Карась обыкновенный: Карась обыкновенный, или золотой

Карась обыкновенный, или золотой

Карась обыкновенный, или золотой — Carassius carassius Семейство Карповые — Cyprinidae

Пресноводная рыба. Живет в заболоченных, заросших водоемах, пойменных озерах, старицах, прудах. В реках встречается реже, предпочитает участки с замедленным течением, илистым грунтом. Хорошо переносит изменения условий среды. Более неприхотлив к дефициту кислорода, чем серебряный карась. Миграций не совершает.

Тело высокое и довольно толстое. Рот без усиков. Спинной плавник длинный, выпуклый. Хвостовой плавник слабо выемчатый. Глоточные зубы однорядные. Спина красновато-коричневая или оливково-зеленая, бока бронзовые или темно-золотистые, брюхо светлое, желтоватое. Длина взрослых особей от 9 до 24 см, масса – от 25 до 600 г.

Широкий ареал в Европе и Сибири. В реках бассейна Северного Ледовитого океана (до 68° с.ш.) распространен от Северной Двины и Печоры на восток до Индигирки, Колымы и озер верховьев р. Урак (Охотское море). На юге России есть в Западном Закавказье, Куме, Тереке, низовьях Волги. Встречается в Урале и Эмбе. В Восточной Сибири золотой карась представлен подвидом

Carassius carassius jakuticus.

Молодь карася питается мелкими планктонными организмами; с возрастом переходит на питание донными беспозвоночными (мелкими ракообразными, личинками хирономид, поденок), высшей водной растительностью, детритом.

Нерест происходит в мае – июне, иногда в августе, при температуре воды 17–18 °С. Образует нерестовые скопления. Нерест порционный в 3–4 приема с перерывами в 10 дней. Икра липкая, приклеивается к растительности. Плодовитость от 5 до 300 тыс. икринок. Инкубационный период длится около 3–4 суток. Личинки при вылуплении имеют длину 6 мм, сначала подвешиваются к растениям, а после 2 суток переходят в пелагиаль и начинают питаться зоопланктоном. Темп роста сильно зависит от условий среды. Половая зрелость наступает в возрасте двух – четырех лет.

Литература

• Горюнова А.И., Исбеков К.Б., Асылбекова С.Ж., Данько Е.К. 2017. О карасях периодически высыхающих степных озёр Северного Казахстана в свете современных отечественных и зарубежных исследований. Труды ВНИРО, 165: 27–42.
• Кожаева Д.К., Казанчев С.Ч., Шибзухова З.С., Казанчева А.А. 2010. Биологические особенности популяций золотого и серебряного карася в условиях Кабардино-Балкарской республики. Известия Оренбургского ГАУ, 3(27): 244–247.
• Марьяновская М.В. 1973. Влияние условий выращивания на некоторые физиологические показатели золотистого карася. Автореф. дис. канд. биол. наук. Москва, 24 с.
• Монахов С.П., Аськеев А.О., Аськеев И.В. и др. 2020. Прошлое и настоящее видов рода Carassius Средневолжского региона. Вопросы рыболовства, 21(1): 5–19.
• Плиева Т.Х. 1988. Выращивание карасевых гибридов как добавочной рыбы в прудах. Изв. ТСХА, 4: 150–154.
• Плиева Т.Х. 1991. Особенности использования пищи и энегетический обмен у карасевых и карпокарасевых гибридов при выращивании в поликультуре с карпом. Изв. ТСХА, 6: 187–194.
• Плиева Т.Х. 1995. Научные основы использования карасевых и карпо-карасевых гибридов в рыбоводстве. Автореф. дис. док. сельхоз. наук. Новосибирск, 42 с.
• Плиева Т.Х., Михалева Т.А., Коняшина Л.К. 2011. Особенности роста и развития карасевых гибридов в условиях прудов комплексного назначения. Вестник РГАЗУ, 10(15): 78–81.
• Плиева Т.Х., Тетдоев В.В., Михалева Т.А., Лаврентьева Н.М., Коняшина Л.К. 2012. Рыбоводно-биологическая и продукционная характеристика производителей золотого и серебряного карасей и их гибрида. Вестник РУДН. Сер: Агрономия и животноводство, 3: 67–72.
• Романенко Г.А. 2017. Современное состояние карася в различных озерных системах Алтайского края. Мат. Всерос. науч. конф. «Водные биологические ресурсы России: состояние, мониторинг, управление», с. 106–111.
• Шибзухова З.С., Казанчев С.Ч. 2017. Влияние абиотических факторов на жизнестойкость молоди карасевых рыб. Изв. Горского ГАУ, 54(3): 46–51.

Карась обыкновенный: места обитания, нерестовый период

Карась является самым распространенным видом карповых рыб, населяющих практически всю территорию России. Практически каждый из нас хотя бы раз в жизни ловил карася на поплавочную удочку. В моем детстве именно этот способ ловли являлся самым распространенным среди мальчишек и взрослых рыбаков.

Поймать карася на поплавочную удочку не представляет большой сложности, так как он довольно всеяден и часто обитает недалеко от берега.

Среда обитания карася

Обитает карась в спокойных озерах и реках, искусственных прудах, обладающие илистым дном. В местах где дно состоит из песка или камней, ему попросту нечем питаться, так как пищу карась добывает, ковыряясь в придонном слое ила. В реках он встречается гораздо реже, так как предпочтение отдает стоячей мутной воде. На многих прудах специально никто не разводит карася – он разрастается самостоятельно и весьма быстро благодаря комфортным условиям для его жизни.

Отличительной особенностью этих рыб является неприхотливость к обилию кислорода в воде. Нередко удавалось обнаружить карася в болотах, где кроме него вряд ли может выжить иная рыба. Благодаря такой живучести даже в период полного промерзания или высыхания водоема карась закапывается в ил и сохраняет свою жизнеспособность довольно долгое время. В зимнее время года он не активен и впадает в состояние спячки.

Внешний вид и питание

Все хорошо знают внешность карася и спутать его с какой-либо другой рыбой бывает крайне сложно. По виду карась имеет разновидности: круглый золотистый и продолговатый серебряный. В длину обычно достигает размера в 25см. Гораздо реже встречаются особи размером около 40см при весе чуть более килограмма. Круглый карась исходя из названия обладает соответствующей формой тела, сплющенной по бокам. Цвет чешуи обычно имеет золотистый, иногда даже с красноватым оттенком. Продолговатый карась отличается более длинным туловищем с серебристой чешуей.

Рацион питания карася состоит в основном из мелкой живности водоема – планктон, беспозвоночные, различная растительность, черви. Интересной особенностью является то, что в различных водоемах он может по-разному питаться. Неоднократно было замечено рыбаками, что в одном пруду карась ловится только на хлеб, а в другом на опарыша.

Период нереста

Нерест карася обычно не продолжительный и может занимать всего 1-2 дня. В южных регионах России метание икры начинается обычно в начале мая. В средней полосе время нереста сдвигается к середине или концу мая. Существует даже мнение, что карась может нереститься в несколько заходов. Некоторые рыболовы наблюдали этот процесс и в конце июня. Благоприятной температурой воды для нереста карася считается показатель в 14 градусов по Цельсию. Именно поэтому в разных регионах нерестовый период приходится на разные месяца.

Ловля карася доставляет много удовольствия рыболову, а вкусовые качества этой рыбы, приготовленной на сковороде со сметаной, невозможно спутать с чем-то другим!

описание и повадки, где обитает и чем питается

Один из представителей семейства карповых — рыба карась, обитающая не только в заросших прудах и озёрах, но и в болотах. Легко узнать по золотистому оттенку, но цвет может изменяться до серебристого блеска. В благоприятных условиях отдельные особи вырастают до 60 см в длину и достигают веса 5 кг, поскольку недостатка в пище не испытывают: употребляют всё, что их окружает.

Внешний вид карася и подклассы

Корпус высокий с толстой спинкой и длинным зазубренным плавником на ней, бока умеренно сжаты и покрыты крупной чешуёй, гладкой на ощупь. Окраска ассоциируется с цветом дна и растительности участка водоёма, где живёт карась. Голова небольшая, глаза и рот (без усов) тоже, хвост коричневого тона раздвоенной формы. Отличительная черта рыб этой породы — присутствие колючих лучей в анальном и спинном плавниках. В зависимости от окраски различают 3 вида особей:

1. Золотой или обыкновенный карась является объектом промысла и промышленного разведения. Парные грудные и брюшные плавники, как и одинарный анальный, имеют красноватый оттенок, а низ корпуса белый, в отличие от тёмно-коричневой спины. Чешуя всегда с жёлтым отсветом: от бронзового с золотистым отливом до медно-красного.
2. Серебряный карась прежде имел ограниченное распространение — в пределах рек бассейна Тихого океана, но в середине прошлого века был искусственно расселён по водоёмам Дальнего Востока, Сибири и европейской части страны. Внешне обыкновенный и серебряный экземпляры похожи, но последний несколько меньших размеров, хотя это обстоятельство не мешает ему вытеснять из общего водоёма своего родственника. Отличают по серебристо-серому или серо-зелёному цвету чешуи, которая крупнее, чем у первого вида.
3. Гибридная особь — золотая рыбка, которую вывели искусственным путём в Китае. Сходство её с обыкновенным прародителем не ограничивается внешними признаками: ест «волшебница» то же, чем питается карась. Существует около 300 разновидностей, и абсолютное большинство гибридных карасиков предназначены для аквариумной жизни. Соответственно, размеры рыбок от 2 до 45 см, а окраска включает все цвета радуги, но больше известна красная. Декоративность особей подчёркивается необычной формой плавников и хвоста: они могут быть очень долгими и похожими на вуаль или крылья бабочки.

Обычно рыба имеет длину 20―25 см и вес не более 1 кг, но известны сообщения о достижении отдельными карасями обыкновенного вида 0,5 м при массе около 4 килограмм, и серебряного — 40 см и трёх кг соответственно. Независимо от того, как выглядит карась, продолжительность жизни золотого и серебряного видов 8―12 лет. Половозрелый возраст — от трёх до четырёх, нересты происходят весной, икринки откладываются на водоросли в количестве до 30 тысяч штук.

Особенности поведения рыбы

Поскольку карась является промысловой рыбой, добывать его разрешено, и у охотников его ловли имеется масса наблюдений. Вот интересные замечания:

• непредсказуемость поведения от изменений погоды, времени суток и насадки;
• развитость обоняния позволяет поймать слабые ароматы на большом расстоянии, а резко пахнущие чеснок, валериана, подсолнечное масло привлекают рыбу;
• чувствительность боковой линии позволяет карасю владеть информацией о присутствии в толще воды пищи, нахождении хищников в зоне досягаемости;
• подвижность малька в течение длительного времени оказывается полезной при ловле щуки на живца.

Поймать рыбу можно в любое тёплое время года вне зависимости от погоды. Исключение составляют похолодания — в такие периоды не действует никакая приманка.

