контрастным окрашиванием гематоксилином Гилла и визуализацией с помощью светлопольной микроскопии.

Благодарности

Мы благодарим Джеффри Джоя, Веронику Пагловски, Яна Финке, Томаса Вальцека, Бена Ноймана и Умберто Дебата за советы и помощь в анализе, Отдел управления аквакультуры DFO, Программу улучшения лосося и Программу по выращиванию молоди лосося Института Хакаи за предоставление образцы, и все судовые и полевые бригады, которые собрали тысячи образцов. Мы благодарим Эми Чан и всех сотрудников лаборатории Саттла за их отзывы о разработке проекта. Это исследование было поддержано финансированием Стратегической инициативы по охране здоровья лосося (SSHI), которая является частью проекта по выживанию в море Салиш. SSHI стремится обнаружить микробы, присутствующие в лососе в Британской Колумбии, которые могут подрывать продуктивность тихоокеанского лосося, и финансируется Фондом тихоокеанского лосося (PSF), Genome British Columbia и Fisheries and Oceans, Канада. Это публикация номер 32 из проекта Salish Sea Marine Survival Project (marinesurvivalproject.com).

Отчет о финансировании

Финансирующие организации не играли никакой роли в дизайне исследования, сборе и интерпретации данных или в решении представить работу для публикации.

Информация для авторов

Ричард А Неер, Базельский университет, Швейцария.

Ян Т. Болдуин, Институт химической экологии Макса Планка, Германия.

Информация о финансировании

Этот документ поддержан следующими грантами:

  • Фонд тихоокеанского лосося SSHI — Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано ДиЧикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Минг, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер.

  • Геном Британская Колумбия SSHI — Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано ДиЧикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Минг, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер.

  • Mitacs SSHI Гидеону Дж. Мордехаю.

Дополнительная информация

Конкурирующие интересы

Конкурирующие интересы не заявлены.

Вклад авторов

Концептуализация, формальный анализ, исследование, визуализация, методология, написание — первоначальный черновик, написание — обзор и редактирование, руководил анализом и подготовил рисунки.

Концептуализация, ресурсы, надзор, привлечение финансирования, расследование, администрирование проекта, написание — обзор и редактирование, задумал исследование.

Формальный анализ, исследование, написание — первоначальный вариант, проведенная патология, гистопатология и гибридизация in situ.

Исследование, методология, проведенное секвенирование, экстракция нуклеиновых кислот и молекулярный анализ.

Исследование, методология, отбор проб в полевых условиях, экстракция нуклеиновых кислот и молекулярные анализы, включая локализацию тканей с помощью ОТ-ПЦР.

Исследование, методология, отбор проб в полевых условиях, экстракция нуклеиновых кислот и молекулярные анализы.

Обработка данных, исследование, методология, проведенные экстракции нуклеиновых кислот и молекулярные анализы.

Обработка данных, отбор проб в полевых условиях, экстракция нуклеиновых кислот и молекулярный анализ.

Исследование, Написание — обзор и редактирование, Отбор проб в полевых условиях, экстракция нуклеиновых кислот и молекулярный анализ.

Концептуализация, исследование, написание — обзор и редактирование, отбор проб в полевых условиях, экстракция нуклеиновых кислот и молекулярный анализ.

Исследование, Написание — обзор и редактирование, Проведенная патология, гистопатология и гибридизация in situ.

Ресурсы, надзор, написание — обзор и редактирование, задумал исследование.

Дополнительные файлы

Дополнительный файл 1.
Таблица праймеров и тестов Taqman, использованных в этом исследовании.
Дополнительный файл 2.
Команды, используемые в биоинформатическом конвейере.
Прозрачная форма отчетности

Доступность данных

Собранные вирусные геномы были депонированы в Genbank под номерами доступа {«type»: «entrez-nucleotide-range», «attrs»: {«text»: «MK611979-MK611996», «start_term»: «MK611979», «end_term»: «MK611996», «start_term_id»: «1726259596», «end_term_id»: «1726259636»}} MK611979-MK611996 и чтения последовательности были отправлены в архив чтения последовательности под доступом : PRJNA547678.

Были созданы следующие наборы данных:

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон , Кертис Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. Архив чтения последовательности NCBI. PRJNA547678

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611979

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611980

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611981

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611982

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611983

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611984

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611985

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611986

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611987

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611988

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611989

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611990

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611991

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611992

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611993

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611994

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис А. Саттл.2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611995

Гидеон Дж. Мордехай, Кристина М. Миллер, Эмилиано Ди Чикко, Анджела Д. Шульце, Кария Х. Каукинен, Тоби Дж. Мин, Шаоронг Ли, Эми Табата, Эми Теффер, Дэвид Паттерсон, Хью В. Фергюсон, Кертис Э. Саттл. 2019. Дикий лосось, находящийся под угрозой исчезновения, заражен недавно обнаруженными вирусами. NCBI Genbank. MK611996