Лучшие места для обитания

Ареал этой невзыскательной и неприхотливой рыбы обширен, она способна жить даже в небольшой яме, где другой вид непременно погибнет. Замечено, что при ухудшении условий водоёма, недостатке кислорода и зарастании его илом, его обитателям становится комфортнее — быстрее плавают, успешнее размножаются. Места, где обитает карась:

• болотистые реки;
• илистые водоёмы;
• заросшие низменные озёра.

Приспосабливаются эти выносливые и живучие обитатели глубин даже к условиям искусственного водоёма, образующегося после отработки полезного ископаемого и затопления карьера. Но к холодным и чистым водам горных рек и озёр рыба карась привыкает очень трудно, а иногда не может. Тем не менее распространение вида достигло даже суровой Колымы: при экстремальных условиях засухи или сильного мороза караси зарываются в илистый грунт до 70 см и пережидают сложный период. Зимой впадают в спячку и выживают при полном промерзании воды.

Рацион водного жителя

Перечислять, чем питается карась, можно бесконечно долго — это всеядная рыба, способная поедать даже органические отходы. Проще назвать, что она не любит — водоросль роголистник, который содержит дубильное вещество танин. Фенол отпугивает добычу карася — насекомых и личинок. В разные периоды жизни рацион меняется:

1. Малёк с нулевым опытом, только что вылупившийся из икринки, первую неделю кормится содержимым собственного жёлчного мешка — остатками от эмбрионального развития.
2. Караси возрастом до одного месяца через неделю самообеспечения начинает есть простейшие микроорганизмы — это бактерии, дафнии, зоопланктон и сине-зелёные водоросли.
3. Месячные мальки питаются более сытно: личинками водных насекомых, мелкими беспозвоночными.
4. Взрослые особи от одного года поедают моллюсков, ракообразных, кольчатых червей и находят пищу на дне глубоких водоёмов, где изобильный выбор.

Мелководья, пруды с трясиной и заросшие камышом кормом небогаты — планктон и простейшие организмы. Но рыба карась питается не только животной, но и растительной едой: водоросли, корни и стебли, трава, тина и ряска входят в меню. Вмешательство человека в живую природу привело к расширению рациона водных обитателей за счёт варёных круп, хлебного мякиша и теста.

Рыба карась — описание, виды, хозяйственное значение, разведение.

Карась является самой распространенной пресноводной рыбой в нашей стране. Каждый, кто хотя бы раз ходил на рыбалку с удочкой, наверняка, поймал несколько карасиков. Хорошо знакома рыба карась и кулинарам. Поскольку караси являются самой доступной рыбой, существует масса рецептов по их приготовлению. Наконец, карась хорошо поддается разведению в прудовых рыбоводческих хозяйствах.

Содержание статьи:

Рыба карась — виды

В научной классификации караси выделены в самостоятельный род, относящийся к семейству карповых рыб. В настоящий момент выделяют пять видов рыбы карась:

1. Золотой (обыкновенный) карась. Является аборигенным видом для пресноводных водоемов Евразии от Англии до Средней Сибири (бассейн Лены). Обладает характерным желтовато-золотистым отливом чешуи.
2. Серебристый или серебряный карась. Изначально этот видВид – эволюционно сложившаяся совокупность особей, характеризующаяся единым … населял водоемы, относящиеся к бассейну Тихого океана, а также в некоторых реках Сибири. Однако стараниями человека этот видВид – эволюционно сложившаяся совокупность особей, характеризующаяся единым … широко расселился по водоемам северной Евразии, став едва ли не более распространенным, чем местный золотой карась. Этот видВид – эволюционно сложившаяся совокупность особей, характеризующаяся единым … имеет стальной или серебристый цвета окрас и чуть более крупную чешую.
3. Карась золотая рыбка. Этот сугубо декоративный видВид – эволюционно сложившаяся совокупность особей, характеризующаяся единым … был искусственно выведен в Древнем Китае методом селекции обыкновенного карася. Сегодня создано несколько пород золотой рыбки, сильно различающихся между собой и формой, и цветом. Базовая порода внешне отличается от обычного карася лишь ярко-оранжевым окрасом.
4. Японский белый карась. Изначально являлся эндемиком крупнейшего в Японии озера Бива. Впоследствии был искусственно заселен в Корею и на Тайвань. Отличается светло-серым окрасом.
5. Карась мабуна (Carassius langsdorfii). Широко распространен в Японии, иногда встречается на Дальнем Востоке. Визуально очень напоминает серебряного карася.

Хотя некоторые видыВид – эволюционно сложившаяся совокупность особей, характеризующаяся единым … морских рыб имеют бытовое название морской карась, рыба эта не имеет никакого отношения к настоящим пресноводным карасям.

Ареал распространения карасей

Долгое время типичным представителем рода карасей считался карась золотой, он же обыкновенный. Этот видВид – эволюционно сложившаяся совокупность особей, характеризующаяся единым … был широко распространен по всей Европе и в северной Азии, где ареал его обитания доходил до бассейна реки Лена. На протяжении многих веков европейцы не знали никаких других видов карася, кроме золотого. Тем не менее, во второй половине XX века золотой карась начал стремительно вытесняться серебряным карасем, который к сегодняшнему дню стал более типичным представителем рода.

Считается, что южная граница расселения золотого карася доходила до центральной Франции, Швейцарии, Болгарии, Грузии, южного Казахстана и северного Алтая. В природе рыба золотой карась не встречалась в водоемах Китая, но исторические факты показывают, что в Поднебесной об этом виде знали и даже разводили его, поскольку именно на основе золотого карася около тысячи лет назад здесь был выведен видВид – эволюционно сложившаяся совокупность особей, характеризующаяся единым … карася золотая рыбка. Впрочем, многие источники утверждают, что этот видВид – эволюционно сложившаяся совокупность особей, характеризующаяся единым … был выведен всё же из серебряного карася, который встречается в северном Китае повсеместно.

Карась серебристый изначально был распространен в водоемах, относящихся к бассейну Амура, а также в некоторых сибирских реках. В 1960-х годах этот видВид – эволюционно сложившаяся совокупность особей, характеризующаяся единым … начали искусственно расселять по территории СССР и Центральной Европы. Серебряный карась хорошо прижился за пределами своего природного ареала, и сегодня его можно встретить также в Западной Европе, США, Канаде, Индии и другие регионах мира. В тех водоемах, куда попал серебряный карась, аборигенная рыба карп и карась золотой была стремительно вытеснена на второй план, а во многих местах даже полностью исчезла.

Два японских вида карася, как не трудно догадаться, изначально были распространены лишь в самой Японии. Причем белый карась вообще был эндемиком одного водоема — озера Бива. Со временем японские караси были интродуцированы в некоторые водоемы российского Дальнего Востока, Кореи и Китая.

Что касается золотой рыбки, то этот видВид – эволюционно сложившаяся совокупность особей, характеризующаяся единым … с самого начала был выведен искусственно в декоративных целях, а потому в природных условиях не встречается.

Рыба карась — описание

У всех карасей достаточно схожая внешность. У них высокое приплюснутое с боков тело с толстой спиной и узким брюшком. На спине один невысокий, но длинный плавник. Небольшая голова оканчивается совсем уж маленькой пастью, в которой глоточные зубы расположены в один ряд.

У карасей крупная гладкая чешуя, цвет которой зависит не только от вида, но и от места обитания. У золотого карася в основном встречаются различные оттенки жёлто-серого цвета: от почти горчичного до серебристого с легким оттенком желтизны. Причем у золотого карася плавники в любом случае будут желто-коричневого или красноватого цвета. В свою очередь рыба карась серебряный имеет серебристо-серый иногда с зеленоватым оттенком цвет, но изредка попадаются особи жёлтого цвета. Плавники у серебристого карася всегда серо-черного цвета. Японский белый карась является более светлой версией серебряного. Ну а что касается окраса золотой рыбки, то стандартная порода окрашена в яркий морковный цвет.

Размеры карася напрямую зависят от размеров водоема. В небольших прудах они зачастую не превышают размеров ладони взрослого человека, но в реках, водохранилищах, больших озерах и прудах золотой карась может набрать до 3 кг при длине тела около 50 см, а серебряный — до 2 кг и 40 см.

Образ жизни карасей

Карась как рыба составляет основу «населения» большинства стоячих и проточных водоёмов в своем ареале обитания. Он отлично чувствует себя как в мелких прудах и болотцах, так и в крупных реках, включая устья и пресноводные дельты. Причем карась больше предпочитает мутные заиленные места, а вот водоемы с кристально чистой водой и каменистым дном он не любит. По этой причине его почти невозможно встретить в горных озерах, реках и ручьях.

Карась совершенно неприхотлив к качеству воды, и если условия в водоеме становятся совсем уж невыносимыми (катастрофическое падение уровня кислорода, пересыхание или даже полное промерзание), он просто зарывается в придонный ил и там впадает в спячку. В анабиозе карась может находиться долгие месяцы, ожидая улучшения условий в водоеме.

Эта рыба предпочитает держаться как можно ближе ко дну, либо прячется в зарослях подводной растительности. Впрочем, при обилии насекомых у поверхности воды он может подниматься и в верхние водные слои. Речная рыба карась ведет стайный образ жизни, но крупные особи часто держатся поодиночке.

В небольших водоемах, особенно в непроточных, карась впадает в зимнюю спячку, чтобы избежать кислородного голодания. А вот в реках и других водоемах с хорошей циркуляцией воды и нормальным кислородным режимом, рыба часто сохраняет активность весь год.

Караси всеядны. Основу их рациона составляют всевозможные насекомые, мелкие беспозвоночные, живущие в воде, водоросли и детрит. В свою очередь сам карась нередко становится добычей хищных рыб и околоводных хищников (змей, выдр, цапель и т.д.)

Половой зрелости пресноводная рыба карась достигает в возрасте трех-четырех лет. На нерест обычно идет в несколько приемов за сезон, когда температура воды достигает оптимальных значений (около 14 °C). Но обычно основная масса икры мечется в мае—июне. Под нерестилища выбираются участки дна, поросшие водной растительностью.

Интересной чертой серебряного карася является способность самок к гиногенезу, то есть к размножению без участия самцов собственного вида. Происходит это так: самки мечут икру, которую затем активирует (но не оплодотворяет в полном смысле) молока других рыб, например, золотого карася или карпа; проклюнувшиеся личинки в генетическом плане являются копиями своей матери. В результате этого в некоторых водоемах серебряные караси представлены исключительно самками.

Хотя обычно караси не склонны к миграциям, иногда во время нереста они могут выходить из своих озёр, прудов и затонов в реки для икрометания.

Хозяйственное значение карася

Карась является привычным обитателем пресных водоемов почти по всей Европе (кроме южных и некоторых западных регионов, а также крайнего севера). С незапамятных времен для местных жителей он был объектом лова на удочку и сетью.

Сегодня семейство рыб карась остается популярной добычей любителей спортивной рыбалки. Он обитает как в ухоженных частных прудах, так и в естественных диких водоемах, а потому общедоступен для любого рыбака. Поскольку ловля карася требует лишь самых элементарных рыболовных навыков, ни один поход на рыбалку к пресноводному водоему не может обойтись без того, чтобы на крючок попалось хотя бы несколько карасиков.

Однако ввиду того, что в диких водоемах карась зачастую имеет очень небольшие размеры, ценность рыбы, добытой во время спортивной рыбалки, как правило, невелика. В основном это небольшая рыбешка размером с ладонь, реже — чуть крупнее. Многие рыбаки предпочитают просто отпускать подобную мелочевку рыбы карась  в пруд обратно.

Несколько иначе дела обстоят на ухоженных частных водоемах, где рыбу подкармливают и целенаправленно разводят. В таких условиях караси относительно легко набирают массу в несколько сотен граммов, а иногда и больше килограмма. Такая рыба уже представляет значительный интерес не только в спортивном, но и в кулинарном плане.

Наконец, карась нередко целенаправленно разводится как товарная рыба на продажу. Являясь всеядным и совершенно непритязательным к условиям в пруду, карась дешев в производстве и не создает лишних хлопот. Правда, на продовольственном рынке он и ценится не очень высоко.

Отдельно следует упомянуть о карасях вида золотая рыбка. Поскольку это искусственный и сугубо декоративный видВид – эволюционно сложившаяся совокупность особей, характеризующаяся единым …, то и в дикой природе она не встречается. Его разводят для аквариумов и небольших декоративных прудов. Употреблять этих карасей в пищу не принято.

Использование карасей в кулинарии

Карась считается диетической едой, поскольку при средней жирности его мяса на уровне 7% калорийность 100 грамм не превышает 87 ккал.

Как и любая рыба, карась очень полезен, поскольку содержит массу жирорастворимых витаминов, минералов и микроэлементов. В частности он богат витаминами группы  А, В, С, D, Е, РР, а также медью, цинком, втором кальцием, марганцем, натрием и др. В мясе карася много йода, который очень необходим при проблемах с щитовидной железой. По количеству белка карась сопоставим с курятиной. Этого вещества в его мясе около 18%.

Вкусовые характеристики карася во многом зависят от места, в котором обитала конкретная особь. Рыба, выловленная в большой реке или крупном стоячем водоеме, имеет нежный чуть сладковатый вкус, тогда как живая рыба карась, выловленная в мелководных сильно заболоченных водоемах часто может отдавать тиной. К счастью, побороть эту проблему можно путем вымачивания карася в молоке или уксусе, либо использованием большего количества специй.

Другим недостатком карася, из-за которого многие кулинары не любят эту рыбу, является ее повышенная костистость. Причем многие косточки настолько малы, что визуально их очень трудно заметить и удалить при разделке тушки. Впрочем, есть немало рецептов, позволяющих свести к минимуму эту проблему.

Самое простое блюдо из карася, которое хотя бы раз готовил каждый рыболов-любитель — это караси в муке, жаренные на сковороде. Причем многие настаивают, что приготовленные таким образом карасики тем вкуснее, чем они мельче.

Также популярными блюдами являются жареный карась в сметане, борщ или уха из карася и запеченный в духовке карась. В Польше, к примеру, карась в сметане является популярным праздничным блюдом. Крупных карасей вялят и сушат.

Искусственное разведение карася

С точки зрения рыбовода карась хорош тем, что почти не подвержен инфекционным заболеваниям и, как следует из описания рыбы карась, совершенно не требователен к качеству воды и способен быстро набирать весь даже без подкормки. Хотя для большей части территории России аборигенным видом является золотой карась, для искусственного разведения и выращивания лучше подходит серебряный видВид – эволюционно сложившаяся совокупность особей, характеризующаяся единым …. Он быстрее набирает вес и в целом более живучий.

Карасей можно разводить как в монокультуре, так и вместе с карпами. Самый простой способ — это покупка сеголеток в рыбном хозяйстве (почти в каждом регионе еще с советских времен остались хозяйства, разводящие карасей) и затем доращивание их до товарных размеров в собственном пруду. Причем размеры и чистота пруда особого значения не имеют. Главное соблюдать норму посадки и не допускать пересыхания пруда.

Если пруд богат растительностью и беспозвоночными, то рыба прокормит себя самостоятельно. Но для ускорения процесса набора массы карася лучше подкармливать распаренным зерном, несолеными кашами, свиным комбикормом либо специально предназначенными для карасей кормами. При таком режиме караси вырастут до товарных размеров всего за один сезон.

Карась обыкновенный (Красная книга Крыма)

(карась золотой, карась круглый) 
 
Carassius carassius 
(Linnaeus, 1758) 
 
Таксономическое положение 
Класс лучеперые рыбы (Actinopterygii). 
Отряд карпообразные (Cypriniformes). 
Семейство карповые (Cyprinidae). 
 
Природоохранный статус 
Вероятно исчезнувший вид (0). 

Ареал

Ранее был широко распространен в пресных водоемах Европы и Сибири, отмечался в лиманах и опресненных заливах Черного и Азовского морей. В Крым завезен давно, являлся обычным, но в последние два десятилетия не регистрируется.

Особенности морфологии

Тело высокое, округлое, покрыто крупной, плотно сидящей чешуей, в боковой линии 21–38 прободенных чешуй. В спинном плавнике 3–4 неветвистых и 14– 25 ветвистых лучей, в анальном – 2–3 неветвистых и 5–8 ветвистых; последний неветвистый луч спинного и анального плавников в виде костной колючки с частыми (до 30) мелкими зазубринами; на первой жаберной дуге 23–35 жаберных тычинок. Окраска боков тела от меднокрасной до золотистой, верхняя часть головы и спины темная, брюхо светло-золотистое, плавники темно-красные, брюшина светлая. Достигает длины до 50 см и массы до 5 кг, в Крыму максимально – до 1.4 кг.

Особенности биологии

Пресноводный вид, держится на мелководье, поросшем растительностью. Неприхотлив к дефициту кислорода, переносит промерзание и пересыхание водоемов, зарываясь глубоко в ил. Достигает половой зрелости на 3–5 году жизни, нерестится в мае – июне порционно, выметывает до 300 тысяч икринок, которые приклеиваются на подводную растительность. Питается растительностью, донными беспозвоночными и детритом. Живет до 10–12 лет.

Факторы угроз

Вытесняется серебряным карасем.

Меры охраны

Необходимо проведение дополнительных исследований по обнаружению локальных популяций вида в изолированных водоемах Крыма.

Источники информации

Кесслер, 1860; Цееб, 1929; Берг, 1949; Делямуре, 1964; Мирошниченко, 2003; Атлас пресноводных рыб России, 2003; Рыбы в заповедниках России, 2010; Дерипаско и др., 2011; Карпова, Болтачев, 2012.

Составители: Болтачев А. Р., Карпова Е. П., Мирошниченко А. И. Фото: Карпова Е. П.

AOF | 09.01.2018 17:15:31

Карась обыкновенный — Carassius carassius

Описание

Карась хорошо себя чувствует в просторных, но не слишком глубоких водоемах, где вода хорошо прогревается солнечными лучами. Предпочитает воду с отсутствующим течением и илистое дно, поэтому в бурных речных водах встретить его очень сложно. Чаще всего плавает в заросших растительностью водах. Рыба обитает преимущественно в протоках рек, омутах без течения, глубоких речных ямах.

В отличие от своего родственника, золотого карася, данный вид может жить в воде с небольшим количеством растворенного кислорода. Именно поэтому его можно встретить в озерах и прудах, которые покрываются льдом чуть ли не до дна. Он также может пережить летнее пересыхание водоема в жару, зарываясь на это время в донный ил.

Основная пища карася – мотыль. Кроме того, он поедает различных насекомых, мелких моллюсков, водоросли. Если кормовой базы для его развития недостаточно, рыба быстро мельчает и деградирует, образуя карликовую форму карася.

Места обитания карася

Карась обыкновенный имеет очень широкий ареал обитания и встречается в водоемах европейских стран, европейской части России, Сибири и так далее. Эту рыбу можно поймать в следующих регионах:

• Северная граница области обитания карася проходит по Великобритании и Скандинавским странам.
• Южная граница области обитания рыбы очерчена Македонией и Италией.
• Карась встречается в бассейне Северного Ледовитого океана.
• Рыба обитает в реках Закавказья, Куме, Тереке, Волге.
• Небольшое количество Carassius carassius наблюдается в реках Урал и Эмбра.

Строение тела карася

Карась имеет характерное короткое тело большой высоты, которое сильно приплюснуто с боков. Вся рыба покрыта чешуей среднего размера с серебристым оттенком. Рот конечный, усиков не имеет. На брюшной части рыбы пигментация отсутствует.

Карась обыкновенный имеет очень длинный спинной плавник и достаточно короткий хвост. Крайние лучи этих плавников снабжены колючками с небольшими зазубринами.

Средняя продолжительность жизни рыбы 10 лет. За это время особь может достичь полуметровой длины и веса в 5 кг. Однако средние размеры составляют примерно 25 см и массу 600 грамм.

Особенности поведения карася

Половой зрелости карась достигает на 5 году жизни. Нерест начинается весной, когда температура окружающей воды достигнет отметки в 18 градусов Цельсия. Икрометание порционное, разделено на 4-5 периодов, перерыв между которыми может достигать 10 дней. В одном помете находится до 300 тыс. икринок желтого цвета, которые, благодаря клейкой поверхности, приклеиваются к листьям подводных растений.

Молодь вылупляется через 6 суток после икрометания и на ранних стадиях развития питается зоопланктоном.

Промысловое значение карася

Карась – известная промысловая рыба. Частично ее ловят в реках и озерах, но основную массу разводят в искусственных водоемах. Особенно развито прудовое хозяйство по разведению карасей в северных районах нашей страны. Во время Второй мировой войны ежегодно вылавливалось до 2 тыс. тонн рыбы, однако сейчас этот показатель составляет лишь 1-1,2 тыс. тонн в год.

Мясо карася имеет приятный сладковатый вкус. Его широко используют в кулинарии.

Карась золотой, карась обыкновенный (лат. Carassius carassius) в Красной книге Украины

Научная классификация вида:

• Царство: Животные (лат. Animalia)
• Тип: Хордовые (лат. Chordata)
• Подтип: Позвоночные (лат. Vertebrata)
• Группа (Инфратип): Челюстноротые (лат. Gnathostomi)
• Надкласс: Рыбы (лат. Pisces)
• Класс: Костные рыбы (лат. Osteichthyes)
• Группа: Лучеперые рыбы (лат. Actinopterygii, Teleostomi)
• Подкласс: Новопёрые рыбы (лат. Neopterygii)
• Инфраотряд: Костистые рыбы (лат. Teleostei)
• Надотряд: Костнопузырные (лат. Ostariophysi)
• Отряд: Карпообразные (лат. Cypriniformes)
• Семейство: Карповые (лат. Cyprinidae)
• Вид: Карась золотой, карась обыкновенный (лат. Carassius carassius)

Природохранный статус:

Вид находиться под угрозой исчезновения.