Ссылки

  • Асахида Т., Кобаяши Т., Сайто К. , Накаяма И. Сохранение тканей и экстракция тотальной ДНК из рыб, хранящихся при температуре окружающей среды с использованием буферов, содержащих высокую концентрацию мочевины.Рыболовство. 1996. 62: 727–730. DOI: 10.2331 / fishsci.62.727. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Банкевич А., Нурк С., Антипов Д., Гуревич А.А., Дворкин М., Куликов А.С., Лесин В.М., Николенко С.И., Фам С., Пржибельский А.Д., Пышкин А.В., Сироткин А.В., Вяххи Н., Теслер Г. , Алексеев М.А., Певзнер П.А. SPAdes: новый алгоритм сборки генома и его приложения для секвенирования отдельных клеток. Журнал вычислительной биологии. 2012; 19: 455–477. DOI: 10.1089 / cmb.2012.0021. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Басс А.Л., Хинч С.Г., Теффер А.К., Паттерсон Д.А., Миллер К.М.Промысловый промысел и возбудители инфекционных заболеваний связаны со скоростью передвижения и выживаемостью чавычи во время нерестовых миграций. Рыболовные исследования. 2019; 209: 156–166. DOI: 10.1016 / j. fishres.2018.09.009. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Бимиш Р.Дж., Невилл К., Свитинг Р., Ланге К. Синхронный отказ от выращивания молоди тихоокеанского лосося и сельди в проливе Джорджия в 2007 г. и плохое возвращение нерки в реку Фрейзер в 2009. Морское и прибрежное рыболовство. 2012a; 4: 403–414.DOI: 10.1080 / 19425120.2012.676607. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Бимиш Р.Дж., Свитинг Р.М., Невилл С.М., Ланге К.Л., Бичем Т.Д., Прейкшот Д. Дикий чавычи выживает лучше, чем заводской лосось в период плохого производства. Экологическая биология рыб. 2012b; 94: 135–148. DOI: 10.1007 / s10641-011-9783-5. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Buchfink B, Xie C, Huson DH. Быстрое и чувствительное выравнивание белков с помощью DIAMOND. Природные методы. 2015; 12: 59–60. DOI: 10,1038 / Nmeth.3176. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Бухари К., Малли Г., Гуляева А.А., Чжао Л., Шу Г., Цзян Дж., Нойман Б.В.Описание и начальная характеристика метатранскриптомных нидовирусоподобных геномов из предложенного нового семейства Abyssoviridae и из сестринской группы Coronavirinae, предлагаемого рода Alphaletovirus. Вирусология. 2018; 524: 160–171. DOI: 10.1016 / j.virol.2018.08.010. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Седерхольм С.Дж., Кунце М.Д., Мурота Т., Сибатани А. Туши тихоокеанского лосося: важный вклад питательных веществ и энергии для водных и наземных экосистем.Рыболовство. 1999; 24: 6–15. DOI: 10.1577 / 1548-8446 (1999) 024 <0006: PSC> 2.0.CO; 2. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Часко Б.Э., Каплан И.К., Томас А.С., Асеведо-Гутьеррес А., Норен Д.П., Форд М.Дж., Хэнсон МБ, Скордино Дж.Дж., Джеффрис С.Дж., Маршалл К.Н., Шелтон А.О., Маткин С., Берк Б.Дж., Ward EJ. Конкурирующий компромисс между ростом хищничества морских млекопитающих и промысловым уловом чавычи. Научные отчеты. 2017; 7: 15439. DOI: 10,1038 / s41598-017-14984-8. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Clark TD, Furey NB, Rechisky EL, Gale MK, Jeffries KM, Porter AD, Casselman MT, Lotto AG, Patterson DA, Cooke SJ, Farrell AP, Велч Д.В., Хинч С.Г.Отслеживание смолтов дикой нерки до океана позволяет выявить отдельные регионы ночного движения и высокой смертности. Экологические приложения. 2016; 26: 959–978. DOI: 10.1890 / 15-0632. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • de Wit E, van Doremalen N, Falzarano D, Munster VJ. SARS и MERS: последние сведения о новых коронавирусах. Обзоры природы микробиологии. 2016; 14: 523–534. DOI: 10.1038 / nrmicro.2016.81. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Ди Чикко Э., Фергюсон Х. В., Каукинен К. Х., Шульце А. Д., Ли С., Табата А., Гюнтер О. П., Мордехай Г., Саттл, Калифорния, Миллер К. М..Тот же штамм ортореовируса Piscine (PRV-1) участвует в развитии различных, но связанных заболеваний атлантического и тихоокеанского лосося в Британской Колумбии. Грани. 2018; 3: 599–641. DOI: 10.1139 / Facets-2018-0008. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Geoghegan JL, Di Giallonardo F, Cousins ​​K, Shi M, Williamson JE, Holmes EC. Скрытое разнообразие и эволюция вирусов в товарной рыбе. Эволюция вирусов. 2018; 4: vey031. DOI: 10.1093 / ve / vey031. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Godwin SC, Dill LM, Reynolds JD, Krkošek M. Морские вши, нерка и конкуренция за кормление: паршивая рыба — плохой соперник. Канадский журнал рыболовства и водных наук. 2015; 72: 1113–1120. DOI: 10.1139 / cjfas-2014-0284. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Godwin SC, Krkošek M, Reynolds JD, Rogers LA, Dill LM. Заражение тяжелой морской вшей связано с уменьшением наполнения желудка дикой молоди нерки. Канадский журнал рыболовства и водных наук. 2018; 75: 1587–1595. DOI: 10.1139 / cjfas-2017-0267. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Guindon S, Dufayard JF, Lefort V, Anisimova M, Hordijk W., Gascuel O.Новые алгоритмы и методы для оценки филогении максимального правдоподобия: оценка производительности PhyML 3.0. Систематическая биология. 2010. 59: 307–321. DOI: 10.1093 / sysbio / syq010. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Healy SJ, Hinch SG, Porter AD, Rechisky EL, Welch DW, Eliason EJ, Lotto AG, Furey NB. Маршрутные перемещения и выживание во время ранней морской миграции заводских стальных смолтов Oncorhynchus mykiss в прибрежных районах британской Колумбии. Серия «Прогресс морской экологии». 2017; 577: 131–147.DOI: 10,3354 / meps12238. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Херд В.Р., Шевляков Э., Зикунова О.В., Макникол Р.Э. Чавычи — тренды по численности и биологическим характеристикам. Бюллетень Комиссии по анадромным рыбам северной части Тихого океана. 2007; 4: 77–91. [Google Scholar]
  • Джеффрис К.М., Хинч С.Г., Гейл М.К., Кларк Т.Д., Lotto AG, Кассельман М.Т., Ли С., Речиски Е.Л., Портер А.Д., Велч Д.В., Миллер К.М. Гены иммунного ответа и присутствие патогенов предсказывают выживаемость при миграции в смолтах дикого лосося. Молекулярная экология.2014; 23: 5803–5815. DOI: 10.1111 / mec.12980. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Кале Д., Уикхэм Х. Ggmap: пространственная визуализация с помощью ggplot2. Журнал Р. 2013; 5: 144. DOI: 10.32614 / RJ-2013-014. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Katoh K, Standley DM. Программное обеспечение MAFFT для множественного выравнивания последовательностей, версия 7: улучшения производительности и удобства использования. Молекулярная биология и эволюция. 2013; 30: 772–780. DOI: 10.1093 / molbev / mst010. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Лаурин Э., Харамилло Д., Вандершичел Р., Фергюсон Х., Каукинен К. Х., Шульце А. Д., Кейт И. Р., Гарднер И. А., Миллер К. М..Патогистологические и новые данные высокопроизводительного молекулярного мониторинга выращиваемого лосося (Salmo salar и Oncorhynchus spp.) В Британской Колумбии, Канада, с 2011–2013 гг. Аквакультура. 2019; 499: 220–234. DOI: 10.1016 / j.aquaculture.2018.08.072. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Liang HR, Li YG, Zeng WW, Wang YY, Wang Q, Wu SQ. Патогенность и тканевое распределение реовируса амура после внутрибрюшинного введения. Журнал вирусологии. 2014; 11: 178. DOI: 10.1186 / 1743-422X-11-178. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • McKinnell S, Curchitser E, Groot K, Kaeriyama M, Trudel M.Экстремальные явления в океане и атмосфере побуждают выдвинуть новую гипотезу о переменном выживании в море нерки, обитающей в реке Фрейзер. Океанография рыболовства. 2014; 23: 322–341. DOI: 10.1111 / fog.12063. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Miller KM, Li S, Kaukinen KH, Ginther N, Hammill E, Curtis JM, Patterson DA, Sierocinski T., Donnison L, Pavlidis P, Hinch SG, Hruska KA, Cooke SJ, English KK , Фаррелл А.П. Геномные сигнатуры предсказывают миграцию и нерест дикого канадского лосося. Наука. 2011; 331: 214–217.DOI: 10.1126 / science.1196901. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Миллер К.М., Гарднер И.А., Вандершичел Р., Бернли Т.А., Гинтер Н.Г. Отчет об оценке производительности платформы Fluidigm BioMark для высокопроизводительного микробного мониторинга лосося. Технический отчет; 2016. [Google Scholar]
  • Miller KM, Günther OP, Li S, Kaukinen KH, Ming TJ. Молекулярные показатели развития вирусных заболеваний у диких мигрирующих лососей † Физиология сохранения. 2017; 5: cox036. DOI: 10.1093 / conphys / cox036. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Ниберт М. Л., Дункан Р. Биоинформатика новейших изолятов аква- и ортореовирусов, полученных из рыб: эволюционное усиление или потеря белков FAST и клетчатки, а также таксономические последствия. PLOS ONE. 2013; 8: e68607. DOI: 10.1371 / journal.pone.0068607. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Ноукс Д. Д., Бимиш Р. Дж., Грегори Р. Промышленность коммерческого лосося в Британской Колумбии. Комиссия по анадромным рыбам северной части Тихого океана; 2002 г.[CrossRef] [Google Scholar]
  • Петерман Р.М., Дорнер Б. Повсеместное снижение продуктивности популяций нерки ( Oncorhynchus nerka ) в западной части Северной Америки. Канадский журнал рыболовства и водных наук. 2012; 69: 1255–1260. DOI: 10.1139 / f2012-063. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Price MH, Proboszcz SL, Routledge RD, Gottesfeld AS, Orr C, Reynolds JD. Заражение молоди нерки морскими вошами на фермах по выращиванию морского лосося на западном побережье Канады.PLOS ONE. 2011; 6: e16851. DOI: 10.1371 / journal.pone.0016851. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Shi M, Lin XD, Chen X, Tian JH, Chen LJ, Li K, Wang W, Eden JS, Shen JJ, Liu L, Holmes EC, Чжан Ю.З. История эволюции РНК-вирусов позвоночных. Природа. 2018; 556: 197–202. DOI: 10.1038 / s41586-018-0012-7. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Stenglein MD, Sanders C, Kistler AL, Ruby JG, Franco JY, Reavill DR, Dunker F, Derisi JL. Идентификация, характеристика и культивирование in vitro сильно отличающихся аренавирусов от удавов и кольчатых удавов: кандидаты в этиологические агенты для болезни с тельцами-включениями змей.mBio. 2012; 3: e00180. DOI: 10.1128 / mBio.00180-12. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Thomas AC, Nelson BW, Lance MM, Deagle BE, Trites AW. Морские тюлени охотятся на молодь лосося, имеющую значение для сохранения. Канадский журнал рыболовства и водных наук. 2017; 74: 907–921. DOI: 10.1139 / cjfas-2015-0558. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Вальдес-Доносо П. , Мардонес Ф.О., Джарпа М., Уллоа М., Карпентер Т.Э., Перес А.М. Модели коинфекции инфекционной анемии лосося и морских вшей у выращиваемого атлантического лосося, Salmo salar L., на юге Чили (2007-2009) Journal of Fish Diseases. 2013; 36: 353–360. DOI: 10.1111 / jfd.12070. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Wang Q, Zeng W, Liu C, Zhang C, Wang Y, Shi C, Wu S. Полная последовательность генома реовируса, выделенного из белого амура, что указывает на различные генотипы GCRV в Китай. Журнал вирусологии. 2012; 86: 12466. DOI: 10.1128 / JVI.02333-12. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Вассер С.К., Лундин Д.И., Эйрес К., Сили Э., Джайлз Д., Балкомб К., Хемпельманн Дж., Парсонс К., Бут Р.Рост популяции ограничен влиянием питания на успешность беременности у находящихся под угрозой исчезновения южных косаток (Orcinus orca) PLOS ONE. 2017; 12: e0179824. DOI: 10.1371 / journal.pone.0179824. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Weiss SR, Leibowitz JL. Патогенез коронавируса. Достижения в вирусных исследованиях. 2011. 81: 85–164. DOI: 10.1016 / B978-0-12-385885-6.00009-2. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Wickham H. Ggplot2: Элегантная графика для анализа данных.Второе издание. Springer; 2016. [Google Scholar]
  • Willson MF, Halupka KC. Проходные рыбы как краеугольные камни сообществ позвоночных. Биология сохранения. 1995; 9: 489–497. DOI: 10.1046 / j.1523-1739.1995.0
    • 89.x. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Винтон Дж. Р., Ланнан С. Н., Фрайер Дж. Л., Кимура Т. Выделение нового реовируса из кеты в Японии. Патология рыб. 1981; 15: 155–162. DOI: 10.3147 / jsfp.15.155. [CrossRef] [Google Scholar]
  • Yun NE, Walker DH. Патогенез лихорадки ласса.Вирусы. 2012; 4: 2031–2048. DOI: 10.3390 / v4102031. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
  • Zhang YZ, Chen YM, Wang W, Qin XC, Holmes EC. Расширение виросферы РНК с помощью беспристрастной метагеномики. Ежегодный обзор вирусологии. DOI 2019: 10.1146 / annurev-virology-0