Описание золотого карася:

Карась золотой отличается от другого вида, серебряного карася, меньшим числом жаберных тычинок на первой дуге (у золотого карася 23—33, у серебряного 39 — 50). Спина карася обычно темно-коричневая, с зеленоватым отливом; бока темно-золотистые, иногда с медно-красным отливом; парные плавники бывают слегка красноватые. Тело высокое с толстой спиной, умеренно сжатое с боков.

Распространение золотого карася:

Распространен он в Средней и Восточной Европе, а также в Сибири до р. Лены.

Места обитания золотого карася:

Живет золотой карась в заболоченных, заросших водоемах, в пойменных озерах, в реках держится на участках с замедленным течением. В горных озерах и вообще в горных местностях карась является довольно редким явлением. Караси отличаются особенной привязанностью к водам с илистыми грунтами. На зиму караси закапываются в ил и выживают даже тогда, когда в холодные бесснежные зимы мелкие стоячие водоемы промерзают до самого дна. Такую же стойкость караси проявляют и при летних засухах, когда озера и болота, в которых они живут, полностью пересыхают. Они способны закопаться в ил на глубину до 70 см.

Карась золотой карта ареала

Условные обозначения:

• ○ — местность, где вид встречался до 1994 г.
• ● — местность, где вид встречался после 1994 г.
• ? — возможные места обитания, или места вызывающие сомнения
• x — места нереста рыб

Численность золотого карася:

В отдельных водоемах обычная численность, в других встречается одиночно, в ряде водоемов уже исчез.

Причины изменения численности:

Загрязнение воды, нерегулируемый вылов.

Особенности биологии:

Благодаря необыкновенной выносливости к неблагоприятным факторам по сравнению с другими видами рыб карась часто является единственным представителем ихтиофауны водоемов. Карась проявляет значительную изменчивость в зависимости от условий существования. В водоемах сильно заболоченных, с неблагоприятными условиями питания, он образует низкотелую, большеголовую, медленно растущую и рано созревающую карликовую форму, а в водоемах с благоприятными условиями карась высокотел и быстро растет.

Половозрелым карась становится на 4-м году. Самцы созревают несколько раньше самок. Икрометание начинается при температуре не ниже 14°С. Икра липкая, выметывается на подводную растительность. Нерест порционный. Плодовитость большая, до 300 тыс. икринок. Нерест групповой, довольно шумный. Обычно ближе к дну находятся самки, а наверху вертятся и прыгают самцы. Как только самки начнут выпускать икру, самцы начинают переворачиваться набок и поливать молоками икру. Нерест карася продолжается 2—3 дня, но так как икрометание порционное, наблюдается несколько подходов на нерест. Развитие икры происходит на водных растениях, к которым приклеиваются выметанные самкой икринки. Молодь карася питается планктоном. Пищу взрослого карася составляют растительные и животные организмы, а также детрит. Растет карась в различных водоемах по-разному.

При благоприятнььх условиях он растет довольно хорошо, и его разводят в прудах северных районов, где карп приживается плохо. Карась может достигать длины 45 см и веса более 3 кг. Но обычно уже превосходными карасями считаются экземпляры весом 500—600 г.

Охрана золотого карася:

Включен в Список редких рыб Европы и в Красную книгу МСОП. В Правилах рыболовства установлен минимальный размер 10 см, при котором разрешается ловить в Черноморском регионе, в других — не охраняется.

Источник: Красная книга Украины.

Подробнее об этой рыбе вы можете узнать в разделе «Энциклопедия рыб».

Если заметили ошибку, выделите фрагмент текста и нажмите Ctrl+Enter

Карась — Animal Crossing Wiki

Карась — пресноводная рыба из серии Animal Crossing , представленной в Doubutsu no Mori . Он продается за 160 колоколов. Вместе с карпом и большинством рыб из семейства карповых он появляется в первом аквариуме в Animal Crossing: Wild World и в среднем левом резервуаре в Animal Crossing: City Folk . Карась серо-белого цвета. Эти рыбы чрезвычайно распространены, их можно встретить в любое время года и в любое время суток.

Детали улова [править]

Во всех основных играх, кроме New Horizons , карася можно продать за 120 колокольчиков в магазине Tom Nook или Re-Tail.

In

Animal Crossing [править]

№ 1

«Я поймал карася! Carpe diem!»

Время года	Круглый год
Текущее время	Весь день
Расположение	Река
Размер тени	Маленький
Цена продажи	120 колоколов
Фэн-шуй	Нет
Размер мебели

В

Диком Мире [править]

# 3

«Я поймал карася! Carpe diem!»

Описание	В отличие от карпа, у карася нет усов.
Время года	Круглый год
Текущее время	Весь день
Пиковое время	март — июнь; Сен — ноя
Расположение	Река
Размер тени	Маленький
Размер рыбы	30 см
Цена продажи	120 колоколов
Размер мебели

В

Городской Народ [править]

# 3

«Я поймал карася!

Описание	Разница между ними и карпом — отсутствие усов.
Время года	Круглый год
Текущее время	Весь день
Пиковое время	Н / Д
Расположение	Река
Размер тени	Средний
Размер рыбы	Около 11,7 дюйма
Цена продажи	120 колоколов
Размер мебели

In

New Leaf [править]

# 3

«Я поймал карася! Какой важный улов!»

Время года	Круглый год
Текущее время	Весь день
Пиковое время	9:00 — 16:00
Расположение	Река
Размер тени	Маленький
Размер рыбы	20 см
Цена продажи	120 колоколов
Размер мебели

В

Карманный лагерь [править]

№ 11

Доступность мероприятия	Нет
Расположение	Lost Lure Creek
Размер тени	Маленький
Размер рыбы	15.0 см — 24,9 см
Редкость	★
Доля улова	20,01 80%
Цена продажи	10 колоколов
Запросить вознаграждение	100 колокольчиков, 2 очка дружбы

В

New Horizons [править]

# 3

«Я поймал карася! У меня отточенные навыки!»

В дар музею [править]

Animal Crossing [править]

«Понимаете, даже обычная рыба — ценный ресурс.Все это часть грандиозного гобелена, вот! Мы позаботимся об этом парне, о да. Можете не сомневаться. Действительно отличный уход ».

Дикий мир [править]

«Когда я слышу карася, я думаю про себя … Тако! Действительно, тако с РЫБОЙ, вот-вот! Я полагаю, это может быть странный выбор рыбы для такого блюда, но … я говорю, любой шанс, ты не хочешь попробовать и вернуться ко мне? »

Городской народ [править]

Отдавая рыбу Блатерсу в музей, он скажет:

New Leaf [править]

При передаче в дар музею информационная доска перед резервуаром, в котором находится карась, гласит:

«Карась — довольно простая рыба для новичков, но она также популярна среди рыболовов-ветеранов.Они родственны кои и могут жить до 15 лет, что делает их отличной рыбой для содержания в пруду. Потомство мужского пола рождается редко, поэтому самок значительно превышает численность самцов, от чего страдают популяции. К счастью, самки могут воспроизводиться с самцами некоторых других видов, поэтому проблема носит относительно временный характер ».

New Horizons [править]

При пожертвовании Blathers или выборе «Расскажи мне об этом!» в New Horizons он предоставит следующую информацию о рыбе:

«Интересно… Вы знаете, как отличить карася от стандартного карпа? Отличить их довольно легко … Нужно просто найти усиков. Вернее, их отсутствие! А что такое усач, спросите вы? Ну, усач немного похож на усы. Обычный карп будет щеголять этой неприглядной «растительностью на лице», а карась значительно лучше ухожен! Я пытался отрастить усы, когда был моложе. Он никогда не вписывался совершенно правильно … В конце концов, все к лучшему, ведь усы намного лучше сочетаются с носом, чем с клювом! »

Галерея [править]

• Перекресток животных: Дикий мир

• Animal Crossing: City Folk

• Animal Crossing: City Folk
  (модель с визуализацией данных)

• Animal Crossing: New Leaf

• Animal Crossing: New Leaf
  (модель с визуализацией данных)

• Animal Crossing: New Horizons

Реальная информация [править]

Carassius carassius — рыба из семейства карповых.Обычно они есть в аквариумах, но есть и люди, которые их едят. Они связаны с Золотыми рыбками.

Имена на других языках [править]

Карась: характеристики, кормление и разведение

Карась — представитель семейства карповых Cyprinidae. Это широко распространенный европейский вид, ареал его обитания простирается от Англии до России.

Встречается до Северного полярного круга в скандинавских странах и на юге до центральной Франции и региона Черного моря.

Основная среда обитания карася — это тихоходные реки, озера и пруды.

Установлено, что эта рыба является аборигеном Англии, а не интродуцированным там видом. Подробнее об этом виде рыб читайте ниже.

Характеристика рыбы карась

Карась — рыба среднего размера с красивым и загадочным внешним видом. Это относительно короткие и коренастые существа. Их окраска сильно варьируется в зависимости от места обитания, как и у всех карпов, но имеет богатый золотистый цвет.

Они широко описаны как имеющие тело «золотисто-зеленого сияющего цвета». Молодь золотисто-бронзовая, с возрастом темнеет. С возрастом у них появляется темно-зеленая спина, глубокие бронзовые верхние бока и золото на нижних боках и брюхе, а также красноватые или оранжевые плавники.

Хотя у карася существуют и другие цветовые вариации. Одна из основных отличительных черт этой рыбы — выпукло-закругленный плавник.

Обычно средняя длина тела карася составляет около 15 см, и они редко весят более 3 кг.

Но максимальная зарегистрированная длина самца составляет 64 см, а самый тяжелый зарегистрированный вес — 3 кг. Фото и информация из Википедии.

Кормление

Карась, как и другие виды карповых рыб, очень агрессивны в питании. В их корм входит почти все, что обитает в пресной воде.

От пиявок до яиц улиток и от дафний до появляющихся насекомых — они съедят все это.

Разведение

Карась может нереститься в любое время, и он может нереститься дважды с начала мая до конца июля.Для размножения им требуется теплая вода и теплая погода.

Самцы обычно следят за самками, пока они не будут готовы выпустить яйца. После выпуска яиц на поросших сорняками краях ходульных вод, разбросанных по всей стране, происходит действительно нерестовый нерест.

Из-за размера яиц и температуры воды яйца вылупляются очень быстро всего за 6-10 дней.

использует

Карась в основном выращивается в пищу. Но их также иногда содержат как пресноводных аквариумных рыбок, а также в водных садах.

Особые примечания

Карась — очаровательная и загадочная рыба. Но он также считается одним из самых неприятных видов в Британии.

Сегодня его разводят в основном для еды, но его также можно содержать в качестве пресноводных аквариумных рыб. В некоторых районах его также выращивают для спортивной рыбалки.

Неторопливая или соревновательная ловля карася удочкой на удочку относится к категории грубой рыбалки в Великобритании. Тем не менее, просмотрите полный профиль породы этого вида рыб в таблице ниже.

900 33

Название	Карась
Королевство	Animalia
Тип	Chordata
Класс	Actinopterygii
Отряд	Cypriniformes
Род	Carassius
Виды	C. carassius
Биномиальное название	Carassius carassius
Другие названия	Отсутствуют
Порода Назначение	В основном корм для рыб , спортивная рыбалка
Особые примечания	Рыба меньшего размера, милая, загадочная, сегодня выращивается в основном для еды, также подходит для выращивания в качестве пресноводных аквариумных рыб, подходит для спортивной рыбалки
Метод разведения	Естественный и искусственный
Вес	Крупная рыба может достигать веса около 3 кг
Тип воды	Пресноводная
Климатическая устойчивость	Практически все климатические условия
Цвет тела	Золотисто-зеленый сияющий
Редкость	Обычный
Доступность	Во всем мире

Суп из китайского карася

Инструкции по приготовлению

СКРЫТЬ ИЗОБРАЖЕНИЯ ПОКАЗАТЬ ВСЕ ИЗОБРАЖЕНИЯ

Шаг 1

Нарежьте Филе карася (9 унций) на полоски 1/2 дюйма.

Шаг 2

Переложите рыбу в миску. Добавить Молотый имбирь (1/2 чайной ложки) . Отложите в сторону.

Шаг 3

В миску добавьте Кукурузный крахмал (3 столовые ложки) , Вода (1/2 стакана) и немного Солить по вкусу) .

Шаг 4

Добавьте рыбу и вотрите ее в смесь кукурузного крахмала. Дайте мариноваться 10 минут.

Шаг 5

Грубо нарезать Свежая кинза (4 стакана) .

ШАГ 6

Очистите и нарежьте Свежий имбирь (2 дюйма) на тонкие полоски.

Шаг 7.

В горшок добавить Вода (4 стакана) и нарезанный имбирь.Довести до кипения.

Шаг 8

Когда вода закипит, добавьте маринованную рыбу. Дать вариться 5 минут, затем добавить нарезанную кинзу. При желании можно добавить еще кинзы. Попробуйте и настройте Молотый белый перец (1/4 чайной ложки) .

Шаг 9

Переложите в миску и сразу подавайте.

Преимущества морфологии, вызванной хищниками, у карася

Adler FR, Harvell CD (1990) Индуцируемая защита, фенотипическая изменчивость и биотическая среда. Trends Ecol Evol 5: 407–410

Google Scholar

Appleton RD, Palmer AR (1988) Водные стимулы, выделяемые хищными крабами и поврежденной добычей, вызывают у морских брюхоногих моллюсков более устойчивые к хищникам раковины.Proc Natl Acad Sci USA 85: 4387–4391

Google Scholar

Beyerle GB, Williams JE (1968) Некоторые наблюдения за селективностью корма северной щукой в ​​аквариумах. Trans Am Fish Soc 97: 28–31

Google Scholar

Brönmark C, Miner JG (1992) Фенотипические изменения морфологии тела карася, вызванные хищниками. Наука 258: 1348–1350

Google Scholar

Brönmark C, Pettersson LB (1994) Химические сигналы рыбоядных животных вызывают изменение морфологии карася.Ойкос 70: 396–402

Google Scholar

Chesson J (1983) Оценка и анализ предпочтений и их связи с моделями кормодобывания. Экология 64: 1297–1304

Google Scholar

Dodson S (1989) Нормы реакции, вызванной хищниками. Bioscience 39: 447–452

Google Scholar

Гиллен А.Л., Стейн Р.А., Карлайн Р.Ф. (1981) Хищничество путем выращивания на гранулах мускусной мышцы тигра на гольянах и голубых жабрах в экспериментальных системах.Trans Am Fish Soc 110: 197–209

Google Scholar

Гримм М.А. (1994) Характеристики оптимальных местообитаний северной щуки ( Esox lucius L.). В: Cowx IG (ed) Восстановление пресноводного рыболовства. (Новые книги о рыбалке) Blackwell, Oxford, pp. 235–243

Google Scholar

Hambright KD (1991) Экспериментальный анализ выбора добычи большеротым окунем: роль ширины рта хищника и глубины тела жертвы.Trans Am Fish Soc 120: 500–508

Google Scholar

Hambright KD, Drenner RW, McComas SR, Hairston NG Jr (1991) Рыбоядные с ограниченным зевом, убежища размером с планктоядные и гипотеза трофического каскада. Arch Hydrobiol 121: 389–404

Google Scholar

Harper DG, Blake RW (1991) Захват добычи и быстродействие северной щуки Esox lucius .J Exp Biol 155: 175–192

Google Scholar

Харт П., Хамрин С.Ф. (1988) Щука как селективный хищник. Влияние размера добычи, наличия, укрытия и размеров щучьей челюсти. Ойкос 51: 220–226

Google Scholar

Harvell CD (1984) Защита морских мшанок, вызванная хищниками. Наука 224: 1357–1359

Google Scholar

Харвелл С.Д. (1986) Экология и эволюция индуцибельной защиты у морских мшанок: сигналы, затраты и последствия.Am Nat 128: 810–823

Google Scholar

Харвелл CD (1990) Экология и эволюция индуцибельной защиты. Q Rev Biol 65: 323–340

Google Scholar

Гавел Дж. Э., Додсон С. И. (1984) Chaoborus Хищничество на типичных и колючих морфах Daphnia pulex : наблюдения за поведением. Limnol Oceanogr 29: 487–489

Google Scholar

Holopainen IJ, Pitkänen AK (1985) Размер и структура популяции карася ( Carassius carassius (L.)) в двух небольших естественных прудах в восточной Финляндии. Энн Зул Фенн 22: 397–406

Google Scholar

Hoyle JA, Keast A (1986) Влияние морфологии и размера добычи на время обращения с рыбоядным, большеротым окунем ( Micropterus salmoides ). Кан Дж Зоол 65: 1972–1977

Google Scholar

Hoyle JA, Keast A (1987) Время обращения с добычей у двух рыбоядных, Esox americanus vermiculatus и Micropterus salmoides , с контрастной морфологией рта.Кан Дж Зоол 66: 540–542

Google Scholar

Kerfoot C, Sih A (eds) (1987) Хищничество: прямое и косвенное воздействие на водные сообщества. University Press of New England, Hanover, New Hampshire

Google Scholar

Крюгер Д.А., Додсон С.И. (1981) Эмбриологическая индукция и экология хищничества у Daphnia pulex . Лимнол Океаногр 26: 219–223

Google Scholar

Lelek A (1987) Пресноводные рыбы Европы.AULA, Висбаден

Google Scholar

Lively CM (1986a) Конкуренция, сравнительные истории жизни и поддержание диморфизма раковины у ракушек. Экология 67: 858–864

Google Scholar

Lively CM (1986b) Вызванный хищниками диморфизм панциря у желудь-ракушечника Chthalamus anisopoma . Эволюция 40: 232–242

Google Scholar

Магурран А.Е. (1990) Адаптивное значение стая в качестве защиты рыб от хищников.Энн Зул Фенн 27: 51–66

Google Scholar

Manly BJF (1974) Модель для определенных типов селекционных экспериментов. Биометрия 30: 281–294

Google Scholar

Moody RC, Helland JM, Stein RA (1983) Тактика побега, используемая синежаберцами и толстоголовыми гольянами, чтобы избежать хищничества со стороны тигрового мускуса. Environ Biol Fish 8: 61–65

Google Scholar

Палмер А.Р. (1985) Адаптивное значение вариации раковины у Thais lamellosa : влияние толстой раковины на уязвимость и предпочтение крабов.Велигер 27: 349–356

Google Scholar

Пийронен Дж., Холопайнен И. Дж. (1988) Структура длины и репродуктивный потенциал популяций карася ( Carassius carassius (L.)) в некоторых небольших лесных прудах. Энн Зул Фенн 25: 203–208

Google Scholar

Riessen HP (1992) Модель рентабельности для индукции защиты от хищников. Am Nat 140: 349–362

Google Scholar

Raat AJP (1988) Сводка биологических данных по северной щуке, Esox lucius Linnaeus, 1758.(Сводка рыболовства ФАО, том 30, часть 2), ФАО, Рим

Google Scholar

Тонн WM, Paszkowski CA (1986) Ограниченный по размеру хищник, зимняя добыча и организация скоплений рыб умбра — перка . Can J Fish Aquat Sci 43: 194–202

Google Scholar

Tonn WM, Paszkowski CA, Holopainen IJ (1989) Реакция популяций карася на дифференциальное давление хищников в управляемом пруду.Кан Дж Зоол 67: 2841–2849

Google Scholar

Тонн В.М., Пашковски К.А., Холопайнен И.Дж. (1991) Селективная добыча окуня: влияние размера хищника, размера жертвы и вида добычи. Verh Int Ver Limnol 24: 2406–2411

Google Scholar

Wahl DH, Stein RA (1988) Селективное хищничество со стороны трех эзоцидов: роль поведения и морфологии жертвы. Trans Am Fish Soc 117: 142–151

Google Scholar

Webb PW (1986) Влияние формы тела и порога реакции на уязвимость четырех видов костистых жертв, подвергшихся нападению большеротого окуня ( Micropterus salmoides ).Can J Fish Aquat Sci 43: 763–771

Google Scholar

Webb PW, Skadsen JM (1980) Ударная тактика Esox . Кан Дж Зоол 58: 1462–1469

Google Scholar

Weihs D (1973) Механизмы быстрого запуска стройных рыб. Биореология 10: 343–350

Google Scholar

Произошла ошибка при настройке пользовательского файла cookie

Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности.Если ваш браузер не принимает файлы cookie, вы не можете просматривать этот сайт.

---

Настройка вашего браузера для приема файлов cookie

Существует множество причин, по которым cookie не может быть установлен правильно. Ниже приведены наиболее частые причины:

• В вашем браузере отключены файлы cookie. Вам необходимо сбросить настройки вашего браузера, чтобы он принимал файлы cookie, или чтобы спросить вас, хотите ли вы принимать файлы cookie.
• Ваш браузер спрашивает вас, хотите ли вы принимать файлы cookie, и вы отказались.Чтобы принять файлы cookie с этого сайта, используйте кнопку «Назад» и примите файлы cookie.
• Ваш браузер не поддерживает файлы cookie. Если вы подозреваете это, попробуйте другой браузер.
• Дата на вашем компьютере в прошлом. Если часы вашего компьютера показывают дату до 1 января 1970 г., браузер автоматически забудет файл cookie. Чтобы исправить это, установите правильное время и дату на своем компьютере.
• Вы установили приложение, которое отслеживает или блокирует установку файлов cookie.Вы должны отключить приложение при входе в систему или проконсультироваться с системным администратором.