    -015851. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

Морские препараты | Бесплатный полнотекстовый | Побочные потоки лосося (Salmo salar) как биоресурсы для получения потенциальных антиоксидантных пептидов после применения жидкой экстракции под давлением (PLE)

909 PLG 909 909 9019 9019 909 GPL-3 цепи коллагена GIP-3PG 9019 909 VGP 909 909 9019 909 GPP цепочка GPP 909 GPP 909 909 GPP 909 909 GPP 909 909 GPP6 909 9019 9019 909 GPGGGPGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG 909 909 2 2 2 909 902 GPL 909 PL 909 Коллаген 905 GIP 909 PL 909 909 9018EPG9 909 909 819 819091

1

909.53 2 G09 G019 9019 9018 G0919 909 G0919.83 VS VS 67918 2 9019 9019 9019 9019 9019 9019 9019 9019 9019 9019 9019 9019 909 SG6.97 909 I 909IG 909 I Коллаген SIG 909 I КоллагенTNDGITDNDV9 9018SEGTS 909 909 ACG 909 G0919 909 909 9ACG 909 909 909 ACG 909 909 909 909 ACG 909 909 9909
Цепь альфа-2 (I) коллагена GESGPTGNGGPVGA 1155.52 578,77 2
Цепь альфа-2 (I) коллагена GPAGPHGPPG 842,4 422,21 2
Цепь альфа-2 GIT9 I
I коллаген GIT9 707,85 2
Неохарактеризованный белок семейства PE-PGRS GGNGGAGGAGGNGGAGGLGG 1370,62 686,32 2
410,73 2
Коллагеновая альфа-3 (V) цепь GIPGPLGPLGP 973,52 487,77 2
422,21 2
Цепь альфа-1 (I) коллагена GETGPAGPAG 812,4 407,21 2
Цепь альфа-1 (I918) коллагена 597,81 2
Глицин-богатый белок DOT1 GGGGGHGGGGAGGGGGGGPGG 1292,58 647,3 2 2 1292,58 647,3 2 2
Вероятный белок теплового шока ssa1 PGGAPGGMPGGAP 1021,47 511. 74 2
Антиген WAG22 PAGGTAAGGAG186 655,31 2
Цепь альфа-1 (I) коллагена GETGPAGPAG 812,4 407,21 2
Гистон
 909 909 909 909 918 909 909 909 909 918
Белок теплового шока 60 кДа, митохондриальный VGGTSDVEVNEK 1232,58 617,3 2
Коллаген альфа-1 (XXII) цепь GYAKG9. 76 828,89 2
Filamin-A VITPEEIVDPNVDEH 1704,81 569,28 3
Glycine-богатая клеточная стенка 12199 90G18 90G18 Glycine-богатая клеточная стенка
Фумарилацетоацетаза IGVAIGDQILDLSVIK 1652,97 827,49 2
Легочный сурфактант-ассоциированный белок A GPLGPPG GPLGPPG53 537,27 2
Цепь альфа-1 (I) коллагена GETGPAGPAG 812,4 407. 21 2
Цепь коллагена альфа-419 (IVFPG)
90GPG909 804,89 2
Член семейства белков, взаимодействующих с WAS / WASL GGGGGGGGGGGSGGNFGGGGPP 1586,64 794,33 2denQL9 794,33 2denQylase 794.33 2denQylase 749,4 3
белок Forkhead коробки К1 QPPPGPPPPPP 1076,55 539,28 2
экзоцисты сложный компонент SEC5 ALMILIVVHSECFR 1629,91 815,96 2
тРНК диметилаллилтрансфераза EAARDGWPAL 1084,53 543,27 2
оротидин 5′-фосфат декарбоксилаза RPAGAEAG9. 54 550,28 2
Homogentisate 1,2-диоксигеназа GPIGSNGLANPR 1152,52 577,27
Wolframin NTAPLGPSCPQPPPAP 1508,68 755,35
Кератин, тип II цитоскелета I TALGGAAGGMGGGGGMGGGM 1538,63 770,32
Интегринзависимая-сшитый-киназа-associated- серин /
треонин фосфатазы 2C GLPPAGSGNSGSLATSGS 1515. 64 758,83 2
Коллагеновая альфа-4 (IV) цепь ACAGMIGPPGPQGFP 1399,63 467,55 2
487,77 2
Белок, связывающий жирные кислоты, печень AIGLPDDLIQK 1181,67 591,84 2
V9G19D-9018, связанный с Actin. 47 500,24 2
Коллаген альфа-1 (I), цепь GAPGPVGPAGKGETGPAGPAGPAG 1925,86 963,94 2
Сопровождающий белок DnaK QAGEGGAGAGAGAAG 1100,52 551,27 2
Цепь альфа-2 (V) коллагена GNPGPLGPIGP 974,52 488,27 2
Цепь альфа-1 (XVIII) коллагена LPGPPG9. 79 833,9 2
Pote членом домена анкириновых семейства Е VMDSGDGVTH 1016,43 509,22 2
охарактеризованных белок SE_1560 GPLVLVDTDDL 1155,61 578,81 2
Сывороточный альбумин 1 AIQPDTEFTPPELDASS 1816,84 909,43 2
Фосфоенолпируват-гуанилилтрансфераза SLAML 1257. 73 629,87 2
Коллагеновая альфа-1 (I) цепь AGPPGADGQPGAK 1164,55 583,28 2
DPV 9 90-919
DPV 9 (цитозатраза 9) 535,26 2
Белковый шрум4 SQAPESHESRTGL 1397.61 699.81 2
PAGPG18 909 гомолог PAG9G18 597,29 2
Магний-хелатазы 38 кДа субъединицей QSGENVVERDGL 1301,6 651,81 2
уропорфириноген декарбоксилазы DVAVQGNLDPL 1139,61 570,81 2
Цепь альфа-1 (I) коллагена AGAQGAPGPAGPA 1021,47 511,74 2
Цепь альфа-3 (V) коллагена GIPGPLGPLGP 97353 487,77 2
Актин-родственный белок 3 DSGDGVTH 786,32 394,17 2
tRNA-N6oyon 9018 9018 9018 9018 lтрансфераза LSLVVSGGHTELVL 1422,69 712,35 2
Calpain-12 AGTGAGGPQ 714,2 35819
  		•  2
    Коллаген альфа-1 (XVII), цепь QNLVGPPGPPGPPGVSGD 1623,77 812,89 2
    Fumarylacetoacetase IGVAIGDQILDLSVIK 1652,97 552 3
    Возможная аквапорин PIP2-6 DINAGGGACASVGLL 1316. 67 659,34 2
    60 кДа шаперонин AAVEEGIVAGGGTAF 1347.58 674,8 2
    Аргинин киназы KGDRFLEAAGVNKLWPE 1928.92 965,47 2
    Коллаген альфа-2 (I), цепь GETGSAGITGPAGPR 1326,65 664,33 2
    Цитоплазматическая легкая промежуточная цепь динеина 1 1 TGSPGGPGVSGGSPAGGAG 1425. 64 713,83 2
    Коллаген альфа-2 (I) цепь 909GPG11 909GPG9.63 706.82 2
    Коллагеновая альфа-1 (I) цепь AKGDTGAPGAPGSQGAP 1437.68 719.85 2 719.85 2 ZEGG9 909 909 FingerP 9018 ZEGG9 909 3
    Цепь альфа-2 (IV) коллагена PGEKGDAGLPGLSGK 1363.64 682,83 2
    Цепь альфа-2 (I) коллагена GPTGA2 (I) цепь GPTGA42 442,22 2
    Фактор инициации трансляции IF-2 GGGGGAPGRPGGGGGGGGAP 1405,65 703,83 2 909 909 909 909 9019 9019 9019 9019 9019 9019 9019 9019 9019 9019 90P 909 GP-цепь GPL-909 GP-90P 909 GP-909-909-909-9-9-9-9-G-9-9-G-9-9 2
    Серин / треонин-протеинкиназа ATG1 ESNMFVSEYL 1217,56 609,79 2
    АТФ-зависимая REG18 RNA 13 909DP-геликаза 909 657,34 2
    нуклеозиддифосфат киназы B ETNPADSKPGSI 1214,58 608,3 2
    глюкозильная-3-фосфоглицерат-синтазы VAGDLAGGRAPGALP 1320,64 661,33 2