---

Почему этому сайту требуются файлы cookie?

Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности, запоминая, что вы вошли в систему, когда переходите со страницы на страницу. Чтобы предоставить доступ без файлов cookie потребует, чтобы сайт создавал новый сеанс для каждой посещаемой страницы, что замедляет работу системы до неприемлемого уровня.

---

Что сохраняется в файле cookie?

Этот сайт не хранит ничего, кроме автоматически сгенерированного идентификатора сеанса в cookie; никакая другая информация не фиксируется.

Как правило, в cookie-файлах может храниться только информация, которую вы предоставляете, или выбор, который вы делаете при посещении веб-сайта. Например, сайт не может определить ваше имя электронной почты, пока вы не введете его. Разрешение веб-сайту создавать файлы cookie не дает этому или любому другому сайту доступа к остальной части вашего компьютера, и только сайт, который создал файл cookie, может его прочитать.

БРИТАНСКИЙ РЕКОРД КРАСИЙ — ПОЛНАЯ ИСТОРИЯ | News

Карп-рыболов вписал свое имя в анналы истории рыболовства после того, как подсунул сеть под новый рекордный британский карась весом 4 фунта 11 унций.

Коренастый экземпляр, который побил предыдущий рекорд для этого вида всего на 1 унцию, упал на Крейга Смитсона во время 48-часового пребывания на озере синдиката Милтон Аббас в Дорсете.

Пытаясь заманить одного из обитателей озера, 39-летний мужчина выловил красную рыбную муку диаметром 15 мм рядом с грядкой с лилиями, на которую он наживил нарезанные 18-миллиметровые бойлы и гранулы.

К тому времени, когда рассвело в последнее утро его тренировки, Крейг мог показать только линь за свои усилия, но его состояние неожиданно изменилось в 9.30 часов утра, когда одна из его удочек подала сигнал о резком взятии.

«Шпулька танцевала вверх и вниз, поэтому я подумал, что это еще один линь», — рассказывает Крейг.

«Взяв удочку, я намотал до тех пор, пока не почувствовал сопротивление, затем начал тянуть рыбу к берегу. Он не выдержал особой борьбы, но когда я увидел золотые бока гигантского карася на опушке, а не ярко-зеленый линь, я просто смотрел на него в шоке, прежде чем началась паника.

«Я нацарапал вдоль берега, чтобы взять мою сеть, и как можно скорее подобрал ее.

«Когда я смотрел вниз, карась становился все больше и больше, и я постепенно осознавал масштабы того, что поймал».

Карась был почти 40 см в длину и 21 см в ширину.

Положив свой приз на полях, Крейг позвонил владельцу рыболовства Уэйну Литтлу, который бросился к берегу со своими весами.

К этому моменту три других члена синдиката также прибыли на место происшествия, чтобы засвидетельствовать взвешивание, измерение и фотографирование новых британских лучших.

«В конце концов, мы взвесили карася пять раз на трех наборах весов Reuben Heaton, и каждый зарегистрировал соответствующий вес в 4 фунта 11 унций», — добавляет Крейг.

«Я был в полном трепете и пытался впитать тот факт, что держал в руках историю рыболовства.

«Поймать что-то, что является самым большим в стране, по замыслу или нет, — на мой взгляд, высшее достижение в рыболовстве, поэтому я очень рад, что это случилось со мной».

Крейг подал претензию в Британский комитет по рекордным рыбам (BRFC), куда он уже отправил набор весов Рубена Хитона, используемых для взвешивания карася, чтобы их можно было проверить на точность.

Список имен свидетелей и их контактные данные, в дополнение к двум образцам чешуи, взятым у рыбы, также были предоставлены BRFC, чтобы помочь поддержать утверждение и доказать, что карась является истинной разновидностью, а не гибридом. .

«Если карась будет признан новым рекордом, то это фантастика, но если это не так, то это не будет концом света», — добавляет Крейг.

«Было просто фантастически увидеть эту рыбу во плоти».

Новаторский поимка Крейга станет шоком для некоторых, но не для владельца Милтона Аббаса Уэйна Литтла, который говорит, что появление на его восьмиакровом озере рекордного карася было лишь вопросом времени.

Он сказал:

«Около 20 лет назад мы зарыли, вероятно, 1500 карася, и, насколько я могу судить, осталось всего около 20–30, но сейчас они все размером с особь.

«В прошлом сезоне озеро произвело рыбу весом 3 фунта 15 унций и 4 фунта для одного из наших членов, а два года назад карась, который выглядел намного больше, чем рыба Крейга, был обнаружен в обычной сети — так что я знал, что нам не придется ждать хочу увидеть действительно особенное на берегу. Я восполнен для Крейга.»

© Милтон Аббас теперь является домом для записи карася.

Анализ транскриптома карася (Carassius auratus), важного аквакультуры и устойчивых к гипоксии видов

Цитата: Liao X, Cheng L, Xu P, Lu G , Wachholtz M, Sun X и др. (2013) Анализ транскриптома карася ( Carassius auratus ), важного вида аквакультуры и устойчивых к гипоксии видов. PLoS ONE 8 (4): e62308. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0062308

Редактор: Марк Робинсон-Рехави, Лозаннский университет, Швейцария

Поступила: 15 ноября 2012 г .; Принята к печати: 19 марта 2013 г .; Опубликовано: 22 апреля 2013 г.

Авторские права: © 2013 Liao et al. Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License, которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе при условии указания автора и источника.

Финансирование: Финансирование было предоставлено за счет грантов Специального фонда сельскохозяйственных научных исследований в интересах общества (2005) и Национальной программы фундаментальных исследований Китая (2010CB126303). Финансирующие организации не играли никакой роли в дизайне исследования, сборе и анализе данных, принятии решения о публикации или подготовке рукописи.

Конкурирующие интересы: Авторы заявили об отсутствии конкурирующих интересов.

Введение

Карась ( Carassius auratus ), принадлежащий к семейству Cyprinidae (Telestei), широко распространен на Евразийском континенте [1].Карась популярен как пищевая рыба в Китае и других странах. Благодаря хорошему вкусу, быстрому росту и пригодности для моно- и поликультуры в прудах, карась является одной из самых интенсивно культивируемых пресноводных рыб в мире: по статистическим данным ФАО, производство рыбы в 2010 году достигло 2,2 миллиона тонн [2] . Культура карася зародилась очень давно в Китае, и Китай до сих пор остается крупнейшей страной-производителем карася в мире. К настоящему времени в Китае было выведено несколько разновидностей карася, основанного на его уникальных репродуктивных характеристиках (например,g., гиногенез) [3] — [5].

Карась в дикой природе имеет три различных типа плоидности, включая диплоидный, триплоидный и тетраплоидный, каждый из которых имеет свой репродуктивный режим [6]. Диплоидный карась производит двуполое диплоидное потомство путем двуполого размножения; тетраплоидные дают потомство полностью женского пола посредством гиногенеза. Интересно, что у триплоидного карася существуют двойные репродуктивные режимы. Однополый гиногенез за счет активации гетерогенных сперматозоидов дает потомство полностью женского пола, тогда как при бисексуальном размножении образуются бисексуальные триплоидные потомства [5] — [6].Происхождение полиплоидии и поддержание генетического разнообразия до конца не изучены. Карась считался потенциальной моделью для изучения эволюционной биологии развития (Evo-Devo) [5].

Еще одно интересное явление, характерное для карася, заключается в том, что он может выдерживать месяцы аноксии при низких температурах в зимнее время. Из-за этого уникального характера он считается одной из наиболее устойчивых к гипоксии рыб [7], [8]. Механизмы толерантности к гипоксии у карася, хотя и не полностью изучены, включают большие запасы гликогена, анаэробный гликолиз и поддержание поступления аденозинтрифосфата (АТФ) и резкое снижение метаболизма [8].Кроме того, чтобы избежать лактоацидоза во время анаэробного гликолиза, карась способен превращать лактат в этанол в качестве основного конечного анаэробного продукта, который впоследствии выводится через жабры [8] — [9].

Эти особые характеристики карася позволяют предположить, что это не только важный вид для аквакультуры, но и потенциальный модельный организм для изучения молекулярных механизмов эволюции генома и физиологической адаптации (например, выживания при бескислородной токсичности). Действительно, ранее было доступно очень мало геномных и транскриптомных ресурсов этого вида.На данный момент в NCBI GenBank депонировано только около 2300 EST и 2200 белковых последовательностей. Отсутствие богатых генетических ресурсов препятствует не только молекулярному разведению карася, но и дальнейшим исследованиям механизмов конкретных биологических процессов. К счастью, разработка высокопроизводительных технологий секвенирования следующего поколения (NGS) предоставила экономичный и эффективный по времени инструмент для создания как геномных, так и транскриптомных ресурсов [10] — [11]. Имеется несколько отчетов о транскриптомном анализе видов, тесно связанных с карасями, с использованием метода NGS, которые стимулировали генетические и геномные исследования видов карповых [12] — [15].Однако эти исследования включали транскриптомное секвенирование объединенных тканей, которое не могло выявить тканеспецифические профили экспрессии генов. Экспрессия генов зависит от контекста, что означает, что профиль экспрессии генов зависит от ткани. Понимание тканеспецифической экспрессии генов может помочь прояснить молекулярные механизмы развития и функционирования тканей в организме [16] — [17]. В настоящем исследовании мы использовали платформу Roche 454 GS FLX для секвенирования транскриптома карасей четырех тканей и провели анализ дифференциальной экспрессии генов среди тканей.Это первый отчет по характеристике транскриптома карася, который обеспечивает ценный геномный ресурс для селективного разведения и функциональных или эволюционных исследований генов, связанных с толерантностью к гипоксии.

Материалы и методы

Заявление об этике

Это исследование было одобрено Комитетом по уходу за животными и их использованию Китайской академии рыбных наук.

Образцы, измерение содержания ДНК и сбор тканей

В общей сложности 14 образцов карася (50–100 г) были собраны на рыбоперерабатывающем предприятии в Хэйлунцзянском научно-исследовательском институте рыболовства Китайской академии рыбных наук.Чтобы определить типы плоидности в образцах рыб, содержание ДНК измеряли на проточном цитометре Cell Lab Quanta SC (Beckman Coulter, Бреа, Калифорния, США). Эритроциты собирали из хвостовой вены шприцами, содержащими гепарин натрия. Образцы крови ресуспендировали в окрашивающем растворе Nuclear Isolation Media (NIM) -DAPI (NIM-DAPI, NPE Systems, Pembroke Pines, FL, USA) в течение 10-15 минут, а затем фильтровали. Содержание ДНК цветного карася, подтвержденное как диплоид, использовалось в качестве эталона.По содержанию ДНК для сбора тканей мы выбрали только диплоидного карася. Чтобы получить профили тканеспецифической экспрессии генов и маркеры однонуклеотидного полиморфизма (SNP), мы собрали четыре ткани (мозг, мышцы, печень и почки), и каждая смесь тканей содержала шесть образцов рыб с аналогичными количествами. Образцы ткани хранили в реагенте RNAlater (Qiagen, Hilden, Германия) при -20 ° C перед выделением РНК.