    Цепь альфа-6 (IV) коллагена VGPLGPSG 682,33 342,17 2
    Цепь альфа-3 (V) коллагена GIPGPLGPLGP18 973 487,77 2
    5′-3′ exoribonuclease 2 NNGGGGGGYGGQP 1090,51 546,26
    ПЭ-РРР белок семейства PE_PGRS30 NGGAAGLIGNGGAGGAGGAGGAG 1639,72 820,87 2
    Белок FAM81B DTNVNKSASPTATAEEQPVEP 2184.09 1093.05 2
    EPS ubiquitin-protein ligase
    EPS ubiquitin-протеин лигаза 909GAFOR18 909 DTNVNKSASPTATAEEQPVEP 909.7 560,91 3
    (R) -2-гидроксиглутарил-КоА-дегидратаза
    , активирующая АТФазу 906ADK 909 909 9018 9019 909 9018 GSCEL19 909 MSC 9018 9018
    , содержащий нехарактерные повторы TPR
    белок At1g05150 DALGLELNADE 1158.57 580.29 2
    Коллагеновая альфа-1 (I) цепь DGNPGLPGPPGPPGPPG 1492.69 747.35 2 member G0919 2 member
    2
    Цепь альфа-2 (IV) коллагена EVLGAQPGTRGDAGLPGQPG 1875.93 626,32 3
    MTOR-21KL MEAKL09 DVDGKSS-ассоциированный белок MEAK7.05 1064,03 2
    Преобразование белка Maf GSAAAVVSAVIAAA 1156,53 579,27 2
    Глицин-дегидрогеназа (декарбоксилирование) PGAMGADIAIG 971,4 486,71 2
    L-лактатдегидрогеназа A-подобный 6B SVADLTESILK 1174,65 392,56 3
    CTP-синтаза PDGKLVEICEVTGHPF 870.92 2
    Коллагеновая альфа-3 (V) цепь GIPGPLGPL 819.45 410.73 2
    14909
    14GG9 909 G18 909 G18 909 G18 909 G18 909 G19 909 G18 909 G18 909 G18 909 G18 909 G18 909 G189 2
    глицеральдегид-3-фосфат-дегидрогеназы 1 TVDGPSGK 759.37 380,69 2
    UDP-3-О-acylglucosamine N-ацилтрансфераза ADGFGFAPDFGPQGGEW 1753.78 877,9 2
    Белок покалывание GGGAGGSSGGPGGADAAAAPAAGQ 1767,76 884,89 2
    гистонов h3a AQGGVLPNIQ 995,54 498,78 2
    Предполагаемые кутикулы коллагена 155 GPSGPNGNPGAPGAPGQ 1430.71 716,36 2
    Домен BTB / POZ и анкириновый повтор —, содержащий1 GGAGGGGGAP 656,34 329,18 2
    ПЭ-РРР белок семейства PE_PGRS5 GAGGKGGNGGTGGAGGPGG 1341,64 671,83 2
    Коллаген альфа-5 (IV), цепь PGIPGIGLPGPPGPKGFPGIP 1947 974,51 2
    Глутаматдегидрогеназа 1, митохондриальная IGPGIDVPAPDMSTGE 1554,73 778.37 2
    Цепь альфа-2 (IV) коллагена SGPSGIPGLPGPKGEPGY 1665.76 833,89 2
    Цепь альфа-1 коллагена 0918
    Коллаген альфа-1 9019 9019,69 2
    Гомолог фактора, связанного с каналом TRPM8 SEAVQTNLVPFFEAWGWPI 2190.1 1096.06 2
    Коллаген альфа-4 (IV18) Коллаген альфа-4 (IV18) цепочка GPGPG976 820,89 2
    Эластин VPGAVPGGVP 848,44 425,23 2
    Мультирезистентный белок сопротивления PE_PGR46 IMVVVQPFVLVAI 1426,82 714,42 2
    неохарактеризованных ПЭ Белок семейства -PGRS PE_PGRS46 GDGAPGGDGGAGPLLIGNG 1550.68 776,35 2
    Член семейства анкириновых доменов POTE E SGDGVTH 67119 909.29 336,65 2
    Белок, связанный с актином 3 SEVVDEVIQN 1130,54 566,28 2
    Protein Wiz GPERLPGPAPRENIEGGAE 1944.94 973,48 2
    ДНК-направленная субъединица РНК-полимеразы бета GKPIPES19.53 562,27 2
    гистонов h3a AQGGVLPNIQ 995,54 498,78 2
    рибулоза бисфосфаткарбоксилаза / оксигеназа Activase 2, хлорпластический TLMNIADNPTNVQLP 1639,72 820,87 2
    FT-взаимодействующий белок 1 PEVFVKAQVGNQILK 1668,86 835,43 2
    Цепь альфа-2 (I) коллагена GAVGPVG44 405,23 2
    Коллаген альфа-2 (I), цепь GPIGPPGNPGA 932,47 467,24 2
    полирибонуклеотиду нуклеотидилтрансфераза TEAVVAEGLEAAKP 1383,75 692,88 2
    Предполагаемый коллаген кутикулы 145 EGPAGPAGPAGPDGQPGA 1501.64 751,83 2
    Contactin-3 VSGGGGSVPELVITW 1 956,99 2
    Коллаген альфа-1 (III) цепь EPGQAGPAGPPGPPG 1285.6 1286.61 1
    534,26 2
    Изоформа X3 цепи альфа-2 (I) коллагена GDPGPGGPQGEPGAVGPAGITGDKGPSGES 2601.2 868.08 Unchara 916 749,4 3
    кальмодулин IDQLTEEQIAEF 1434,65 718,33 2
    митохондриальной деления регулятора HLSLPRFFPSRTGE 1643,18 548,73 3
    Коллаген, тип V, alpha 3a LIDVLRVLELSEDMEGVSV 2114.92 1058.47 2
    Si: dkey-237h22.3 ELDASNMGGWSLDK.81 761,91 2
    охарактеризованных белок Salmo Truta AGAEGFDDIK 1021,47 511,74 2
    жирной кислоты-связывающий белок, печень AIGLPDDLIQK 1181,67 591,84 2
    Неохарактеризованный белок Sinocyclocheilus
    anshuiensis DVFRDGFTMDT 1302.61 652,31 2
    Цепь альфа-4 (IV) коллагена GSSPIGPPGSPGSPGASGQ 1592,74 797,38 2 797,38 2 797,38 2
    2
    D-допахромдекарбоксилаза MIVVVKPGLPMLM 1426,82 714,42 2
    Неизвестный белок OSFF9 8199PK5351 2
    Фумарилацетоацетаза IGVAIGDQILDLSVIK 1652.97 827,49 2

    Дифференциальный ответ на фазу диеты личинок пищеварительной системы и слизистой оболочки черной мухи Атлантический лосось (Salmo salar)

    Справочная информация: Пищеварительный пищеварительный тракт обычно используется для изучения реакции микробиоты на изменения в питании, однако накапливаются доказательства того, что он представляет собой неполное представление о микробиоте кишечника.Настоящая работа направлена ​​на изучение различий между микробиотой кишечника, связанной с пищеварением и слизистой оболочкой, у атлантического лосося ( Salmo salar ) и того, как они могут по-разному реагировать на нарушения питания. В 16-недельном испытании кормления морской водой атлантического лосося кормили либо коммерчески значимым эталонным рационом, либо рационом из муки насекомых, содержащим ~ 15% муки из личинок черной солдатской мухи ( Hermetia illucens ) . Микробиота дистального отдела кишечника, связанная с пищеварением и слизистой оболочкой, была профилирована с помощью секвенирования гена 16S рРНК.

    Результаты: Независимо от диеты, мы наблюдали существенные различия между микробиотой кишечника, связанной с пищеварением и слизистой оболочкой. Богатство и разнообразие микробов в пищеварительном тракте было намного выше, чем в слизистой оболочке. Рацион из насекомых изменил микробиоту дистальных отделов кишечника, что привело к увеличению микробного богатства и разнообразия. Однако эффект диеты зависел от происхождения образца. Микробиота кишечника, связанная с пищеварением, показала более выраженные изменения, чем микробиота слизистой оболочки.Многофакторный ассоциативный анализ выявил два таксона, обогащенных слизистой оболочкой, Brevinema andersonii и Spirochaetaceae , связанных с экспрессией генов, связанных с иммунными ответами и барьерной функцией в дистальном отделе кишечника, соответственно.

    Выводы: Наши данные показывают, что кишечник лосося и слизистая оболочка содержат микробные сообщества с явными различиями. Кишечная микробиота, связанная со слизистой оболочкой, кажется более устойчивой к изменениям в составе диеты, чем кишечная микробиота, связанная с пищеварением.Чтобы полностью раскрыть реакцию кишечной микробиоты на диетические изменения, рекомендуется, когда это возможно, одновременное профилирование кишечной микробиоты, связанной с пищеварением и слизистой оболочкой.

    Ключевые слова

    Атлантический лосось, диета, черная солдатская мушка, микробиота, дигеста, слизистая оболочка

    Приманка на щуку на лосося Twitchbait Real Pike RPE Fishing Lures Powderhousebend.com

    Приманка для щуки Salmo Twitchbait Real Pike RPE, 16 см, плавающая 52 г: Спорт и активный отдых.Воблер Salmo Pike Lure Twitchbait Real Pike RPE, 16см, плавающий, 52г. Бесплатная доставка и возврат для всех подходящих заказов .. Производитель: Salmo。 Товар: Щука。 Цвет: Настоящая щука。 Размер: 16 см。 Производитель: Salmo。


    Воблер на щуку Salmo Twitchbait Real Pike RPE

    Desert / Camo Red Osaka Sox 36-40, Купальный костюм Alyberry для малышей, детский плавучий костюм с регулируемой плавучестью, GOTOTOP Силиконовый полусекундный передний ПВХ регулируемая маска для плавания из закаленного стекла и трубка для взрослых.Ranuw Велосипедная Передняя Задняя Крышка Вилки Защитная Резина Защита от Царапин Детали Цепи, Детская Яичная кожа Дороти Смолл. Зеленые три вращающихся шипастых спортивного массажного ролика для мышц для расслабления тела. Роликовый ролик для восстановления тела. Роликовый спортивный массаж ， Эффективен при лечении мышечной боли и триггерных точек на холодных мышцах. Чехол Veapero Samsung Galaxy S10E, противоударный чехол-книжка с откидной крышкой из искусственной кожи с магнитной застежкой Держатель карты ID слот Фолио Мягкий бампер из ТПУ Защитная кожа, роза, BSTQC 12 шт. / Компл. Воланы для бадминтона Белые мячи для бадминтона Спорт на открытом воздухе Аксессуары для бадминтона.Hurley Mens M Bp Toucan 18 Boardshort, футболка для детей с гербом Ливерпуля, официальный подарок футбольного клуба, теннисная обувь Wilson Unisex Kids ’Stroke Jr. Цепь Onguard Beast 110 см X 12 мм и замок Boxer Pad Lock. 4 режима яркости. Высокая интенсивность. 28 светодиодных фонарей Digiflex LED. Водонепроницаемость. DERUIZ Bafang Motor BBS01B BBS02B 36V 250W 350W 500W Комплект для переоборудования электрического велосипеда Комплекты электродвигателя со средним приводом Комплект электронного велосипеда с литий-ионным аккумулятором и зарядным устройством для городского шоссейного велосипеда. PETZL Ice Axes Adult Glacier.


    Розничная торговля

    Powder House предлагает самый большой выбор лыж, досок, ботинок и креплений в Центральном Орегоне от ведущих производителей отрасли.

    Читать далее
    Аренда

    Наш новый прокат горнолыжных лыж включает более 100 демонстрационных лыж. Мы также сдаем в аренду сноуборды, беговые лыжи и снегоступы взрослых и молодежных размеров.

    Читать далее
    Услуги

    Центр настройки и ремонта мирового класса от лыжника до гонщика. Возможна ночная настройка и восковая эпиляция.