Выделение РНК, конструирование библиотек кДНК и секвенирование 454

Суммарную РНК из четырех тканей экстрагировали отдельно с использованием реагента TRIzol (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA).Тотальную РНК выделяли в соответствии с протоколом производителя, а затем обрабатывали ДНКазой I, не содержащей РНКаз (New England Biolabs) при 37 ° C в течение 30 минут, чтобы удалить потенциальную ДНК. После этого РНК суспендировали в воде, свободной от РНКазы, для синтеза кДНК. кДНК синтезировали с использованием 2 мкг общей РНК с использованием набора для синтеза кДНК SMART (Clontech Laboratories, Inc., Маунтин-Вью, Калифорния, США). Перед синтезом кДНК количество и качество РНК проверяли с помощью гель-электрофореза и биоанализатора (Agilent). Четыре библиотеки кДНК, представляющие четыре ткани, были сконструированы с использованием набора GS FLX Titanium General Library Preparation Kit (Roche, Branford, CT, USA).Для увеличения вероятности редкого транскрипта полученные библиотеки кДНК нормализовали с помощью дуплекс-специфической нуклеазы (DSN) (Евроген, Россия). Каждый полный планшет для секвенирования был разделен на две части, по одной для каждой библиотеки; Всего было проведено два цикла секвенирования по 454 (планшеты) для четырех библиотек на геномном секвенаторе Roche 454 GS FLX Titanium в Shanghai OE Biotech Company.

Обработка данных последовательности и

de novo Assembly

Для каждого необработанного считывания низкокачественные основания и адаптер секвенирования были обрезаны с помощью SeqClean [18] и LUCY [19].Очищенные чтения со 100 парами оснований (bp) или более из четырех библиотек были собраны с использованием Newbler 2.5.3 с параметрами по умолчанию. Полученные консенсусные последовательности изотиг и оставшиеся синглтоны затем рассматривались как унигены для следующих анализов. Необработанные чтения были депонированы в базу данных NCBI Short Read Archive (SRA) (номер доступа: SRA057034).

Аннотация

Унигены сравнивали с неизбыточными (nr) белковыми последовательностями в базе данных Swiss-Prot с использованием BLASTX [20] со значениями отсечения E-значений 1e-3 и сходством последовательностей ≥30%.Имя гена было присвоено каждому унигену в соответствии с наивысшим совпадением BLASTX с наивысшим баллом выравнивания среди совпадений взрыва. Пакет Blast 2GO [21] использовался для аннотирования унигенов трех основных категорий ГО: биологических процессов, молекулярных функций и клеточных компонентов. Анализ метаболических путей проводили с использованием Киотской энциклопедии генов и геномов (KEGG) (http://www.genome.jp/kegg/). Ввиду важности гликолиза для толерантности карася к кислороду мы сосредоточили внимание на пути гликолиза / глюконеогенеза и проанализировали профиль экспрессии родственных генов (ферментов) в четырех тканях.Чтобы охарактеризовать унигены в полноразмерную кДНК, 5’UTR + экзон (ы), экзон (ы) + 3’UTR или экзон (ы), мы сравнили унигеновые последовательности карася со всеми известными последовательностями генов рыбок данио ( Danio rerio ) (загружен из базы данных Ensembl) с использованием BLASTn с пороговым значением E-value , равным 1e-10.

Сравнительный транскриптомный анализ карася и других видов рыб

Теперь представлены целые последовательности для восьми видов костистых рыб, включая рыбок данио, фугу ( Takifugu rubripes ), медака (Oryzias latipes ), колючку ( Gasterosteus aculeatus ), треску ( Gadus morh10umlacnaeria), ), тетраодон ( Tetraodon nigroviridis ) и тилапия ( Oreochromis niloticus ), доступны в базе данных Ensembl.Мы загрузили все белковые последовательности восьми видов из Ensembl, а затем провели сравнительный транскриптомный анализ между карасем и этими видами рыб, используя tBLASTx при E-value <1e-10.

Анализ экспрессии

Считывания из четырех тканей были сопоставлены с каждой соответствующей последовательностью изотиг. Уровень экспрессии рассчитывали, используя количество выровненных считываний для каждого изотига (униген). Различно экспрессируемые гены между тканями были идентифицированы с использованием точного теста Фишера с P-значением <0.0001.

Микросателлит и маркеры SNP Discovery

Программа MISA [22] (http://pgrc.ipk-gatersleben.de/misa/) была использована для обнаружения микросателлитных последовательностей из унигеновых последовательностей. Пять типов микросателлитов были идентифицированы с критериями от ди- до гексануклеотидных мотивов, и минимальная повторяющаяся единица была определена как 6 для ди- и 5 повторов для три-, тетра-, пента- и гексануклеотидов. Последовательности, состоящие из двух или более повторяющихся единиц с мотивами, разделенными> 100 п.н., считались двумя или более микросателлитами.Для конструирования будущих праймеров были собраны только микросателлитные последовательности с фланкирующими последовательностями ≥50 п.н. с обеих сторон. Мы использовали QualitySNP [23] (http://www.bioinformatics.nl/tools/snpweb/) для определения потенциальных SNP из изотиг, содержащих не менее 10 чтений. Выявлены только те SNP с частотой минорного аллеля не менее 20%. Индели не были включены в анализ SNP.

Результаты и обсуждение

Определение типов плоидности

Карась разной плоидности, обитающие в естественных водах, трудно различить по фенотипическим признакам.Таким образом, мы использовали экономящий время и точный метод проточной цитометрии для определения типов плоидности [6], [24]. Содержание ДНК в 14 образцах карася было измерено в диапазоне от 117 до 269 на основе относительной интенсивности флуоресценции, тогда как ДНК Содержание образца цветного карася составляет 204 ( Рисунок 1 ). Таким образом, в соответствии со значением диплоидной окраски карася, шесть образцов карася с содержанием ДНК от 190 до 208 были признаны диплоидами и отобраны для сбора тканей для дальнейшего выделения общей РНК.

454 Секвенирование и сборка

Мы сконструировали четыре библиотеки кДНК и впоследствии получили четыре набора транскриптомных считываний для мозга, мышц, печени и почек карася соответственно. Конвейер анализа показан на рис. 2 , который начинается с секвенирования 454, за которым следуют предварительная обработка и сборка, и заканчивается функциональной аннотацией и поиском генетических маркеров.

Всего секвенирование Roche 454 дало 2620642 необработанных считывания с общим объемом 768 110 170 пар оснований (768 Мбит / с), что в среднем дает 293 пар оснований на считывание.Ткань печени была обнаружена с наибольшим количеством необработанных считываний (700 677), тогда как ткань почек была обнаружена с самой длинной средней длиной на считывание (321 п.н.). Ткань мозга была обнаружена с наименьшим количеством необработанных считываний (604 576) и самой короткой средней длиной на считывание (256 п.н.) ( Таблица 1 ). После предварительной обработки с помощью SeqClean и LUCY мы получили около 2,3 миллиона усеченных чтений с ∼700 Мбит / с, что в среднем дает 293 п.н. на чтение. Для тканей мозга, мышц, печени и почек было сгенерировано 554 231, 484 255, 662 301 и 648 158 усеченных считываний со средней длиной 259, 312, 330 и 320 п.н., соответственно (Таблица 1).

Сборка очищенных считываний из четырех объединенных тканей дала 127 711 унигеновых последовательностей, включая 84 867 изотигов и 42 844 синглетонов ( Таблица 2 ). Средняя глубина этих изотиг составила 27,3. Средняя длина изотиг составила около 493 п.н., а N50 — 547 п.н. (, таблица 2, ). Большинство (80,49%) этих изотиг распределялось в области 250–1250 п.н., но было 3935 изотигов (4,64%) с длиной более 1250 п.н. В то время как большинство синглтонов распределялось в области 100–450 п.н., было получено только 622 синглетона длиной более 450 п.о. ( Рисунок 3 ).Анализ распределения унигена в четырех тканях дал 21 489 (50,16%), 5 745 (13,41%), 5 841 (13,63%) и 9769 (22,80%) синглтонов и 67 989 (80,11%), 36 692 (43,23%), 30 710 (36,19). %) и 52 132 (61,43%) изотигов в головном мозге, мышцах, печени и почках соответственно (, таблица 3, ). В мозге и почках было обнаружено больше унигенов, чем в мышцах и печени. В этом исследовании мРНК, полученная из общей РНК из нескольких тканей шести образцов с помощью ОТ-ПЦР, была секвенирована, и, таким образом, полученные данные транскриптома являются более полными по сравнению с секвенированием одной ткани или одного образца.

Поиск с помощью BLASTn уникальных генов карася против всех полноразмерных последовательностей кДНК рыбок данио, загруженных из базы данных Ensembl, показал, что 12 387 унигенных последовательностей карася были разделены на четыре категории: 613 полноразмерных последовательностей кДНК (включая 140 возможных), 2746 экзонов. + 3’UTR последовательности, 4, 320 последовательностей 5’UTR + экзонов и 6708 последовательностей экзонов (, фиг.4, ). Полноразмерные последовательности кДНК имеют полные последовательности транскриптов, включая кодирующие области (CDS) или все экзоны и нетранслируемые области (UTR), и, таким образом, облегчают последующие исследования геномной структуры и функционального анализа [25].Это длительный и трудоемкий процесс с использованием традиционного метода секвенирования по Сэнгеру для получения больших коллекций полноразмерных кДНК. К счастью, метод NGS, использованный в этом исследовании и других исследованиях, показал себя эффективным подходом для получения большого количества полноразмерных кДНК [26] — [27]. Кроме того, более 7000 унигенов с 5′- или 3′-UTR также можно использовать для получения полноразмерных последовательностей кДНК с помощью метода прогулки праймеров. Полноразмерные последовательности кДНК карася будут предоставлены по запросу.

Аннотация

Из 127 711 собранных унигеновых последовательностей 22 273 (17,44% всех унигенов; включая 16 331 изотиг и 5 942 синглетонов) имели по крайней мере одно значимое совпадение, соответствующее 14 449 уникальным образцам белков в базе данных Swiss-Prot ( Таблица S1 ). Было обнаружено, что значительный процент последовательностей (82,56%) не имеет значимого совпадения с известными последовательностями белков. Низкий процент совпадающих последовательностей может быть из-за слишком большого количества коротких считываний, полученных в результате секвенирования.Известно, что значимость сравнения BLAST частично зависит от длины запрашиваемых последовательностей [28]. В этом исследовании около четверти унигеновых последовательностей были не очень длинными (25,69% ≤250 п.н.), что могло быть слишком короткий, чтобы найти статистически значимые совпадения. Большое количество унигенов можно отнести к четырем тканям, секвенированным в нашем исследовании. Однако также возможно, что карась может иметь более уникальные гены по сравнению с другими видами.