    Читать далее
    Лента Facebook

    Страница не найдена | Офис научных публикаций

    — Любые -MFR 32 (1) MFR 82 (3-4), 2020MFR 82 (1-2), 2020MFR 81 (3-4), 2019MFR 81 (2), 2019MFR 81 (1), 2019MFR 80 (4), 2018МФР 80 (3), 2018МФР 80 (2), 2018МФР 80 (1), 2018МФР 79 (3-4), 2017МФР 79 (2), 2017МФР 79 (1), 2017МФР 78 (3-4), 2016МФР 78 (1) -2), 2016MFR 77 (4), 2015MFR 77 (3), 2015MFR 77 (2), 2015MFR 77 (1), 2015MFR 76 (4), 2014MFR 76 (3), 2014MFR 76 (1-2), 2014MFR 75 (4), 2013MFR 75 (3), 2013MFR 75 (1-2), 2013MFR 74 (4), 2012MFR 74 (3), 2012MFR 74 (2), 2012MFR 74 (1), 2012MFR 73 (4), 2011MFR 73 (3), 2011МФР 73 (2), 2011МФР 73 (1), 2011МФР 72 (4), 2010МФР 72 (3), 2010МФР 72 (2), 2010МФР 72 (1), 2010МФР 71 (4), 2009МФР 71 (3) ), 71 (2) 2009 г., 71 (1) 2009 г., 70 (3–4) 2009 г., 70 (2) 2008 г., 70 (1) 2008 г., 69 (1-4), 2007 г. 68 (1-4), 2006MFR 67 (4), 2005MFR 67 (3), 2005MFR 67 (2), 2005MFR 67 (1), 2005MFR 66 (4), 2004MFR 66 (3), 2004MFR 66 (2), 2004MFR 66 (1), 2004MFR 65 (4), 2003MFR 65 (3), 2003MFR 65 (2), 2003MFR 65 (1), 2003MFR 64 (4), 2002MFR 64 (3), 2002MFR 64 (2), 2002MFR 64 (1), 2002MFR 63 (4) ), 2001MFR 63 (3), 2001MFR 63 (2), 2001MF 63 (1), 2001MFR 62 (4), 2000MFR 62 (3), 2000MFR 62 (2), 2000MFR 62 (1), 2000MFR 61 (4), 1999MFR 61 (3), 1999MFR 61 (2), 1999MFR 61 (1), 1999MFR 60 (4), 1998MFR 60 (3), 1998MFR 60 (2), 1998MFR 60 (1), 1998MFR 59 (4), 1997MFR 59 (3), 1997MFR 59 (2), 1997MFR 59 (1) ), 1997MFR 58 (4), 1996MFR 58 (3), 1996MFR 58 (1-2), 1996MFR 57 (3-4), 1995MFR 57 (2), 1995MFR 57 (1), 1995MFR 56 (4), 1994MFR 56 (3), 1994MFR 56 (2), 1994MFR 56 (1), 1994MFR 55 (4), 1993MFR 55 (3), 1993MFR 55 (2), 1993MFR 55 (1), 1993MFR 54 (4), 1992MFR 54 (3) ), 1992MFR 54 (2), 1992MFR 54 (1), 1992MFR 53 (4), 1991MFR 53 (3), 1991MFR 53 (2), 1991MFR 53 (1), 1991MFR 52 (4), 1990MFR 52 (3), 1990MFR 52 (2), 1990MFR 52 (1), 1990MFR 51 (4), 1989MFR 51 (3), 1989MFR 51 (2), 1989MFR 51 (1), 1989MFR 50 (4), 1988MFR 50 (3), 1988MFR 50) (2), 1988MFR 50 (1), 1988MFR 49 (4), 1987MFR 49 (3), 1987MFR 49 (2), 1987MFR 49 (1), 1987MFR 48 (4), 1986MFR 48 (3), 1986MFR 48 (2) ), 1986MFR 48 (1), 1986MFR 47 (4), 1985MFR 47 (3), 1985MFR 47 (2), 1985MFR 47 (1), 1985MFR 46 (4), 1984MFR 46 (3), 1984MFR 46 (2), 1984МФР 46 (1 ), 1984MFR 45 (10-12), 1983MFR 45 (7-9), 1983MFR 45 (4-6), 1983MFR 45 (3), 1983MFR 45 (2), 1983MFR 45 (1), 1983MFR 44 (12), 1982MFR 44 (11), 1982MFR 44 (8), 1982MFR 44 (6-7), 1982MFR 44 (5), 1982MFR 44 (4), 1982MFR 44 (3), 1982MFR 44 (2), 1982MFR 44 (1), 1982MFR 44 (9-10), 1982MFR 43 (12), 1981MFR 43 (11), 1981MFR 43 (10), 1981MFR 43 (9), 1981MFR 43 (8), 1981MFR 43 (7), 1981MFR 43 (6), 1981MFR 43 (5), 1981MFR 43 (4), 1981MFR 43 (3), 1981MFR 43 (2), 1981MFR 43 (1), 1981MFR 42 (12), 1980MFR 42 (11), 1980MFR 42 (9-10), 1980MFR 42 (7-8), 1980MFR 42 (6), 1980MFR 42 (5), 1980MFR 42 (3-4), 1980MFR 42 (2), 1980MFR 42 (1), 1980MFR 41 (12), 1979MFR 41 (11) ), 1979MFR 41 (10), 1979MFR 41 (9), 1979MFR 41 (8), 1979MFR 41 (7), 1979MFR 41 (5-6), 1979MFR 41 (4), 1979MFR 41 (3), 1979MFR 41 (1) -2), 1979MFR 40 (12), 1978MFR 40 (11), 1978MFR 40 (10), 1978MFR 40 (9), 1978MFR 40 (8), 1978MFR 40 (7), 1978MFR 40 (5-6), 1978MFR 40 (4), 1978 MFR 40 (3), 1978 MFR 40 (2), 1978 MFR 40 (1), 1978 MFR 39 (12) MFR 39 (11) MFR 39 (10) MFR 39 (9) MFR 39 (8) MFR 39 ( 7) СТР 39 (6) СТР 39 (5) М FR 39 (4) MFR 39 (3) MFR 39 (2) MFR 39 (1) MFR 38 (12) MFR 38 (11) MFR 38 (10) MFR 38 (9) MFR 38 (8) MFR 38 (7) MFR 38 (6) MFR 38 (5) MFR 38 (4) MFR 38 (3) MFR 38 (2) MFR 38 (1) MFR 37 (12) MFR 37 (11) MFR 37 (10) MFR 37 (9) MFR 37 (8) MFR 37 (7) MFR 37 (5-6) MFR 37 (4) MFR 37 (3) MFR 37 (2) MFR 37 (1) MFR 36 (12) MFR 36 (11) MFR 36 ( 10) MFR 36 (9) MFR 36 (8) MFR 36 (7) MFR 36 (6) MFR 36 (5) MFR 36 (4) MFR 36 (3) MFR 36 (2) MFR 36 (1) MFR 35 ( 12) MFR 35 (11) MFR 35 (10) MFR 35 (9) MFR 35 (8) MFR 35 (7) MFR 35 (5-6) MFR 35 (3-4) MFR 35 (1-2) MFR 34 (11-12) MFR 34 (9-10) MFR 34 (7-8) MFR 34 (5-6) MFR 34 (3-4) MFR 34 (1-2) MFR 33 (11-12) MFR 33 ( 10) MFR 33 (9) MFR 33 (7-8) MFR 33 (6) MFR 33 (5) MFR 33 (4) MFR 33 (3) MFR 33 (2) MFR 33 (1) MFR 32 (12) MFR 32 (11) MFR 32 (10) MFR32 (8-9) MFR 32 (7) MFR 32 (6) MFR 32 (5) MFR 32 (4) MFR 32 (3) MFR 32 (2) MFR 32 (1) MFR 31 (12) MFR 31 (11) MFR 31 (10) MFR 31 (8-9) MFR 31 (7) MFR 31 (6) MFR 31 (5) MFR 31 (4) MFR 31 (3) MFR 31 ( 2) MFR 31 (1) MFR 30 (12) MFR 30 (11) MFR 30 (10) MFR 30 (8-9) MFR 30 (7) MFR 30 (6) MFR 30 (5) MFR 30 (4) MFR 3 0 (3) MFR 30 (2) MFR 30 (1) MFR 29 (12) MFR 29 (11) MFR 29 (10) MFR 29 (8-9) MFR 29 (7) MFR 29 (6) MFR 29 (5 ) MFR 29 (4) MFR 29 (3) MFR 29 (2) MFR 29 (1) MFR 28 (12) MFR 28 (11) MFR 28 (10) MFR 28 (9) MFR 28 (8) MFR 28 (7 ) MFR 28 (6) MFR 28 (5) MFR 28 (4) MFR 28 (3) MFR 28 (2) MFR 28 (1) MFR 27 (12) MFR 27 (11) MFR 27 (10) MFR 27 (9 ) MFR 27 (8) MFR 27 (7) MFR 27 (6) MFR 27 (5) MFR 27 (4) MFR 27 (3) MFR 27 (2) MFR 27 (1) MFR 26 (12) MFR 26 (11a ) MFR 26 (11) MFR 26 (10) MFR 26 (9) MFR 26 (8) MFR 26 (7) MFR 26 (6) MFR 26 (5) MFR 26 (4) MFR 26 (3) MFR 26 (2 ) MFR 26 (1) MFR 25 (12) MFR 25 (11) MFR 25 (10) MFR 25 (9) MFR 25 (8) MFR 25 (7) MFR 25 (6) MFR 25 (5) MFR 25 (4 ) MFR 25 (3) MFR 25 (2) MFR 25 (1) MFR 24 (12) MFR 24 (11) MFR 24 (10) MFR 24 (9) MFR 24 (8) MFR 24 (7) MFR 24 (6) ) MFR 24 (5) MFR 24 (4) MFR 24 (3) MFR 24 (2) MFR 24 (1) MFR 23 (12) MFR 23 (11) MFR 23 (10) MFR 23 (9) MFR 23 (8 ) MFR 23 (7) MFR 23 (6) MFR 23 (5) MFR 23 (4) MFR 23 (3) MFR 23 (2) MFR 23 (1) MFR 22 (12) MFR 22 (11) MFR 22 (10) ) MFR 22 (9) MFR 22 (8) MFR 22 (7) MFR 22 (6) MFR 22 (5) MFR 22 (4) MFR 22 (3) MFR 22 (2) MFR 22 (1) MFR 21 (12) MFR 21 (11) MFR 21 (10) MFR 21 (9) MFR 21 (8) MFR 21 (7) MFR 21 (6) MFR 21 (5) MFR 21 (4) MFR 21 (3) MFR 21 (2a) MFR 21 (2) MFR 21 (1) MFR 20 (12) MFR 20 (11a) MFR 20 (11) MFR 20 (10) MFR 20 (9) MFR 20 (8) MFR 20 (7) MFR 20 (6) MFR 20 (5) MFR 20 (4) MFR 20 (3) MFR 20 (2) MFR 20 (1) MFR 19 (12) MFR 19 (11) MFR 19 (10) MFR 19 (9) MFR 19 (8) MFR 19 (7) MFR 19 (6) MFR 19 (5a) MFR 19 (5) MFR 19 (4a) MFR 19 (4) MFR 19 (3) MFR 19 (2) MFR 19 (1) MFR 18 (12) MFR 18 (11) MFR 18 (10) MFR 18 (9) MFR 18 (8) MFR 18 (7) MFR 18 (6) MFR 18 (5) MFR 18 (4) MFR 18 (3) MFR 18 (2) MFR 18 (1) MFR 17 (12) MFR 17 (11) MFR 17 (10) MFR 17 (9) MFR 17 (8) MFR 17 (7) MFR 17 (6) MFR 17 (5) MFR 17 (4) MFR 17 (3) MFR 17 (2) MFR 17 (1) MFR 16 (12) MFR 16 (11) MFR 16 (10) MFR 16 (9) MFR 16 (8) MFR 16 (7) MFR 16 (6) MFR 16 (5) MFR 16 (4) MFR 16 (3) MFR 16 (2) MFR 16 (1) MFR 15 (12) MFR 15 (11) MFR 15 (10) MFR 15 (9) MFR 15 (8) MFR 15 (7) MFR 15 (6) MFR 15 (5) MFR 15 (4) MFR 15 (3) MFR 15 (2) MFR 15 (1) MFR 14 (12) MFR 14 (12a) MFR 14 (11) MFR 14 (10) MFR 14 (9) MFR 14 (8) MFR 14 (7) MFR 1 4 (6) MFR 14 (5) MFR 14 (4) MFR 14 (3) MFR 14 (2) MFR 14 (1) MFR 13 (12) MFR 13 (11a) MFR 13 (11) MFR 13 (10) MFR 13 (9) MFR 13 (8) MFR 13 (7) MFR 13 (6) MFR 13 (5) MFR 13 (4) MFR 13 (3) MFR 13 (2) MFR 13 (1) MFR 12 (12) MFR 12 (11a) MFR 12 (11) MFR 12 (10) MFR 12 (9) MFR 12 (8) MFR 12 (7) MFR 12 (6) MFR 12 (5) MFR 12 (4) MFR 12 (3) MFR 12 (2) MFR 12 (1) MFR 11 (12) MFR 11 (11) MFR 11 (10) MFR 11 (9) MFR 11 (8) MFR 11 (7) MFR 11 (6) MFR 11 (5) MFR 11 (4) MFR 11 (3) MFR 11 (2) MFR 11 (1) MFR 10 (12) MFR 10 (11) MFR 10 (10) MFR 10 (9) MFR 10 (8) MFR 10 (7) MFR 10 (6) MFR 10 (5) MFR 10 (4) MFR 10 (3) MFR 10 (2) MFR 10 (1) MFR 9 (12) MFR 9 (11) MFR 9 (10) MFR 9 (9) MFR 9 (8) MFR 9 (7) MFR 9 (6) MFR 9 (5) MFR 9 (4) MFR 9 (3) MFR 9 (2) MFR 9 (1) MFR 8 (12) MFR 8 (11a) MFR 8 (11) MFR 8 (10) MFR 8 (9) MFR 8 (8) MFR 8 (7) MFR 8 (6) MFR 8 (5) MFR 8 (4) MFR 8 (3) MFR 8 (2) MFR 8 (1)