Анализ GO аннотированных унигенов показал, что 14 398 (64.64%) были назначены хотя бы на один срок GO, всего 84 876 назначений GO. Для молекулярных функций наиболее представленной категорией была каталитическая активность (GO: 0003824), за которой следовали связывание (GO: 0005488), активность молекулярного преобразователя (GO: 0060089) и активность переносчика (GO: 0005215). Для клеточного компонента наиболее часто встречались термины GO: клетка (GO: 0005623), макромолекулярный комплекс (GO: 0032991), органелла (GO: 0043226), часть клетки (GO: 0044464) и часть органеллы (GO: 0044422). Что касается биологических процессов, гены, участвующие в клеточном процессе (GO: 0009987) и метаболическом процессе (GO: 0008152), ответе на стимул (GO: 0050896), биологической регуляции (GO: 0065007) и локализации (GO: 0051179) были широко представлены ( Рисунок 5 ).

Кроме того, анализ пути KEGG обнаружил 6 382 унигена, участвующих в 237 предсказанных метаболических путях KEGG, которые были разделены на различные функциональные группы (, таблица 4, ). Число унигенов в предсказанном пути варьировало от 1 до 704 (, таблица S2 ). Самая большая функциональная группа — это системы организма (1853, 29,03%), которые включают иммунную систему (577), нервную систему (432), эндокринную систему (280) и пищеварительную систему (187). Unigenes, сгруппированные в метаболизм, составили 1680 (26.32%), включая метаболизм углеводов (346), метаболизм липидов (255) и метаболизм аминокислот (252 последовательности) и т. Д. Группы по клеточным процессам, обработке генетической информации и обработке экологической информации составили 1008 (15,79%), 1 007 (15,78%) ) и 834 (13,04%) унигена соответственно.

C Сравнительный транскриптомный анализ карася и других видов рыб

Унигенные последовательности транскриптома карася сравнивали с белками Refseq восьми видов костистых животных с использованием tBLASTx при E-value <1e-10.Это привело к появлению 10 994, 8 465, 8 546, 8 830, 8 519, 7 907, 8 398 и 9 188 унигенов со значительным сходством с генами рыбок данио, фугу, медака, колюшки, трески, латимерии, тетраодона и тилапии соответственно. Среди них было 237, 99, 98, 106, 90, 69, 92 и 109 унигенов, соответствующих E-value = 0. Карась показал наибольшее сходство с рыбками данио на уровне экспрессии генов, что можно объяснить карасем. карп и данио, принадлежащие к одному семейству Cyprinidae. Целакант — близкий родственник последнего общего предка рыб и четвероногих [29]; Карась имел наименьшее сходство с латимерией (, таблица 5, ).Обнаружено умеренное транскриптомное сходство карася с другими костистыми карасями.

Дифференциальный анализ профилей экспрессии генов в тканях

Анализ дифференциальной экспрессии унигенов (изотигов) продемонстрировал, что для большинства генов не было обнаружено значительных различий между тканями, при этом количество унигенов варьировалось от 36 156 до 55 461 ( Рисунок 6, ). Напротив, количество генов с повышенной и отрицательной регуляцией варьировалось от 6210 (мозг против печени) до 9 237 (мозг против почек).Полный транскриптомный анализ показал, что больше генов активируется в мышцах и больше генов подавляется в печени по сравнению с генами, экспрессируемыми в других тканях. Это можно интерпретировать, наблюдая, что мышцы и печень являются важнейшими органами, соответственно, для роста и адаптации к окружающей среде. Кроме того, дифференциальные гены, обнаруженные в нашем исследовании, могут быть использованы в качестве потенциальных молекулярных маркеров для отбора и разведения карася с целью улучшения продукции аквакультуры. Однако требуется дальнейшее подтверждение роли этих генов с использованием других более чувствительных методов, таких как ПЦР в реальном времени и более сфокусированный анализ путей (см. Следующий раздел).Информация об унигенах (изотигах) и соответствующем количестве считываний подробно описана в Таблице S3 .

Анализ путей гликолиза / глюконеогенеза

Карась осенью начинает накапливать большое количество гликогена в печени и мышцах. Накопленный гликоген может потребляться за счет анаэробного гликолиза в течение месяцев, чтобы поддерживать уровень АТФ на высоком уровне, что позволяет карасям выжить в условиях гипоксии зимой [30]. Чтобы получить более полное представление о молекулярном механизме толерантности к гипоксии у карася, гликолиз KEGG / Путь глюконеогенеза (MAP00010) был заселен унигенами, идентифицированными в этом исследовании.С Blast2GO было обнаружено, что 43 унигена, которые картировались с 20 ферментными генами, были связаны с этим путем. Чтобы выяснить, можно ли найти больше унигенов в изотигах или синглетонах карася, мы загрузили из базы данных Ensembl все транскрипты генов рыбок данио, участвующих в пути гликолиза / глюконеогенеза, и опросили их по транскриптому карася, используя Blastn с E-value <1e-10. После ручного отбора совпадений мы идентифицировали 168 уникальных генов, связанных с этим путем, которые кодируют 23 фермента (розовые прямоугольники, , рис. 7, ).Три дополнительных фермента, фосфоенолпируваткарбоксикиназа 2 [EC: 4.1.1.49], ацил-CoA синтетаза [EC: 6.2.1.13] и бисфосфоглицератмутаза [EC: 5.4.2.4]) были идентифицированы только вышеуказанным методом. Экспрессия вышеуказанных ферментов варьирует в разных тканях (, таблица 6, ). Высокоэкспрессируемыми ферментами были фосфоглицераткиназа [EC: 2.7.2.3], фосфоглицератмутаза [EC: 5.4.2.1], фосфоенолпируваткарбоксикиназа 2 [EC: 4.1.1.49], а такие ферменты, как ацил-КоА-синтетаза [EC: 6.2.1.13] и бисфосфоглицератмутаза [EC: 5.4.2.4] были наименее экспрессированы (, таблица 6, ). Как показано в Таблице 7, в мышцах было обнаружено больше транскриптов, особенно для фосфоенолпируваткарбоксикиназы 1 [EC: 4.1.1.32], фосфоенолпируваткарбоксикиназы 2 [EC: 4.1.1.49] и пируватдегидрогеназы [EC: 1.2.4.1]. Предыдущее исследование, проведенное на трех видах рыб, показало, что гликолитические ферменты были обнаружены во всех тканях, но больше в мышцах, чем в других тканях [31], что согласуется с результатами настоящего исследования.По сравнению с другими бескислородными животными, такими как лягушка ( Rana pipiens ), черепаха ( Chrysemys picta ) и акула ( Hemiscyllium ocellatum ), карась реагирует схожим образом на отсутствие кислорода, например, выраженное подавление обмена веществ и толерантность. ионного нарушения, но может поддерживать активные и ответные функции в отсутствие кислорода [10], [32] — [33]. Кроме того, чтобы избежать самоотравления молочными продуктами во время гликолиза, карась обладает особой способностью производить этанол и выделять его в воду через жабры [9].Гипоксия может быть важной движущей силой эволюции, приводящей как к конвергентным, так и к дивергентным физиологическим стратегиям выживания при гипоксии [33]. В этом исследовании мы исследовали гены, участвующие в гликолизе и глюконеогенезе у карася, сравнительный анализ этих генов у устойчивых к гипоксии животных, а также изучение других важных генов, таких как фактор транскрипции, индуцируемый гипоксией (HIF) [33] — [34] ] может дать ключ к разгадке молекулярной адаптации, связанной с толерантностью к гипоксии.

Рисунок 7. Карта гликолиза / глюконеогенеза KEGG, заполненная транскриптами, кодирующими соответствующие ферменты.

Идентифицированные ферменты показаны в красных прямоугольниках, а их количество транскриптов в различных тканях показано в таблице .

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0062308.g007

Разработка молекулярных маркеров на основе транскриптома

Карась — важная рыба в аквакультуре. Ожидается, что молекулярная селекция, такая как селекция с помощью маркеров (MAS), будет иметь большой потенциал для увеличения производства аквакультуры [35].Кроме того, молекулярные маркеры необходимы для исследований популяционной генетики, биогеографии и эволюции [3], [4], [24], [36]. Однако только несколько микросателлитных маркеров (или Simple Sequence Repeat, SSR) доступны у карася [37] — [39]. Транскриптомные последовательности, полученные с помощью NGS, стали отличным источником для поиска и разработки полученных из транскриптомов (или генов). ассоциированные) молекулярные маркеры [10], [13] — [15], [28]. Всего было идентифицировано 11 295 микросателлитов из 10 203 унигеновых последовательностей ( Таблица 7 ).Наиболее частым повторяющимся мотивом был динуклеотидный повтор (8406), на долю которого приходилось 74,44% всех микросателлитов, за которым следовали три- (2032, 17,99%), тетра- (760, 6,73%), пента- (87, 0,77%). , и гексануклеотидные повторы (10, 0,09%). Что касается будущего использования этих маркеров, было обнаружено, что 5364 уникальных последовательности с микросателлитами имеют достаточное количество фланкирующих последовательностей (≥50 п.н.) с обеих сторон для дизайна праймера (, таблица 7, ). При строгих мерах с использованием QualitySNP и без учета отступов было выявлено 5 784 предполагаемых высококачественных SNP, включая 4 004 перехода и 1 780 трансверсий ( Рисунок 8, ).Согласно строгим мерам оценки качества SNP, предложенным Wang et al. [40], SNP, содержащиеся в контигах, содержащих по крайней мере четыре EST, и минорная аллельная последовательность, встречающаяся по крайней мере дважды, были надежными для генотипирования. В настоящем исследовании все предсказанные SNP были идентифицированы из изотигов, охваченных по крайней мере 10 чтениями с частотой минорных аллелей не менее 20%, что позволяет предположить, что SNP, идентифицированные в настоящем исследовании, с большей вероятностью были аутентичными. Таким образом, эти предполагаемые SNP могут быть использованы в качестве приоритетных кандидатов для дальнейших исследований ассоциации генетика-среда или генотип-фенотип у карася.

Выводы

Мы выполнили de novo транскриптомного секвенирования тканей мозга, мышц, печени и почек карася (каждая с шестью образцами), получили 127 711 унигеновых последовательностей и проанализировали их категории и пути генной онтологии. Анализ дифференциальной экспрессии генов выявил больше генов, экспрессируемых в головном мозге, активируемых в мышцах и подавляемых в печени, по сравнению с генами, экспрессируемыми в других тканях. Важно отметить, что мы идентифицировали 11 295 микросателлитных и 5784 маркеров SNP для молекулярной селекции и разведения карася.Транскриптом карася, полученный в этом исследовании, является ценным ресурсом для аквакультуры и фундаментальных исследований, таких как эволюция генома (например, полиплоидизация) и физиологическая адаптация (например, толерантность к гипоксии).