    СИМПОЗИУМ ПО МЕТОДОЛОГИИ ИЗУЧЕНИЯ, МОНИТОРИНГА И ОЦЕНКИ РЫБОЛОВНЫХ РЕСУРСОВ ОЗЕР И БОЛЬШИХ РЕК

    СИМПОЗИУМ ПО МЕТОДОЛОГИИ ИЗУЧЕНИЯ, МОНИТОРИНГА И ОЦЕНКИ РЫБОЛОВНЫХ РЕСУРСОВ И РЫБОЛОВНЫХ РЕСУРСОВ ОЗЕР

    по номеру

    Паркер С.Трефетен и Джеральд Б. Коллинз
    Северо-западный центр рыболовства, Национальная служба морского рыболовства
    Национальное управление океанических и атмосферных исследований
    2725 Montlake Boulevard East, Сиэтл, Вашингтон 98112
    США / Э.-U.

    РЕФЕРАТ

    Оценка взрослой особи тихоокеанского лосося, видов Oncorhynchus и стальной форели, Salmo gairdneri , популяции в бассейне реки Колумбия создаются на плотинах и дополняются нерестилищами опросы.Подготовленные наблюдатели перечисляют отдельные виды проходных рыб по мере их прохождения. на большинстве плотин на реках Колумбия и Снейк установлены рыбные каналы. Перспективная техника в полевых испытаниях используется система замкнутого телевидения; мигрирующую рыбу можно посмотреть по телевизору приемник и может быть записан для последующего просмотра. Аэросъемка на крупных реках и на суше исследования в небольших притоках дают данные о нерестовых популяциях.

    Оценка некоторых специально обработанных популяций лосося и форели производится по оценкам и методы восстановления для определения их дожития до зрелости.Мечение молоди их миграция в море с помощью магнитных бирок с цветовой кодировкой и маркировкой холодных марок; когда они возвращаются во взрослом возрасте, помеченная рыба извлекается из рыболовного тракта путем автоматического извлечения. система. Бренды определяют тестовые и контрольные партии рыбы, выпущенной в предыдущие годы.

    РЕЗЮМЕ

    L’évaluation de populations d’adultes de saumon du Pacifique, Oncorhynchus spp., Et de truite aro-en-ciel, Salmo gairdneri , du Bassin du Fleuve Columbia est effectuée aux barrages et Complétée par des enquêtes aux frayères.Des Observateurs spécialisés dénombrent chaque espèce de poisson anadrome lors de leur pass des échelles à poissons installées aux barrages des Fleuves Columbia et Snake. Une technic prometteuse, à l’essai sur le terrain, comprend un circuit fermé de télévision; les poissons migrateurs peuvent être aperçus sur un récepteur de télévision et enregistrés pour un examen ultérieur. Des enquêtes aériennes pour les grands Fleuves et sur le terrain pour les plus petits affluents, Fournissent les Données sur les популяции репродуктологов.

    Оценки определенных популяций и истинные особые черты sont faites par la technic du marquage et recapture, afin de déterminer leur Survie à la maturité. Les jeunes poissons sont marqués au cours de leur migration vers la mer à l’aide de marques de fil magnétique de couleur codifiée, ainsi que par une brûlure à froid; lorsqu’ils remontent vultes, les poissons marqués sont repris par une échelle à poissons au moyen d’un système de recapture automatique.Les Marques идентифицирует les Lot d’essai et de contrôle de poisson relâché les années précédentes.

    СОДЕРЖАНИЕ

    1. ВВЕДЕНИЕ

    2. ОЦЕНКА НАСЕЛЕНИЯ ПЛОТИНЫ

    3. ОЦЕНКА НЕРЕСТАЮЩИХСЯ НАСЕЛЕНИЙ

    4. ОЦЕНКА СПЕЦИАЛЬНО ОБРАБОТАННЫХ НАСЕЛЕНИЙ

    ССЫЛКИ

    1. ВВЕДЕНИЕ

    Более полутора миллионов тихоокеанских лососей, Oncorhynchus spp., и форель, Salmo gairdneri , каждый год возвращается к реке Колумбия на северо-западном побережье США. Состояния. Точная информация о количестве этих рыб, мигрирующих вверх по реке Колумбия. нереститься требуется для обеспечения управленческой основы для регулирования: (а) промысловых промыслов, спорт и индийские рыбаки; и (b) нерестовые спускные устройства для различных спусков. Колумбия Река, вторая по величине река в США (средний годовой сток 5700 м 3 / с), была превратилась за последние четыре десятилетия из стремительного свободного ручья в серию крупных озера на плотинах, построенных для гидроэнергетики, орошения, судоходства и борьбы с наводнениями.Эти разработки резко изменили экологические условия в реке, в результате чего потребность в точной информации о величине, времени и продолжительности восходящих миграций еще более критично.

    2. ОЦЕНКА НАСЕЛЕНИЯ ПЛОТИНЫ

    Плотины в нижнем течении Колумбии и ее главного притока, реки Снейк, имеют сложные рыбные каналы (рис. 1) для прохода проходных рыб вверх по течению. Каждый Fishway имеет тщательно спроектированную станцию ​​для подсчета мигрантов.В настоящее время на реках Колумбия и Снейк насчитывается 12 крупных плотин (рис. станции работают с ранней весны до поздней осени. Обученные наблюдатели визуально идентифицируют и запишите каждую рыбу, когда она проезжает мимо станции. Хотя чавычи O. tshawytscha и кижуча, О. кисуч , лосось и стальная форель являются наиболее ценными видами для рыболовства, здесь — значительное количество более 16 других видов рыб, проходящих через рыбные каналы — е.g., нерка O. nerka и кета O. keta ; Американский шад, Alosa sapidissima ; осетровые, Acipenser spp .; карп, Cyprinus carpio ; присоски, Catostomus spp .; голавли, Hybopis spp .; сомы, Ictaluridae; shiners, Notropis spp., северный скво, Ptychocheilus oregonensis ; и тихоокеанская минога, Entrosphenus tridentatus . На некоторых плотинах мигрирующую рыбу направляют пикетированные провода над белой счетной доской (рис. 3), где их можно легко увидеть наблюдатели в кабине (рис. 4) у поверхности воды; глубина доски и кабина регулируется для различных уровней воды, и для контроля используются различные методы. интенсивность света и турбулентность для предотвращения задержек в зоне счета.В некоторых из более недавно построенные плотины, подсчет рыбы производится через большие смотровые окна (рис. 5). в стороне рыбного прохода. Здесь рыба направляется к окну, где наблюдатели опознают каждый вид; этот метод сокращает задержку прохождения рыбы на счетной станции и улучшает видимость для идентификации специальных знаков или тегов, которые могли быть нанесенный ранее на рыбу.

    Подсчеты на каждой плотине обычно регистрируются ежечасно, а затем консолидируются. в ежедневных, ежемесячных и годовых сводках (опубликовано У.S. Department of Army) для управления агентства. Данные используются для оценки общей численности популяции, оценки нерестового нерестового запаса. и определение последствий изменения экологических условий для миграции лосося и форели. Например, уменьшение количества взрослых особей, прибывающих к последовательным плотинам выше по течению, указывает на то, что потенциально опасных условий, влияющих на выживание рыб, таких как перенасыщение воды с растворенными атмосферными газами, повышением температуры, болезнями и «отпадением» рыбы от водосбросы.

    Визуальный подсчет дал много ценных данных за многие годы; однако метод дорого в рабочей силе и подвержен двум типам ошибок. Подсчеты обычно производятся во время дневной свет (12–16 часов в зависимости от времени года) по 50 минут каждый час; номер и виды рыб, проходящие в темное время суток и в период 10-минутного перерыва, каждый час должен быть экстраполирован из подсчета образцов и добавлен к фактическим наблюдениям. Кроме того возможная ошибка экстраполяции, возможность существенной ошибки из-за неправильной идентификации всегда присутствует.Было несколько случаев, когда подсчеты некоторых анадромных количество видов в верхних плотинах превысило количество в нижних плотинах. Стремясь свести к минимуму ошибки и чтобы обеспечить более экономичные средства для подсчета рыбы, внедряются автоматизированные системы подсчета. исследованы.

    Перспективный метод автоматизации подсчета рыбы проходит полевые испытания (США). Department of Army, 1972) предполагает использование системы замкнутого телевидения. В этой операции телевизионная камера настроена для наблюдения за рыбами, когда они проходят через смотровое окно сбоку рыбный путь.Камера активируется рыбой, проходящей через импедансный туннель (Рисунок 6). вниз по течению от окна; когда рыба проходит мимо окна и проходит через второй туннель, камера автоматически отключается.

    С помощью этой системы взрослых мигрантов можно визуально наблюдать на телевизоре, как они проходят через камеру и могут быть записаны на видеокассету для последующего просмотра; при правильном хранении лента может обеспечить постоянную визуальную запись прохода рыбы. Лента особенно ценен там, где проплывают многие виды рыб; во время просмотра ленту можно запускать медленно либо остановлен, либо воспроизведен для получения точной идентификации.В районах, где только один вид рыбы, цифровой счетчик может быть заменен на телевизионную систему.

    Прошлый опыт показал, что переход взрослых рыб меняется на протяжении их миграции. период; учет в ночное время составляет от 2 до 8 процентов дневного счета. Регистрируя проходящую рыбу видеокассету, дневной отрывок с рыбой можно сжать на одну катушку ленты, и примерно за час человек может посчитать рыбу, зарегистрированную за 24-часовой период, с минимальной ошибкой.

    Оценка популяции взрослого лосося на каждой плотине, вероятно, будет прекращена в будущее. Когда этап строительства плотины в бассейне Колумбии будет завершен и река потоки стабилизировались, учет рыбы возможен только на опорных дамбах. Эти плотины могут быть самый нижний на реке Колумбия и ее основных притоках и некоторых плотинах вверх по течению. Эти подсчет индексов вместе с оценками количества рыб, достигающих нерестилищ, должен обеспечивать Достаточная информация для рыболовных агентств, управляющих ресурсом.

    3. ОЦЕНКА НЕРЕСТАЮЩИХСЯ НАСЕЛЕНИЙ

    Информация о нерестовых популяциях получена при обследовании нерестилищ. Антенна исследования проводятся в более крупных реках, когда вода чистая и районы, используемые для нереста взрослых лососевых. можно идентифицировать (рисунок 7). В небольших притоках наземные обследования проводятся наблюдателями. переходить вброд на мелководье или плыть по течению на небольших лодках на более глубокой воде. В некоторых случаях Подводное плавание с аквалангом (автономный подводный дыхательный аппарат) используется в глубоких бассейнах, где нерестовая рыба может скопиться и остаться незамеченной.

    При наземных обследованиях подсчитываются красные туши, построенные нерестовой рыбой, туши — проверены на наличие меток и меток, а процент полностью отпущенной рыбы определяется осмотр гонад для определения количества оставшихся яиц после нереста.

    Данные, полученные в результате этих исследований, предоставляют информацию о влиянии изменения экологической условия на способность взрослых рыб выходить на обычные нерестилища и успешно нереститься.

    4.ОЦЕНКА СПЕЦИАЛЬНО ОБРАБОТАННЫХ НАСЕЛЕНИЙ

    При разработке метода защиты молодых мигрантов во время их миграции в море, часто бывает необходимо оценить успешность метода путем изучения оценок на взрослых особей, помеченных как молодь во время покатной миграции, и сравнение выживаемость взрослых особей опытных и контрольных партий экспериментальных рыб. Эти специально обработанные, затем возвращающихся взрослых особей необходимо отделять от необработанной рыбы без нарушения или задержки рыбный проход, идентифицированный и выпущенный без травм.Для этого система, использующая Используется холодное клеймение, бирки на магнитной проволоке и автоматическое восстановление.

    Разработана система идентификации (в которой используются цветные магнитные бирки). Джеффертс, Бергман и Фискус (1963) и дополнительно оценены Бергманом и др. . (1968) и Хагер и Джуэлл (1968), был включен в устройство, разработанное Дуркином, Эбелем и Смитом. (1969), который автоматически отделяет меченую рыбу от немаркированной рыбы в проходах.Система требует, чтобы рыба прошла над ложным водосливом и соскользнула по желобу через полый цилиндрический катушка обнаружения. Намагниченная проволока в морде помеченной рыбы создает достаточную ток для обнаружения в катушке, и сигнал ретранслируется для управления затвором, который отводит помеченную рыбу из нижнего конца желоба в зону ожидания. Эти рыбы, у которых также были отмечены холодными клеймами (Groves and Jones, 1969), поскольку молодь идентифицируется по марку (рис. 8) под слабым наркозом, а затем вернули целым и невредимым в рыбный канал, чтобы продолжить восходящую миграцию.Если клеймо неразборчиво, рыба отправлена ​​на нерест. в инкубатории. После создания закодированный тег провода можно удалить с головы для идентификация.

    Эбель, Парк и Йонсен (1973) обсуждают начальное эксплуатационное использование системы в Рыбоводный канал на плотине Ice Harbour в 1970 и 1971 годах. Усовершенствованная конструкция, описанная Эбелем (1973) был установлен на плотине Little Goose (рис. 9) в 1972 году.

    Рис. 1 Рыбные проходы, такие как показано (плотина Ледяной гавани на реке Снейк), обеспечивают для прохода проходных рыб вверх по течению и включения Перепись взрослых мигрантов

    Рисунок 2 Основные плотины с рыбными путями () на Колумбии и Снейке Реки, по которым проходят перелетные взрослые рыбы, насчитывают

    Рис.3 Взрослые особи лосося проходят над белой счетной доской который помогает обученному наблюдателю определять виды

    Рисунок 4 Счетчик рыбы в боксе подсчитывает рыбу по видам когда они проходят над счетной доской (слева в центре)

    Рисунок 5 Подсчет взрослых особей происходит по мере прохождения ими смотрового окна. установлен в стороне от прохода для рыбы

    Рисунок 6 Схема автоматической системы подсчета

    Рисунок 7 Аэрофотоснимок красной рыбы лосося (светлые пятна в русле ручья вверху и справа от тени плоскости) предоставляют данные о нерестовой активности

    Рис.

    No related posts.

    Похожие записи

    Юридическая фирма «Степановский, Папакул и партнеры»: ведущие специалисты по корпоративному праву в Беларуси

    20.11.2024

    Когда можно давать ребенку коровье молоко: рекомендации педиатров

    19.11.2024

    Кулинарная битва: все о захватывающем кулинарном соревновании

    15.11.2024

    Как правильно уложить новорожденного спать днем и ночью: эффективные советы

    15.11.2024

    Ортопедия в Минске: высококвалифицированная помощь при заболеваниях опорно-двигательного аппарата

    13.11.2024

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *